RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475978.1

SH3BP5L-202, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP5L, Length 4,122 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-202ENST00000475978 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP5L-202ENST00000475978 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP5L-202ENST00000475978 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP5L-202ENST00000475978 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SH3BP5L-202ENST00000475978 A0A1B0GVY2 172 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3BP5L-202ENST00000475978 XP32Q5T750 250 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3BP5L-202ENST00000475978 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP5L-202ENST00000475978 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.19□□□□□ -1.26
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SH3BP5L-202ENST00000475978 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP5L-202ENST00000475978 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
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SH3BP5L-202ENST00000475978 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.03□□□□□ -1.28
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SH3BP5L-202ENST00000475978 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 MT1HL1P0DM35 61 aa6.75□□□□□ -1.33
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SH3BP5L-202ENST00000475978 MYCBP2O75592 4640 aa6.73□□□□□ -1.33
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SH3BP5L-202ENST00000475978 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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SH3BP5L-202ENST00000475978 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.54□□□□□ -1.36
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SH3BP5L-202ENST00000475978 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP5L-202ENST00000475978 LRP2P98164 4655 aa6.34□□□□□ -1.39
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SH3BP5L-202ENST00000475978 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.22□□□□□ -1.41
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SH3BP5L-202ENST00000475978 TNXBP22105 4242 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 LPAP08519 4548 aa6.14□□□□□ -1.43
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SH3BP5L-202ENST00000475978 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.76□□□□□ -1.49
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SH3BP5L-202ENST00000475978 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.68□□□□□ -1.5
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SH3BP5L-202ENST00000475978 MUC17Q685J3 4493 aa5.64□□□□□ -1.51
SH3BP5L-202ENST00000475978 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.63□□□□□ -1.51
SH3BP5L-202ENST00000475978 RNF213Q63HN8 5207 aa5.61□□□□□ -1.51
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SH3BP5L-202ENST00000475978 MT1FP04733 61 aa5.59□□□□□ -1.51
SH3BP5L-202ENST00000475978 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.59□□□□□ -1.51
SH3BP5L-202ENST00000475978 LCE2CQ5TA81 110 aa5.58□□□□□ -1.52
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SH3BP5L-202ENST00000475978 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.53□□□□□ -1.52
SH3BP5L-202ENST00000475978 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.52□□□□□ -1.53
SH3BP5L-202ENST00000475978 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.51□□□□□ -1.53
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SH3BP5L-202ENST00000475978 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.4□□□□□ -1.55
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SH3BP5L-202ENST00000475978 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.07□□□□□ -1.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 LCE2BO14633 110 aa5.05□□□□□ -1.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 KRTAP12-4P60329 112 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.98□□□□□ -1.61
SH3BP5L-202ENST00000475978 USH2AO75445 5202 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP5L-202ENST00000475978 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
SH3BP5L-202ENST00000475978 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.91□□□□□ -1.62
SH3BP5L-202ENST00000475978 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SH3BP5L-202ENST00000475978 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.86□□□□□ -1.63
SH3BP5L-202ENST00000475978 KMT2DO14686 5537 aa4.81□□□□□ -1.64
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SH3BP5L-202ENST00000475978 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.77□□□□□ -1.65
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