Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Csn3P06796 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Csn3P06796 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csn3P06796 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csn3P06796 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csn3P06796 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csn3P06796 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Csn3P06796 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Csn3P06796 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csn3P06796 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csn3P06796 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csn3P06796 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csn3P06796 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Csn3P06796 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Csn3P06796 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Csn3P06796 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csn3P06796 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Csn3P06796 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csn3P06796 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csn3P06796 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csn3P06796 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csn3P06796 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csn3P06796 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csn3P06796 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Csn3P06796 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csn3P06796 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csn3P06796 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csn3P06796 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csn3P06796 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csn3P06796 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csn3P06796 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csn3P06796 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csn3P06796 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Csn3P06796 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csn3P06796 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csn3P06796 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csn3P06796 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csn3P06796 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csn3P06796 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csn3P06796 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Csn3P06796 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csn3P06796 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csn3P06796 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csn3P06796 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csn3P06796 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csn3P06796 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csn3P06796 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csn3P06796 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Csn3P06796 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csn3P06796 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Csn3P06796 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csn3P06796 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csn3P06796 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csn3P06796 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csn3P06796 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csn3P06796 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Csn3P06796 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Csn3P06796 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Csn3P06796 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Csn3P06796 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Csn3P06796 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Csn3P06796 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Csn3P06796 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Csn3P06796 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csn3P06796 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csn3P06796 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csn3P06796 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csn3P06796 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Csn3P06796 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Csn3P06796 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Csn3P06796 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Csn3P06796 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Csn3P06796 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csn3P06796 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Csn3P06796 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Csn3P06796 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csn3P06796 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csn3P06796 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csn3P06796 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csn3P06796 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csn3P06796 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csn3P06796 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csn3P06796 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csn3P06796 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csn3P06796 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csn3P06796 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csn3P06796 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csn3P06796 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Csn3P06796 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csn3P06796 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csn3P06796 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csn3P06796 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csn3P06796 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csn3P06796 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csn3P06796 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csn3P06796 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csn3P06796 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csn3P06796 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csn3P06796 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csn3P06796 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms