RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PSPHP1O15172 72 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 HRES1P13985 223 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 Q5W150 140 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0D9SG42 100 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 Q1T7F1 81 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 A8MUU9 505 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 H3BPC8 53 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 M0QZ58 72 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 HERC2O95714 4834 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 OCR1Q9BZK8 76 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GU69 56 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 A8MUN3 132 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 MYCBP2O75592 4640 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 A6NED7 52 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-201ENST00000348564 ABCA13Q86UQ4 5058 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-201ENST00000348564 A6NN06 94 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-201ENST00000348564 Q5VV11 94 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-201ENST00000348564 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-201ENST00000348564 A8MU10 97 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-201ENST00000348564 COA5Q86WW8 74 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-201ENST00000348564 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GU33 70 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 LCE2CQ5TA81 110 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 PRAC1Q96KF2 57 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0A0MQY5 61 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 MUC17Q685J3 4493 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 LORP23490 312 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 UQCR11O14957 56 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 LPAP08519 4548 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 LRP2P98164 4655 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 HERC1Q15751 4861 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 DMAC1Q96GE9 116 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 CRIPTQ9P021 101 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 MT1HP80294 61 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.1□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.1□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 ROMO1P60602 79 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRC-201ENST00000348564 P0C880 135 aa2.07□□□□□ -2.08
PTPRC-201ENST00000348564 TNP1P09430 55 aa2.07□□□□□ -2.08
PTPRC-201ENST00000348564 MUC2Q02817 5179 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRC-201ENST00000348564 MT2AP02795 61 aa2.03□□□□□ -2.09
PTPRC-201ENST00000348564 RNF213Q63HN8 5207 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRC-201ENST00000348564 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
PTPRC-201ENST00000348564 LUZP6Q538Z0 58 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFAF8A1L188 74 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-201ENST00000348564 H0YAA0 97 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-201ENST00000348564 MT1FP04733 61 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa1.98□□□□□ -2.09
PTPRC-201ENST00000348564 FAT4Q6V0I7 4981 aa1.97□□□□□ -2.09
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa1.97□□□□□ -2.09
PTPRC-201ENST00000348564 SPRR2FQ96RM1 72 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa1.93□□□□□ -2.1
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa1.92□□□□□ -2.1
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa1.92□□□□□ -2.1
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PTPRC-201ENST00000348564 LCE3BQ5TA77 95 aa1.88□□□□□ -2.11
PTPRC-201ENST00000348564 SPRR2EP22531 72 aa1.88□□□□□ -2.11
PTPRC-201ENST00000348564 SPRR2BP35325 72 aa1.88□□□□□ -2.11
PTPRC-201ENST00000348564 SPRR2AP35326 72 aa1.88□□□□□ -2.11
PTPRC-201ENST00000348564 PP632Q6XCG6 107 aa1.88□□□□□ -2.11
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP10-12P60413 245 aa1.87□□□□□ -2.11
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa1.87□□□□□ -2.11
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP12-2P59991 146 aa1.86□□□□□ -2.11
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP12-1P59990 96 aa1.85□□□□□ -2.11
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa1.84□□□□□ -2.11
PTPRC-201ENST00000348564 SPRR2GQ9BYE4 73 aa1.84□□□□□ -2.12
PTPRC-201ENST00000348564 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
PTPRC-201ENST00000348564 SPRR2DP22532 72 aa1.81□□□□□ -2.12
PTPRC-201ENST00000348564 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP10-5P60370 271 aa1.79□□□□□ -2.12
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