RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1B0GVY2 172 aa5.15□□□□□ -1.59
EFTUD2-222ENST00000592408 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.15□□□□□ -1.59
EFTUD2-222ENST00000592408 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-222ENST00000592408 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-222ENST00000592408 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1B0GU69 56 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-222ENST00000592408 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-222ENST00000592408 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-222ENST00000592408 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-222ENST00000592408 A8MUU9 505 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-222ENST00000592408 PMAIP1Q13794 54 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-222ENST00000592408 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-222ENST00000592408 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-222ENST00000592408 LCA10Q71F78 164 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-222ENST00000592408 PRAC1Q96KF2 57 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf92A6NGG3 77 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-222ENST00000592408 SPINK7P58062 85 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-222ENST00000592408 A8MU10 97 aa4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-222ENST00000592408 UQCR11O14957 56 aa4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-222ENST00000592408 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-222ENST00000592408 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-222ENST00000592408 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-222ENST00000592408 PKHD1P08F94 4074 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-222ENST00000592408 A6NN06 94 aa4.96□□□□□ -1.62
EFTUD2-222ENST00000592408 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.95□□□□□ -1.62
EFTUD2-222ENST00000592408 Q5VSD8 79 aa4.95□□□□□ -1.62
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.93□□□□□ -1.62
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP10-8P60410 259 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-222ENST00000592408 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-222ENST00000592408 HERC2O95714 4834 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-222ENST00000592408 RYR1P21817 5038 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-222ENST00000592408 FAT1Q14517 4588 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-222ENST00000592408 HSPG2P98160 4391 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-222ENST00000592408 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1B0GU33 70 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-222ENST00000592408 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-222ENST00000592408 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-222ENST00000592408 S4R3F8 94 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-222ENST00000592408 TNXBP22105 4242 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-222ENST00000592408 K7ERS5 55 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-222ENST00000592408 H0YAA0 97 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-222ENST00000592408 MT1HL1P0DM35 61 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-222ENST00000592408 TPRXLQ17RH7 258 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-222ENST00000592408 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.71□□□□□ -1.66
EFTUD2-222ENST00000592408 LCE1EQ5T753 118 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-222ENST00000592408 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-222ENST00000592408 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-222ENST00000592408 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-222ENST00000592408 CSAG1Q6PB30 78 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-222ENST00000592408 MYCBP2O75592 4640 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01554Q52M75 96 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-222ENST00000592408 ROMO1P60602 79 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0D9SG42 100 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-222ENST00000592408 M0QZ58 72 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-222ENST00000592408 HERC1Q15751 4861 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-222ENST00000592408 P0C880 135 aa4.51□□□□□ -1.69
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.5□□□□□ -1.69
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFAF8A1L188 74 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP12-1P59990 96 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP12-2P59991 146 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-222ENST00000592408 R4GN34 69 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-222ENST00000592408 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-222ENST00000592408 LRP2P98164 4655 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CRIPTQ9P021 101 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-222ENST00000592408 MT3P25713 68 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP10-5P60370 271 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-222ENST00000592408 MUC17Q685J3 4493 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-222ENST00000592408 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-222ENST00000592408 LPAP08519 4548 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-222ENST00000592408 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-222ENST00000592408 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.22□□□□□ -1.73
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF213Q63HN8 5207 aa4.21□□□□□ -1.73
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-222ENST00000592408 LCE1FQ5T754 118 aa4.17□□□□□ -1.74
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP10-12P60413 245 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-222ENST00000592408 PP632Q6XCG6 107 aa4.13□□□□□ -1.75
EFTUD2-222ENST00000592408 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP5-9P26371 169 aa4.09□□□□□ -1.75
EFTUD2-222ENST00000592408 MUC2Q02817 5179 aa4.06□□□□□ -1.76
EFTUD2-222ENST00000592408 M0R2T5 61 aa4.04□□□□□ -1.76
EFTUD2-222ENST00000592408 TNP1P09430 55 aa4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms