RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 Q1T7F1 81 aa4.56□□□□□ -1.68
CTXN3-204ENST00000620385 Q5VSD8 79 aa4.56□□□□□ -1.68
CTXN3-204ENST00000620385 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CTXN3-204ENST00000620385 PCOTHQ58A44 107 aa4.54□□□□□ -1.68
CTXN3-204ENST00000620385 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.54□□□□□ -1.68
CTXN3-204ENST00000620385 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.54□□□□□ -1.68
CTXN3-204ENST00000620385 COA5Q86WW8 74 aa4.53□□□□□ -1.68
CTXN3-204ENST00000620385 DMAC1Q96GE9 116 aa4.53□□□□□ -1.68
CTXN3-204ENST00000620385 A8MUN3 132 aa4.52□□□□□ -1.69
CTXN3-204ENST00000620385 ACYP2P14621 99 aa4.52□□□□□ -1.69
CTXN3-204ENST00000620385 A8MUU9 505 aa4.51□□□□□ -1.69
CTXN3-204ENST00000620385 PRR4Q16378 134 aa4.51□□□□□ -1.69
CTXN3-204ENST00000620385 RYR1P21817 5038 aa4.5□□□□□ -1.69
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP10-8P60410 259 aa4.49□□□□□ -1.69
CTXN3-204ENST00000620385 FAT1Q14517 4588 aa4.48□□□□□ -1.69
CTXN3-204ENST00000620385 RYR3Q15413 4870 aa4.48□□□□□ -1.69
CTXN3-204ENST00000620385 HRES1P13985 223 aa4.48□□□□□ -1.69
CTXN3-204ENST00000620385 C4orf26Q17RF5 130 aa4.46□□□□□ -1.7
CTXN3-204ENST00000620385 HSPG2P98160 4391 aa4.46□□□□□ -1.7
CTXN3-204ENST00000620385 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.45□□□□□ -1.7
CTXN3-204ENST00000620385 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.45□□□□□ -1.7
CTXN3-204ENST00000620385 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.43□□□□□ -1.7
CTXN3-204ENST00000620385 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.43□□□□□ -1.7
CTXN3-204ENST00000620385 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
CTXN3-204ENST00000620385 PRR15LQ9BU68 103 aa4.41□□□□□ -1.7
CTXN3-204ENST00000620385 PRO0628Q9UI54 55 aa4.41□□□□□ -1.7
CTXN3-204ENST00000620385 C9orf92A6NGG3 77 aa4.4□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.4□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 TNXBP22105 4242 aa4.4□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.39□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.39□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP10-12P60413 245 aa4.38□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 MT1HL1P0DM35 61 aa4.37□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 TPRXLQ17RH7 258 aa4.37□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 Q5VV11 94 aa4.36□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 PSPHP1O15172 72 aa4.35□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 SPINK7P58062 85 aa4.35□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 BRK1Q8WUW1 75 aa4.35□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.35□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.35□□□□□ -1.71
CTXN3-204ENST00000620385 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
CTXN3-204ENST00000620385 A0A1B0GU69 56 aa4.31□□□□□ -1.72
CTXN3-204ENST00000620385 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.31□□□□□ -1.72
CTXN3-204ENST00000620385 A6NED7 52 aa4.3□□□□□ -1.72
CTXN3-204ENST00000620385 SEC61GP60059 68 aa4.3□□□□□ -1.72
CTXN3-204ENST00000620385 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.3□□□□□ -1.72
CTXN3-204ENST00000620385 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
CTXN3-204ENST00000620385 LCE1FQ5T754 118 aa4.29□□□□□ -1.72
CTXN3-204ENST00000620385 MYCBP2O75592 4640 aa4.28□□□□□ -1.72
CTXN3-204ENST00000620385 UQCR11O14957 56 aa4.24□□□□□ -1.73
