RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.28□□□□□ -0.92
NISCH-201ENST00000345716 DNHD1Q96M86 4753 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-201ENST00000345716 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-201ENST00000345716 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-201ENST00000345716 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.17□□□□□ -0.94
NISCH-201ENST00000345716 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
NISCH-201ENST00000345716 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-201ENST00000345716 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP10-12P60413 245 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-201ENST00000345716 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-201ENST00000345716 FAT1Q14517 4588 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-201ENST00000345716 DNAH2Q9P225 4427 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-201ENST00000345716 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-201ENST00000345716 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
NISCH-201ENST00000345716 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.81□□□□□ -1
NISCH-201ENST00000345716 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
NISCH-201ENST00000345716 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.79□□□□□ -1
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.78□□□□□ -1
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP12-3P60328 96 aa8.77□□□□□ -1.01
NISCH-201ENST00000345716 LCE3AQ5TA76 89 aa8.77□□□□□ -1.01
NISCH-201ENST00000345716 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.75□□□□□ -1.01
NISCH-201ENST00000345716 RYR1P21817 5038 aa8.75□□□□□ -1.01
NISCH-201ENST00000345716 ANK2Q01484 3957 aa8.72□□□□□ -1.01
NISCH-201ENST00000345716 KMT2AQ03164 3969 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-201ENST00000345716 MT1HP80294 61 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-201ENST00000345716 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NISCH-201ENST00000345716 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.52□□□□□ -1.04
NISCH-201ENST00000345716 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-201ENST00000345716 INE1O15225 51 aa8.46□□□□□ -1.05
NISCH-201ENST00000345716 MT2AP02795 61 aa8.45□□□□□ -1.06
NISCH-201ENST00000345716 LYSTQ99698 3801 aa8.45□□□□□ -1.06
NISCH-201ENST00000345716 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.45□□□□□ -1.06
NISCH-201ENST00000345716 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-201ENST00000345716 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-201ENST00000345716 MYCBP2O75592 4640 aa8.36□□□□□ -1.07
NISCH-201ENST00000345716 RYR3Q15413 4870 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-201ENST00000345716 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-201ENST00000345716 MT1FP04733 61 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-201ENST00000345716 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.27□□□□□ -1.09
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.25□□□□□ -1.09
NISCH-201ENST00000345716 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
NISCH-201ENST00000345716 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-201ENST00000345716 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-201ENST00000345716 RYR2Q92736 4967 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-201ENST00000345716 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-201ENST00000345716 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.96□□□□□ -1.14
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP10-5P60370 271 aa7.9□□□□□ -1.14
NISCH-201ENST00000345716 HERC2O95714 4834 aa7.9□□□□□ -1.15
NISCH-201ENST00000345716 HSPG2P98160 4391 aa7.88□□□□□ -1.15
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.87□□□□□ -1.15
NISCH-201ENST00000345716 PKHD1P08F94 4074 aa7.82□□□□□ -1.16
NISCH-201ENST00000345716 LRP2P98164 4655 aa7.82□□□□□ -1.16
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
NISCH-201ENST00000345716 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.75□□□□□ -1.17
NISCH-201ENST00000345716 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-201ENST00000345716 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-201ENST00000345716 PKD1P98161 4303 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-201ENST00000345716 LCE2CQ5TA81 110 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-201ENST00000345716 MT1XP80297 61 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-201ENST00000345716 MT1BP07438 61 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-201ENST00000345716 HERC1Q15751 4861 aa7.59□□□□□ -1.2
NISCH-201ENST00000345716 LPAP08519 4548 aa7.56□□□□□ -1.2
NISCH-201ENST00000345716 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.54□□□□□ -1.2
NISCH-201ENST00000345716 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.53□□□□□ -1.2
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-201ENST00000345716 TNXBP22105 4242 aa7.44□□□□□ -1.22
NISCH-201ENST00000345716 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.44□□□□□ -1.22
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.43□□□□□ -1.22
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-201ENST00000345716 MUC17Q685J3 4493 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-201ENST00000345716 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-201ENST00000345716 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NISCH-201ENST00000345716 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.21□□□□□ -1.26
NISCH-201ENST00000345716 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
NISCH-201ENST00000345716 SPRR2EP22531 72 aa7.16□□□□□ -1.26
NISCH-201ENST00000345716 SPRR2BP35325 72 aa7.16□□□□□ -1.26
NISCH-201ENST00000345716 SPRR2AP35326 72 aa7.16□□□□□ -1.26
NISCH-201ENST00000345716 LCE2BO14633 110 aa7.16□□□□□ -1.26
NISCH-201ENST00000345716 MT1GP13640 62 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-201ENST00000345716 LCE3BQ5TA77 95 aa7.04□□□□□ -1.28
NISCH-201ENST00000345716 SPRR2DP22532 72 aa6.91□□□□□ -1.3
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.91□□□□□ -1.3
NISCH-201ENST00000345716 MT1LQ93083 61 aa6.9□□□□□ -1.31
NISCH-201ENST00000345716 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.87□□□□□ -1.31
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.87□□□□□ -1.31
NISCH-201ENST00000345716 MT1EP04732 61 aa6.87□□□□□ -1.31
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP12-4P60329 112 aa6.86□□□□□ -1.31
NISCH-201ENST00000345716 RNF213Q63HN8 5207 aa6.84□□□□□ -1.31
NISCH-201ENST00000345716 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.75□□□□□ -1.33
NISCH-201ENST00000345716 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.73□□□□□ -1.33
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-201ENST00000345716 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms