RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRU-204ENST00000428026 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRU-204ENST00000428026 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRU-204ENST00000428026 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRU-204ENST00000428026 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP10-12P60413 245 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRU-204ENST00000428026 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRU-204ENST00000428026 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRU-204ENST00000428026 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRU-204ENST00000428026 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRU-204ENST00000428026 ANK2Q01484 3957 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP12-3P60328 96 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRU-204ENST00000428026 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRU-204ENST00000428026 RYR1P21817 5038 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRU-204ENST00000428026 LCE3AQ5TA76 89 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRU-204ENST00000428026 FAT1Q14517 4588 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRU-204ENST00000428026 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRU-204ENST00000428026 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRU-204ENST00000428026 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRU-204ENST00000428026 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRU-204ENST00000428026 KMT2AQ03164 3969 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRU-204ENST00000428026 DNAH2Q9P225 4427 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRU-204ENST00000428026 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRU-204ENST00000428026 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRU-204ENST00000428026 RYR3Q15413 4870 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRU-204ENST00000428026 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRU-204ENST00000428026 LYSTQ99698 3801 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRU-204ENST00000428026 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP10-5P60370 271 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRU-204ENST00000428026 MT1HP80294 61 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRU-204ENST00000428026 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRU-204ENST00000428026 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRU-204ENST00000428026 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRU-204ENST00000428026 RYR2Q92736 4967 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRU-204ENST00000428026 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRU-204ENST00000428026 MT2AP02795 61 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRU-204ENST00000428026 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRU-204ENST00000428026 MYCBP2O75592 4640 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRU-204ENST00000428026 HERC2O95714 4834 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRU-204ENST00000428026 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRU-204ENST00000428026 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRU-204ENST00000428026 MT1FP04733 61 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRU-204ENST00000428026 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRU-204ENST00000428026 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRU-204ENST00000428026 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRU-204ENST00000428026 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRU-204ENST00000428026 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRU-204ENST00000428026 HSPG2P98160 4391 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRU-204ENST00000428026 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRU-204ENST00000428026 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRU-204ENST00000428026 PKHD1P08F94 4074 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRU-204ENST00000428026 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRU-204ENST00000428026 LRP2P98164 4655 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRU-204ENST00000428026 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRU-204ENST00000428026 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRU-204ENST00000428026 HERC1Q15751 4861 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRU-204ENST00000428026 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRU-204ENST00000428026 PKD1P98161 4303 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRU-204ENST00000428026 LPAP08519 4548 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRU-204ENST00000428026 LCE2CQ5TA81 110 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRU-204ENST00000428026 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRU-204ENST00000428026 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRU-204ENST00000428026 MT1BP07438 61 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRU-204ENST00000428026 SPRR2EP22531 72 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRU-204ENST00000428026 SPRR2BP35325 72 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRU-204ENST00000428026 SPRR2AP35326 72 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRU-204ENST00000428026 LCE3BQ5TA77 95 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRU-204ENST00000428026 MT1XP80297 61 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRU-204ENST00000428026 TNXBP22105 4242 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP12-4P60329 112 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRU-204ENST00000428026 MT1GP13640 62 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRU-204ENST00000428026 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRU-204ENST00000428026 LCE2BO14633 110 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRU-204ENST00000428026 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRU-204ENST00000428026 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5□□□□□ -1.61
PTPRU-204ENST00000428026 SPRR2DP22532 72 aa5□□□□□ -1.61
PTPRU-204ENST00000428026 RNF213Q63HN8 5207 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRU-204ENST00000428026 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRU-204ENST00000428026 MUC17Q685J3 4493 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRU-204ENST00000428026 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRU-204ENST00000428026 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRU-204ENST00000428026 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRU-204ENST00000428026 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRU-204ENST00000428026 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.78□□□□□ -1.64
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