RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CCSAP-204ENST00000483092 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CCSAP-204ENST00000483092 TPRXLQ17RH7 258 aa8.57□□□□□ -1.04
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.56□□□□□ -1.04
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCSAP-204ENST00000483092 RYR2Q92736 4967 aa8.53□□□□□ -1.04
CCSAP-204ENST00000483092 MYCBP2O75592 4640 aa8.5□□□□□ -1.05
CCSAP-204ENST00000483092 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.5□□□□□ -1.05
CCSAP-204ENST00000483092 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.46□□□□□ -1.06
CCSAP-204ENST00000483092 Q5VSD8 79 aa8.45□□□□□ -1.06
CCSAP-204ENST00000483092 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.4□□□□□ -1.07
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.35□□□□□ -1.07
CCSAP-204ENST00000483092 S4R3F8 94 aa8.35□□□□□ -1.07
CCSAP-204ENST00000483092 RYR3Q15413 4870 aa8.34□□□□□ -1.07
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.3□□□□□ -1.08
CCSAP-204ENST00000483092 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.28□□□□□ -1.08
CCSAP-204ENST00000483092 HSPG2P98160 4391 aa8.28□□□□□ -1.08
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP12-2P59991 146 aa8.28□□□□□ -1.08
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.27□□□□□ -1.09
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP10-8P60410 259 aa8.24□□□□□ -1.09
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0A0MQY5 61 aa8.22□□□□□ -1.09
CCSAP-204ENST00000483092 TNXBP22105 4242 aa8.21□□□□□ -1.1
CCSAP-204ENST00000483092 XP32Q5T750 250 aa8.19□□□□□ -1.1
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.18□□□□□ -1.1
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.18□□□□□ -1.1
CCSAP-204ENST00000483092 RYR1P21817 5038 aa8.18□□□□□ -1.1
CCSAP-204ENST00000483092 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CCSAP-204ENST00000483092 LPAP08519 4548 aa8.1□□□□□ -1.11
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP12-1P59990 96 aa8.09□□□□□ -1.11
CCSAP-204ENST00000483092 LRP2P98164 4655 aa8.07□□□□□ -1.12
CCSAP-204ENST00000483092 LUZP6Q538Z0 58 aa8.07□□□□□ -1.12
CCSAP-204ENST00000483092 MT1HL1P0DM35 61 aa8.06□□□□□ -1.12
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8□□□□□ -1.13
CCSAP-204ENST00000483092 M0QZ58 72 aa7.99□□□□□ -1.13
CCSAP-204ENST00000483092 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.99□□□□□ -1.13
CCSAP-204ENST00000483092 PLAC4Q8WY50 150 aa7.94□□□□□ -1.14
CCSAP-204ENST00000483092 R4GN34 69 aa7.94□□□□□ -1.14
CCSAP-204ENST00000483092 J3QL48 77 aa7.79□□□□□ -1.16
CCSAP-204ENST00000483092 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.74□□□□□ -1.17
CCSAP-204ENST00000483092 MUC2Q02817 5179 aa7.68□□□□□ -1.18
CCSAP-204ENST00000483092 HERC2O95714 4834 aa7.65□□□□□ -1.18
CCSAP-204ENST00000483092 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.59□□□□□ -1.19
CCSAP-204ENST00000483092 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CCSAP-204ENST00000483092 MUC17Q685J3 4493 aa7.42□□□□□ -1.22
CCSAP-204ENST00000483092 HERC1Q15751 4861 aa7.42□□□□□ -1.22
CCSAP-204ENST00000483092 PP632Q6XCG6 107 aa7.38□□□□□ -1.23
CCSAP-204ENST00000483092 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.3□□□□□ -1.24
CCSAP-204ENST00000483092 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.28□□□□□ -1.24
CCSAP-204ENST00000483092 TNP1P09430 55 aa7.26□□□□□ -1.25
CCSAP-204ENST00000483092 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.26□□□□□ -1.25
CCSAP-204ENST00000483092 RNF213Q63HN8 5207 aa7.22□□□□□ -1.25
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.2□□□□□ -1.26
CCSAP-204ENST00000483092 M0R2T5 61 aa7.12□□□□□ -1.27
CCSAP-204ENST00000483092 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.09□□□□□ -1.28
CCSAP-204ENST00000483092 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.07□□□□□ -1.28
CCSAP-204ENST00000483092 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CCSAP-204ENST00000483092 LCE2CQ5TA81 110 aa6.88□□□□□ -1.31
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP10-10P60014 251 aa6.82□□□□□ -1.32
CCSAP-204ENST00000483092 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.82□□□□□ -1.32
CCSAP-204ENST00000483092 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.78□□□□□ -1.32
CCSAP-204ENST00000483092 MT1HP80294 61 aa6.77□□□□□ -1.33
CCSAP-204ENST00000483092 LCE3AQ5TA76 89 aa6.75□□□□□ -1.33
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.71□□□□□ -1.34
CCSAP-204ENST00000483092 MT1FP04733 61 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSAP-204ENST00000483092 MT2AP02795 61 aa6.65□□□□□ -1.34
CCSAP-204ENST00000483092 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.63□□□□□ -1.35
CCSAP-204ENST00000483092 INE1O15225 51 aa6.59□□□□□ -1.35
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.56□□□□□ -1.36
CCSAP-204ENST00000483092 USH2AO75445 5202 aa6.44□□□□□ -1.38
CCSAP-204ENST00000483092 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.42□□□□□ -1.38
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP12-3P60328 96 aa6.4□□□□□ -1.38
CCSAP-204ENST00000483092 MT1BP07438 61 aa6.37□□□□□ -1.39
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP10-5P60370 271 aa6.31□□□□□ -1.4
CCSAP-204ENST00000483092 MT1XP80297 61 aa6.31□□□□□ -1.4
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.3□□□□□ -1.4
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP10-12P60413 245 aa6.3□□□□□ -1.4
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.3□□□□□ -1.4
CCSAP-204ENST00000483092 KMT2DO14686 5537 aa6.27□□□□□ -1.41
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.26□□□□□ -1.41
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCSAP-204ENST00000483092 LCE2BO14633 110 aa6.13□□□□□ -1.43
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6□□□□□ -1.45
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6□□□□□ -1.45
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.96□□□□□ -1.45
CCSAP-204ENST00000483092 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.93□□□□□ -1.46
CCSAP-204ENST00000483092 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.8□□□□□ -1.48
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.76□□□□□ -1.49
CCSAP-204ENST00000483092 SSPOA2VEC9 5147 aa5.74□□□□□ -1.49
CCSAP-204ENST00000483092 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.65□□□□□ -1.51
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.61□□□□□ -1.51
CCSAP-204ENST00000483092 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.6□□□□□ -1.51
CCSAP-204ENST00000483092 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.54□□□□□ -1.52
CCSAP-204ENST00000483092 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.51□□□□□ -1.53
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.4 ms