RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTDSS1-202ENST00000517309 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.38□□□□□ -1.23
PTDSS1-202ENST00000517309 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.36□□□□□ -1.23
PTDSS1-202ENST00000517309 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.34□□□□□ -1.24
PTDSS1-202ENST00000517309 LCE3AQ5TA76 89 aa7.33□□□□□ -1.24
PTDSS1-202ENST00000517309 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.32□□□□□ -1.24
PTDSS1-202ENST00000517309 DNHD1Q96M86 4753 aa7.3□□□□□ -1.24
PTDSS1-202ENST00000517309 INE1O15225 51 aa7.28□□□□□ -1.24
PTDSS1-202ENST00000517309 AKAP9Q99996 3911 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.21□□□□□ -1.26
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PTDSS1-202ENST00000517309 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.15□□□□□ -1.27
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PTDSS1-202ENST00000517309 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.92□□□□□ -1.3
PTDSS1-202ENST00000517309 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTDSS1-202ENST00000517309 LRP2P98164 4655 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTDSS1-202ENST00000517309 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTDSS1-202ENST00000517309 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.69□□□□□ -1.5
PTDSS1-202ENST00000517309 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.65□□□□□ -1.51
PTDSS1-202ENST00000517309 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTDSS1-202ENST00000517309 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.61□□□□□ -1.51
PTDSS1-202ENST00000517309 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.57□□□□□ -1.52
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