Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defa3P28310 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa3P28310 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa3P28310 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Defa3P28310 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Defa3P28310 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Defa3P28310 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa3P28310 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa3P28310 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa3P28310 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa3P28310 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa3P28310 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defa3P28310 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defa3P28310 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa3P28310 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Defa3P28310 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa3P28310 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Defa3P28310 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Defa3P28310 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Defa3P28310 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Defa3P28310 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Defa3P28310 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Defa3P28310 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Defa3P28310 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Defa3P28310 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Defa3P28310 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Defa3P28310 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Defa3P28310 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Defa3P28310 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Defa3P28310 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Defa3P28310 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa3P28310 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa3P28310 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa3P28310 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa3P28310 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Defa3P28310 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa3P28310 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa3P28310 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa3P28310 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa3P28310 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa3P28310 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa3P28310 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Defa3P28310 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Defa3P28310 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa3P28310 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa3P28310 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa3P28310 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Defa3P28310 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Defa3P28310 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Defa3P28310 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Defa3P28310 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Defa3P28310 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Defa3P28310 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Defa3P28310 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Defa3P28310 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Defa3P28310 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Defa3P28310 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Defa3P28310 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Defa3P28310 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Defa3P28310 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Defa3P28310 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Defa3P28310 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Defa3P28310 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Defa3P28310 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Defa3P28310 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Defa3P28310 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Defa3P28310 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Defa3P28310 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Defa3P28310 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Defa3P28310 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Defa3P28310 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Defa3P28310 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Defa3P28310 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Defa3P28310 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Defa3P28310 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Defa3P28310 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Defa3P28310 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Defa3P28310 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Defa3P28310 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Defa3P28310 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Defa3P28310 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Defa3P28310 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa3P28310 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Defa3P28310 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa3P28310 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa3P28310 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa3P28310 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa3P28310 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa3P28310 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa3P28310 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Defa3P28310 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Defa3P28310 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa3P28310 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Defa3P28310 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Defa3P28310 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Defa3P28310 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Defa3P28310 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Defa3P28310 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa3P28310 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa3P28310 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms