RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP10-5P60370 271 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP23-1A1A580 65 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-201ENST00000332175 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-201ENST00000332175 DNAH9Q9NYC9 4486 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRM-201ENST00000332175 AKAP9Q99996 3911 aa9.08□□□□□ -0.96
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PTPRM-201ENST00000332175 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.93□□□□□ -0.98
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PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-201ENST00000332175 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-201ENST00000332175 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-201ENST00000332175 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-201ENST00000332175 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-201ENST00000332175 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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PTPRM-201ENST00000332175 FAT1Q14517 4588 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-201ENST00000332175 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-201ENST00000332175 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.41□□□□□ -1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 SPRR2BP35325 72 aa8.25□□□□□ -1.09
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PTPRM-201ENST00000332175 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.24□□□□□ -1.09
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PTPRM-201ENST00000332175 LCE3BQ5TA77 95 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-201ENST00000332175 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRM-201ENST00000332175 SPRR2DP22532 72 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP12-4P60329 112 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-201ENST00000332175 MYCBP2O75592 4640 aa7.67□□□□□ -1.18
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PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 HERC1Q15751 4861 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-201ENST00000332175 HSPG2P98160 4391 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-201ENST00000332175 LCE3DQ9BYE3 92 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-201ENST00000332175 RYR2Q92736 4967 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PKD1P98161 4303 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRM-201ENST00000332175 PKHD1P08F94 4074 aa7.13□□□□□ -1.27
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PTPRM-201ENST00000332175 HERC2O95714 4834 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPRM-201ENST00000332175 TNXBP22105 4242 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-201ENST00000332175 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-201ENST00000332175 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-201ENST00000332175 MT1MQ8N339 61 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-201ENST00000332175 MT3P25713 68 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRM-201ENST00000332175 LCE1BQ5T7P3 118 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-201ENST00000332175 PRM1P04553 51 aa6.84□□□□□ -1.31
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