CTXN3-204ENST00000620385 PRAC1Q96KF2 57 aa4.2□□□□□ -1.74
CTXN3-204ENST00000620385 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.2□□□□□ -1.74
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.19□□□□□ -1.74
CTXN3-204ENST00000620385 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
CTXN3-204ENST00000620385 S4R3F8 94 aa4.18□□□□□ -1.74
CTXN3-204ENST00000620385 HERC2O95714 4834 aa4.18□□□□□ -1.74
CTXN3-204ENST00000620385 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.17□□□□□ -1.74
CTXN3-204ENST00000620385 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.17□□□□□ -1.74
CTXN3-204ENST00000620385 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.16□□□□□ -1.74
CTXN3-204ENST00000620385 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.16□□□□□ -1.74
CTXN3-204ENST00000620385 LCA10Q71F78 164 aa4.16□□□□□ -1.74
CTXN3-204ENST00000620385 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.14□□□□□ -1.75
CTXN3-204ENST00000620385 PMAIP1Q13794 54 aa4.12□□□□□ -1.75
CTXN3-204ENST00000620385 A0A1B0GU33 70 aa4.1□□□□□ -1.75
CTXN3-204ENST00000620385 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.1□□□□□ -1.75
CTXN3-204ENST00000620385 A6NN06 94 aa4.08□□□□□ -1.76
CTXN3-204ENST00000620385 H0YAA0 97 aa4.08□□□□□ -1.76
CTXN3-204ENST00000620385 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.07□□□□□ -1.76
CTXN3-204ENST00000620385 K7ERS5 55 aa4.06□□□□□ -1.76
CTXN3-204ENST00000620385 CSAG1Q6PB30 78 aa4.06□□□□□ -1.76
CTXN3-204ENST00000620385 A8MU10 97 aa4.05□□□□□ -1.76
CTXN3-204ENST00000620385 LRP2P98164 4655 aa4.04□□□□□ -1.76
CTXN3-204ENST00000620385 MUC17Q685J3 4493 aa4.01□□□□□ -1.77
CTXN3-204ENST00000620385 M0QZ58 72 aa3.98□□□□□ -1.77
CTXN3-204ENST00000620385 LPAP08519 4548 aa3.96□□□□□ -1.78
CTXN3-204ENST00000620385 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.95□□□□□ -1.78
CTXN3-204ENST00000620385 LCE3AQ5TA76 89 aa3.95□□□□□ -1.78
CTXN3-204ENST00000620385 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.95□□□□□ -1.78
CTXN3-204ENST00000620385 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.93□□□□□ -1.78
CTXN3-204ENST00000620385 P0C880 135 aa3.9□□□□□ -1.79
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.88□□□□□ -1.79
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.88□□□□□ -1.79
CTXN3-204ENST00000620385 HERC1Q15751 4861 aa3.87□□□□□ -1.79
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.86□□□□□ -1.79
CTXN3-204ENST00000620385 CRIPTQ9P021 101 aa3.86□□□□□ -1.79
CTXN3-204ENST00000620385 R4GN34 69 aa3.86□□□□□ -1.79
CTXN3-204ENST00000620385 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
CTXN3-204ENST00000620385 ROMO1P60602 79 aa3.82□□□□□ -1.8
CTXN3-204ENST00000620385 A0A0D9SG42 100 aa3.81□□□□□ -1.8
CTXN3-204ENST00000620385 NDUFAF8A1L188 74 aa3.8□□□□□ -1.8
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP12-1P59990 96 aa3.79□□□□□ -1.8
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP12-2P59991 146 aa3.75□□□□□ -1.81
CTXN3-204ENST00000620385 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.75□□□□□ -1.81
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.74□□□□□ -1.81
CTXN3-204ENST00000620385 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.73□□□□□ -1.81
CTXN3-204ENST00000620385 LINC01554Q52M75 96 aa3.71□□□□□ -1.82
CTXN3-204ENST00000620385 RNF213Q63HN8 5207 aa3.7□□□□□ -1.82
CTXN3-204ENST00000620385 MUC2Q02817 5179 aa3.69□□□□□ -1.82
CTXN3-204ENST00000620385 M0R2T5 61 aa3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.7 ms