RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474312.5

GIGYF2-231, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 2

Gene GIGYF2, Length 4,687 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-231	ENST00000474312	MYCBP2	O75592	4640 aa		3.61	□□□□□ -1.83
GIGYF2-231	ENST00000474312	KMT2A	Q03164	3969 aa		3.6	□□□□□ -1.83
GIGYF2-231	ENST00000474312	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GIGYF2-231	ENST00000474312	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
GIGYF2-231	ENST00000474312	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
GIGYF2-231	ENST00000474312	COL7A1	Q02388	2944 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GIGYF2-231	ENST00000474312		P0C880	135 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		3.49	□□□□□ -1.85
GIGYF2-231	ENST00000474312	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		3.47	□□□□□ -1.85
GIGYF2-231	ENST00000474312	MT1HL1	P0DM35	61 aa		3.47	□□□□□ -1.85
GIGYF2-231	ENST00000474312	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		3.46	□□□□□ -1.86
GIGYF2-231	ENST00000474312	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GIGYF2-231	ENST00000474312	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GIGYF2-231	ENST00000474312	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		3.42	□□□□□ -1.86
GIGYF2-231	ENST00000474312	DNAH2	Q9P225	4427 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
GIGYF2-231	ENST00000474312	PKD1	P98161	4303 aa		3.38	□□□□□ -1.87
GIGYF2-231	ENST00000474312	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GIGYF2-231	ENST00000474312	DNHD1	Q96M86	4753 aa		3.36	□□□□□ -1.87
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.35	□□□□□ -1.87
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.35	□□□□□ -1.87
GIGYF2-231	ENST00000474312	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
GIGYF2-231	ENST00000474312	PKHD1	P08F94	4074 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-231	ENST00000474312	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-231	ENST00000474312	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		3.29	□□□□□ -1.88
GIGYF2-231	ENST00000474312	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		3.29	□□□□□ -1.88
GIGYF2-231	ENST00000474312	HSPG2	P98160	4391 aa		3.27	□□□□□ -1.89
GIGYF2-231	ENST00000474312	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		3.27	□□□□□ -1.89
GIGYF2-231	ENST00000474312	TNXB	P22105	4242 aa		3.25	□□□□□ -1.89
GIGYF2-231	ENST00000474312	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		3.25	□□□□□ -1.89
GIGYF2-231	ENST00000474312	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		3.25	□□□□□ -1.89
GIGYF2-231	ENST00000474312	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		3.17	□□□□□ -1.9
GIGYF2-231	ENST00000474312	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		3.15	□□□□□ -1.9
GIGYF2-231	ENST00000474312	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		3.15	□□□□□ -1.9
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.15	□□□□□ -1.91
GIGYF2-231	ENST00000474312	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
GIGYF2-231	ENST00000474312	RYR3	Q15413	4870 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GIGYF2-231	ENST00000474312	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GIGYF2-231	ENST00000474312	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GIGYF2-231	ENST00000474312	RYR2	Q92736	4967 aa		3.03	□□□□□ -1.92
GIGYF2-231	ENST00000474312	MT1H	P80294	61 aa		3.01	□□□□□ -1.93
GIGYF2-231	ENST00000474312	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3	□□□□□ -1.93
GIGYF2-231	ENST00000474312	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		2.95	□□□□□ -1.94
GIGYF2-231	ENST00000474312	FAT1	Q14517	4588 aa		2.94	□□□□□ -1.94
GIGYF2-231	ENST00000474312	MT2A	P02795	61 aa		2.94	□□□□□ -1.94
GIGYF2-231	ENST00000474312	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
GIGYF2-231	ENST00000474312	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		2.92	□□□□□ -1.94
GIGYF2-231	ENST00000474312	HERC1	Q15751	4861 aa		2.92	□□□□□ -1.94
GIGYF2-231	ENST00000474312	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		2.91	□□□□□ -1.94
GIGYF2-231	ENST00000474312	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		2.9	□□□□□ -1.94
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		2.89	□□□□□ -1.95
GIGYF2-231	ENST00000474312	INE1	O15225	51 aa		2.87	□□□□□ -1.95
GIGYF2-231	ENST00000474312	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		2.87	□□□□□ -1.95
GIGYF2-231	ENST00000474312	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
GIGYF2-231	ENST00000474312	LCE3A	Q5TA76	89 aa		2.86	□□□□□ -1.95
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		2.86	□□□□□ -1.95
GIGYF2-231	ENST00000474312	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		2.85	□□□□□ -1.95
GIGYF2-231	ENST00000474312	RYR1	P21817	5038 aa		2.85	□□□□□ -1.95
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.96
GIGYF2-231	ENST00000474312	MT1F	P04733	61 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GIGYF2-231	ENST00000474312	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GIGYF2-231	ENST00000474312	LCE4A	Q5TA78	99 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-231	ENST00000474312	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		2.8	□□□□□ -1.96
GIGYF2-231	ENST00000474312	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		2.8	□□□□□ -1.96
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		2.8	□□□□□ -1.96
GIGYF2-231	ENST00000474312	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GIGYF2-231	ENST00000474312	LPA	P08519	4548 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GIGYF2-231	ENST00000474312	SPRR2E	P22531	72 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GIGYF2-231	ENST00000474312	SPRR2B	P35325	72 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GIGYF2-231	ENST00000474312	SPRR2A	P35326	72 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP10-5	P60370	271 aa		2.71	□□□□□ -1.98
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		2.7	□□□□□ -1.98
GIGYF2-231	ENST00000474312	HERC2	O95714	4834 aa		2.69	□□□□□ -1.98
GIGYF2-231	ENST00000474312	LRP2	P98164	4655 aa		2.67	□□□□□ -1.98
GIGYF2-231	ENST00000474312	SPRR2D	P22532	72 aa		2.66	□□□□□ -1.98
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		2.66	□□□□□ -1.98
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		2.64	□□□□□ -1.99
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		2.64	□□□□□ -1.99
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		2.64	□□□□□ -1.99
GIGYF2-231	ENST00000474312	MUC17	Q685J3	4493 aa		2.62	□□□□□ -1.99
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP12-4	P60329	112 aa		2.62	□□□□□ -1.99
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		2.62	□□□□□ -1.99
GIGYF2-231	ENST00000474312	MT1G	P13640	62 aa		2.59	□□□□□ -2
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		2.59	□□□□□ -2
GIGYF2-231	ENST00000474312	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		2.58	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms