RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 A0A1B0GU69 56 aa8.75□□□□□ -1.01
TOM1-216ENST00000492723 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.73□□□□□ -1.01
TOM1-216ENST00000492723 TPRXLQ17RH7 258 aa8.68□□□□□ -1.02
TOM1-216ENST00000492723 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.68□□□□□ -1.02
TOM1-216ENST00000492723 LRP2P98164 4655 aa8.62□□□□□ -1.03
TOM1-216ENST00000492723 LPAP08519 4548 aa8.6□□□□□ -1.03
TOM1-216ENST00000492723 HERC2O95714 4834 aa8.59□□□□□ -1.03
TOM1-216ENST00000492723 J3QL48 77 aa8.59□□□□□ -1.03
TOM1-216ENST00000492723 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.56□□□□□ -1.04
TOM1-216ENST00000492723 PRAC1Q96KF2 57 aa8.54□□□□□ -1.04
TOM1-216ENST00000492723 UQCR11O14957 56 aa8.53□□□□□ -1.04
TOM1-216ENST00000492723 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.5□□□□□ -1.05
TOM1-216ENST00000492723 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.5□□□□□ -1.05
TOM1-216ENST00000492723 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.48□□□□□ -1.05
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.45□□□□□ -1.06
TOM1-216ENST00000492723 S4R3F8 94 aa8.45□□□□□ -1.06
TOM1-216ENST00000492723 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.42□□□□□ -1.06
TOM1-216ENST00000492723 H3BS24 57 aa8.41□□□□□ -1.06
TOM1-216ENST00000492723 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TOM1-216ENST00000492723 A0A1B0GU33 70 aa8.37□□□□□ -1.07
TOM1-216ENST00000492723 H0YAA0 97 aa8.31□□□□□ -1.08
TOM1-216ENST00000492723 LINC01554Q52M75 96 aa8.29□□□□□ -1.08
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TOM1-216ENST00000492723 MUC17Q685J3 4493 aa8.25□□□□□ -1.09
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.24□□□□□ -1.09
TOM1-216ENST00000492723 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.24□□□□□ -1.09
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.23□□□□□ -1.09
TOM1-216ENST00000492723 CSAG1Q6PB30 78 aa8.22□□□□□ -1.09
TOM1-216ENST00000492723 HERC1Q15751 4861 aa8.19□□□□□ -1.1
TOM1-216ENST00000492723 P0C880 135 aa8.16□□□□□ -1.1
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.12□□□□□ -1.11
TOM1-216ENST00000492723 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.09□□□□□ -1.11
TOM1-216ENST00000492723 MUC2Q02817 5179 aa8.05□□□□□ -1.12
TOM1-216ENST00000492723 A0A0D9SG42 100 aa8.04□□□□□ -1.12
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.03□□□□□ -1.12
TOM1-216ENST00000492723 K7ERS5 55 aa8.01□□□□□ -1.13
TOM1-216ENST00000492723 M0QZ58 72 aa7.91□□□□□ -1.14
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.9□□□□□ -1.15
TOM1-216ENST00000492723 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TOM1-216ENST00000492723 CRIPTQ9P021 101 aa7.86□□□□□ -1.15
TOM1-216ENST00000492723 R4GN34 69 aa7.83□□□□□ -1.16
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP12-2P59991 146 aa7.82□□□□□ -1.16
TOM1-216ENST00000492723 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.8□□□□□ -1.16
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP12-1P59990 96 aa7.79□□□□□ -1.16
TOM1-216ENST00000492723 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
TOM1-216ENST00000492723 ROMO1P60602 79 aa7.78□□□□□ -1.16
TOM1-216ENST00000492723 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.74□□□□□ -1.17
TOM1-216ENST00000492723 LCE2CQ5TA81 110 aa7.71□□□□□ -1.17
TOM1-216ENST00000492723 RNF213Q63HN8 5207 aa7.7□□□□□ -1.18
TOM1-216ENST00000492723 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.69□□□□□ -1.18
TOM1-216ENST00000492723 M0R2T5 61 aa7.57□□□□□ -1.2
TOM1-216ENST00000492723 MT1HP80294 61 aa7.55□□□□□ -1.2
TOM1-216ENST00000492723 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.47□□□□□ -1.21
TOM1-216ENST00000492723 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.39□□□□□ -1.23
TOM1-216ENST00000492723 MT2AP02795 61 aa7.33□□□□□ -1.24
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP10-10P60014 251 aa7.32□□□□□ -1.24
TOM1-216ENST00000492723 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.32□□□□□ -1.24
TOM1-216ENST00000492723 MT1FP04733 61 aa7.31□□□□□ -1.24
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.31□□□□□ -1.24
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.3□□□□□ -1.24
TOM1-216ENST00000492723 NDUFAF8A1L188 74 aa7.29□□□□□ -1.24
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.28□□□□□ -1.24
TOM1-216ENST00000492723 A0A0A0MQY5 61 aa7.23□□□□□ -1.25
TOM1-216ENST00000492723 PLAC4Q8WY50 150 aa7.2□□□□□ -1.26
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.06□□□□□ -1.28
TOM1-216ENST00000492723 TNP1P09430 55 aa7.05□□□□□ -1.28
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.02□□□□□ -1.29
TOM1-216ENST00000492723 PP632Q6XCG6 107 aa6.99□□□□□ -1.29
TOM1-216ENST00000492723 MT1BP07438 61 aa6.98□□□□□ -1.29
TOM1-216ENST00000492723 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.85□□□□□ -1.31
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP10-5P60370 271 aa6.84□□□□□ -1.31
TOM1-216ENST00000492723 MT1XP80297 61 aa6.84□□□□□ -1.31
TOM1-216ENST00000492723 LCE2BO14633 110 aa6.8□□□□□ -1.32
TOM1-216ENST00000492723 LUZP6Q538Z0 58 aa6.78□□□□□ -1.32
TOM1-216ENST00000492723 LCE3AQ5TA76 89 aa6.72□□□□□ -1.33
TOM1-216ENST00000492723 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.69□□□□□ -1.34
TOM1-216ENST00000492723 USH2AO75445 5202 aa6.66□□□□□ -1.34
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP10-12P60413 245 aa6.61□□□□□ -1.35
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.55□□□□□ -1.36
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP12-3P60328 96 aa6.43□□□□□ -1.38
TOM1-216ENST00000492723 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.38□□□□□ -1.39
TOM1-216ENST00000492723 SSPOA2VEC9 5147 aa6.35□□□□□ -1.39
TOM1-216ENST00000492723 KMT2DO14686 5537 aa6.34□□□□□ -1.39
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.3□□□□□ -1.4
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.3□□□□□ -1.4
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.29□□□□□ -1.4
TOM1-216ENST00000492723 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.25□□□□□ -1.41
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.23□□□□□ -1.41
TOM1-216ENST00000492723 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.1□□□□□ -1.43
TOM1-216ENST00000492723 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.02□□□□□ -1.45
TOM1-216ENST00000492723 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TOM1-216ENST00000492723 MT1EP04732 61 aa5.96□□□□□ -1.46
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.9□□□□□ -1.46
TOM1-216ENST00000492723 MT1LQ93083 61 aa5.89□□□□□ -1.47
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.85□□□□□ -1.47
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.81□□□□□ -1.48
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.75□□□□□ -1.49
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