Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5S6

Ighv3-1, Immunoglobulin heavy variable 3-1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Ighv3-1A0A075B5S6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ighv3-1A0A075B5S6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ighv3-1A0A075B5S6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ighv3-1A0A075B5S6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ighv3-1A0A075B5S6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ighv3-1A0A075B5S6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ighv3-1A0A075B5S6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ighv3-1A0A075B5S6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ighv3-1A0A075B5S6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ighv3-1A0A075B5S6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ighv3-1A0A075B5S6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ighv3-1A0A075B5S6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ighv3-1A0A075B5S6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ighv3-1A0A075B5S6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ighv3-1A0A075B5S6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ighv3-1A0A075B5S6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ighv3-1A0A075B5S6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ighv3-1A0A075B5S6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ighv3-1A0A075B5S6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ighv3-1A0A075B5S6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ighv3-1A0A075B5S6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ighv3-1A0A075B5S6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ighv3-1A0A075B5S6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ighv3-1A0A075B5S6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ighv3-1A0A075B5S6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighv3-1A0A075B5S6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ighv3-1A0A075B5S6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ighv3-1A0A075B5S6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ighv3-1A0A075B5S6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ighv3-1A0A075B5S6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ighv3-1A0A075B5S6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ighv3-1A0A075B5S6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ighv3-1A0A075B5S6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ighv3-1A0A075B5S6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ighv3-1A0A075B5S6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighv3-1A0A075B5S6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ighv3-1A0A075B5S6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ighv3-1A0A075B5S6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ighv3-1A0A075B5S6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ighv3-1A0A075B5S6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighv3-1A0A075B5S6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighv3-1A0A075B5S6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ighv3-1A0A075B5S6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ighv3-1A0A075B5S6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ighv3-1A0A075B5S6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ighv3-1A0A075B5S6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighv3-1A0A075B5S6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ighv3-1A0A075B5S6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighv3-1A0A075B5S6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighv3-1A0A075B5S6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ighv3-1A0A075B5S6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ighv3-1A0A075B5S6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ighv3-1A0A075B5S6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ighv3-1A0A075B5S6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ighv3-1A0A075B5S6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ighv3-1A0A075B5S6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ighv3-1A0A075B5S6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighv3-1A0A075B5S6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighv3-1A0A075B5S6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighv3-1A0A075B5S6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv3-1A0A075B5S6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighv3-1A0A075B5S6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighv3-1A0A075B5S6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ighv3-1A0A075B5S6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighv3-1A0A075B5S6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighv3-1A0A075B5S6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighv3-1A0A075B5S6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighv3-1A0A075B5S6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv3-1A0A075B5S6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighv3-1A0A075B5S6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighv3-1A0A075B5S6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv3-1A0A075B5S6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighv3-1A0A075B5S6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ighv3-1A0A075B5S6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighv3-1A0A075B5S6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighv3-1A0A075B5S6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighv3-1A0A075B5S6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighv3-1A0A075B5S6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighv3-1A0A075B5S6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ighv3-1A0A075B5S6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighv3-1A0A075B5S6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighv3-1A0A075B5S6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv3-1A0A075B5S6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv3-1A0A075B5S6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ighv3-1A0A075B5S6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighv3-1A0A075B5S6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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