RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.3■■■□□ 2.76
CCSAP-204ENST00000483092 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.33■■■□□ 2.13
CCSAP-204ENST00000483092 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.93■■■□□ 2.06
CCSAP-204ENST00000483092 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
CCSAP-204ENST00000483092 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.14■■□□□ 1.93
CCSAP-204ENST00000483092 HRCP23327 699 aa27■■□□□ 1.91
CCSAP-204ENST00000483092 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.92■■□□□ 1.9
CCSAP-204ENST00000483092 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CCSAP-204ENST00000483092 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.53■■□□□ 1.84
CCSAP-204ENST00000483092 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.31■■□□□ 1.8
CCSAP-204ENST00000483092 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CCSAP-204ENST00000483092 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.11■■□□□ 1.77
CCSAP-204ENST00000483092 ABCC9O60706 1549 aa26.08■■□□□ 1.77
CCSAP-204ENST00000483092 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.07■■□□□ 1.76
CCSAP-204ENST00000483092 SCRIBQ14160 1630 aa26.04■■□□□ 1.76
CCSAP-204ENST00000483092 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.92■■□□□ 1.74
CCSAP-204ENST00000483092 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CCSAP-204ENST00000483092 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CCSAP-204ENST00000483092 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM41Q8WV44 630 aa25.64■■□□□ 1.7
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CCSAP-204ENST00000483092 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.49■■□□□ 1.67
CCSAP-204ENST00000483092 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.41■■□□□ 1.66
CCSAP-204ENST00000483092 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CCSAP-204ENST00000483092 NACADO15069 1562 aa25.31■■□□□ 1.64
CCSAP-204ENST00000483092 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.27■■□□□ 1.64
CCSAP-204ENST00000483092 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
CCSAP-204ENST00000483092 MYT1Q01538 1121 aa25.13■■□□□ 1.61
CCSAP-204ENST00000483092 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.12■■□□□ 1.61
CCSAP-204ENST00000483092 WIZO95785 1651 aa25.12■■□□□ 1.61
CCSAP-204ENST00000483092 NEUROD1Q13562 356 aa25.1■■□□□ 1.61
CCSAP-204ENST00000483092 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CCSAP-204ENST00000483092 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CCSAP-204ENST00000483092 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CCSAP-204ENST00000483092 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CCSAP-204ENST00000483092 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CCSAP-204ENST00000483092 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CCSAP-204ENST00000483092 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CCSAP-204ENST00000483092 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CCSAP-204ENST00000483092 ABCC8Q09428 1581 aa24.7■■□□□ 1.54
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.64■■□□□ 1.54
CCSAP-204ENST00000483092 SMARCA4P51532 1647 aa24.59■■□□□ 1.53
CCSAP-204ENST00000483092 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CCSAP-204ENST00000483092 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-204ENST00000483092 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-204ENST00000483092 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-204ENST00000483092 SOGA1O94964 1423 aa24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-204ENST00000483092 SMARCA2P51531 1590 aa24.44■■□□□ 1.5
CCSAP-204ENST00000483092 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-204ENST00000483092 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-204ENST00000483092 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.33■■□□□ 1.49
CCSAP-204ENST00000483092 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CCSAP-204ENST00000483092 CEP162Q5TB80 1403 aa24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-204ENST00000483092 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
CCSAP-204ENST00000483092 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CCSAP-204ENST00000483092 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CCSAP-204ENST00000483092 MIER1Q8N108 512 aa24.08■■□□□ 1.45
CCSAP-204ENST00000483092 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-204ENST00000483092 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-204ENST00000483092 SYNJ1O43426 1573 aa23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-204ENST00000483092 APLP2Q06481 763 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA3Q08378 1498 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-204ENST00000483092 EEA1Q15075 1411 aa23.93■■□□□ 1.42
CCSAP-204ENST00000483092 CLIP1P30622 1438 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-204ENST00000483092 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-204ENST00000483092 BCL11AQ9H165 835 aa23.82■■□□□ 1.4
CCSAP-204ENST00000483092 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-204ENST00000483092 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-204ENST00000483092 BCANQ96GW7 911 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-204ENST00000483092 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-204ENST00000483092 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CCSAP-204ENST00000483092 ITGAEP38570 1179 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-204ENST00000483092 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.57■■□□□ 1.36
CCSAP-204ENST00000483092 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CCSAP-204ENST00000483092 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-204ENST00000483092 KIF21BO75037 1637 aa23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-204ENST00000483092 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CCSAP-204ENST00000483092 NCAPD3P42695 1498 aa23.53■■□□□ 1.36
CCSAP-204ENST00000483092 TOP2BQ02880 1626 aa23.51■■□□□ 1.35
CCSAP-204ENST00000483092 P3H3Q8IVL6 736 aa23.5■■□□□ 1.35
CCSAP-204ENST00000483092 CUX1P39880 1505 aa23.48■■□□□ 1.35
CCSAP-204ENST00000483092 KIF27Q86VH2 1401 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-204ENST00000483092 HMGXB3Q12766 1538 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-204ENST00000483092 CUX2O14529 1486 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-204ENST00000483092 CFTRP13569 1480 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-204ENST00000483092 PRXQ9BXM0 1461 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-204ENST00000483092 FKBP8Q14318 412 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-204ENST00000483092 ARAP1Q96P48 1450 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-204ENST00000483092 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.31■■□□□ 1.32
CCSAP-204ENST00000483092 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-204ENST00000483092 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.28■■□□□ 1.32
CCSAP-204ENST00000483092 NEFLP07196 543 aa23.25■■□□□ 1.31
CCSAP-204ENST00000483092 IGF1RP08069 1367 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-204ENST00000483092 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-204ENST00000483092 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-204ENST00000483092 KCNH8Q96L42 1107 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-204ENST00000483092 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-204ENST00000483092 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms