Protein–RNA interactions for Protein: Q923D3

Parm1, Prostate androgen-regulated mucin-like protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parm1Q923D3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Parm1Q923D3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Parm1Q923D3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Parm1Q923D3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Parm1Q923D3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Parm1Q923D3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Parm1Q923D3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Parm1Q923D3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Parm1Q923D3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Parm1Q923D3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Parm1Q923D3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Parm1Q923D3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Parm1Q923D3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Parm1Q923D3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Parm1Q923D3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Parm1Q923D3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Parm1Q923D3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Parm1Q923D3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Parm1Q923D3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Parm1Q923D3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Parm1Q923D3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Parm1Q923D3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Parm1Q923D3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Parm1Q923D3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Parm1Q923D3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Parm1Q923D3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Parm1Q923D3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Parm1Q923D3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Parm1Q923D3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Parm1Q923D3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Parm1Q923D3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Parm1Q923D3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parm1Q923D3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parm1Q923D3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Parm1Q923D3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Parm1Q923D3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Parm1Q923D3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Parm1Q923D3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Parm1Q923D3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Parm1Q923D3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Parm1Q923D3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Parm1Q923D3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Parm1Q923D3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Parm1Q923D3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Parm1Q923D3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Parm1Q923D3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Parm1Q923D3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Parm1Q923D3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Parm1Q923D3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Parm1Q923D3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Parm1Q923D3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Parm1Q923D3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Parm1Q923D3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Parm1Q923D3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Parm1Q923D3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Parm1Q923D3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Parm1Q923D3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Parm1Q923D3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Parm1Q923D3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parm1Q923D3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Parm1Q923D3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Parm1Q923D3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Parm1Q923D3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Parm1Q923D3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Parm1Q923D3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Parm1Q923D3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Parm1Q923D3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Parm1Q923D3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Parm1Q923D3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Parm1Q923D3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Parm1Q923D3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Parm1Q923D3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Parm1Q923D3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Parm1Q923D3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Parm1Q923D3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Parm1Q923D3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Parm1Q923D3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Parm1Q923D3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Parm1Q923D3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Parm1Q923D3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Parm1Q923D3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Parm1Q923D3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parm1Q923D3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Parm1Q923D3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parm1Q923D3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Parm1Q923D3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parm1Q923D3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Parm1Q923D3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Parm1Q923D3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Parm1Q923D3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Parm1Q923D3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Parm1Q923D3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Parm1Q923D3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Parm1Q923D3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Parm1Q923D3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Parm1Q923D3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Parm1Q923D3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Parm1Q923D3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Parm1Q923D3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Parm1Q923D3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms