Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sigmar1O55242 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sigmar1O55242 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sigmar1O55242 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sigmar1O55242 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sigmar1O55242 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sigmar1O55242 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sigmar1O55242 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sigmar1O55242 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sigmar1O55242 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sigmar1O55242 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sigmar1O55242 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sigmar1O55242 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sigmar1O55242 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sigmar1O55242 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sigmar1O55242 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sigmar1O55242 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sigmar1O55242 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sigmar1O55242 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sigmar1O55242 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sigmar1O55242 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sigmar1O55242 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sigmar1O55242 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sigmar1O55242 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sigmar1O55242 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sigmar1O55242 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sigmar1O55242 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sigmar1O55242 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sigmar1O55242 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sigmar1O55242 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sigmar1O55242 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sigmar1O55242 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sigmar1O55242 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sigmar1O55242 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sigmar1O55242 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sigmar1O55242 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sigmar1O55242 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sigmar1O55242 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sigmar1O55242 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sigmar1O55242 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sigmar1O55242 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sigmar1O55242 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sigmar1O55242 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sigmar1O55242 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sigmar1O55242 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sigmar1O55242 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sigmar1O55242 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sigmar1O55242 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sigmar1O55242 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sigmar1O55242 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sigmar1O55242 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sigmar1O55242 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sigmar1O55242 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sigmar1O55242 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sigmar1O55242 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sigmar1O55242 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sigmar1O55242 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sigmar1O55242 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sigmar1O55242 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sigmar1O55242 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sigmar1O55242 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sigmar1O55242 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sigmar1O55242 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sigmar1O55242 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sigmar1O55242 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sigmar1O55242 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sigmar1O55242 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sigmar1O55242 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sigmar1O55242 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sigmar1O55242 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sigmar1O55242 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sigmar1O55242 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sigmar1O55242 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sigmar1O55242 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sigmar1O55242 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sigmar1O55242 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sigmar1O55242 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sigmar1O55242 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sigmar1O55242 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sigmar1O55242 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sigmar1O55242 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sigmar1O55242 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sigmar1O55242 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sigmar1O55242 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sigmar1O55242 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sigmar1O55242 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sigmar1O55242 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sigmar1O55242 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sigmar1O55242 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sigmar1O55242 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sigmar1O55242 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sigmar1O55242 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sigmar1O55242 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sigmar1O55242 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sigmar1O55242 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sigmar1O55242 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sigmar1O55242 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sigmar1O55242 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sigmar1O55242 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sigmar1O55242 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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