RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253339.9

LATS1-201, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 4,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-201ENST00000253339 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa1.82□□□□□ -2.12
LATS1-201ENST00000253339 VWFP04275 2813 aa1.81□□□□□ -2.12
LATS1-201ENST00000253339 OTOGQ6ZRI0 2925 aa1.81□□□□□ -2.12
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa1.8□□□□□ -2.12
LATS1-201ENST00000253339 TENM4Q6N022 2769 aa1.79□□□□□ -2.12
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP10-10P60014 251 aa1.78□□□□□ -2.12
LATS1-201ENST00000253339 TENM1Q9UKZ4 2725 aa1.78□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa1.77□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 TENM2Q9NT68 2774 aa1.76□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 CSMD3Q7Z407 3707 aa1.76□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 VPS13CQ709C8 3753 aa1.75□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP12-2P59991 146 aa1.75□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa1.75□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa1.75□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP10-12P60413 245 aa1.74□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 LCE1DQ5T752 114 aa1.74□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa1.74□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa1.73□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 FBN3Q75N90 2809 aa1.72□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 A0A1B0GVY2 172 aa1.72□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP12-1P59990 96 aa1.72□□□□□ -2.13
LATS1-201ENST00000253339 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa1.71□□□□□ -2.14
LATS1-201ENST00000253339 DNAH6Q9C0G6 4158 aa1.7□□□□□ -2.14
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa1.69□□□□□ -2.14
LATS1-201ENST00000253339 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.67□□□□□ -2.14
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa1.66□□□□□ -2.14
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa1.65□□□□□ -2.15
LATS1-201ENST00000253339 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa1.62□□□□□ -2.15
LATS1-201ENST00000253339 AKAP9Q99996 3911 aa1.62□□□□□ -2.15
LATS1-201ENST00000253339 BSNQ9UPA5 3926 aa1.61□□□□□ -2.15
LATS1-201ENST00000253339 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa1.55□□□□□ -2.16
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP12-3P60328 96 aa1.54□□□□□ -2.16
LATS1-201ENST00000253339 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.54□□□□□ -2.16
LATS1-201ENST00000253339 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
LATS1-201ENST00000253339 LCE1EQ5T753 118 aa1.51□□□□□ -2.17
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP10-5P60370 271 aa1.5□□□□□ -2.17
LATS1-201ENST00000253339 DNAH10Q8IVF4 4471 aa1.5□□□□□ -2.17
LATS1-201ENST00000253339 ALMS1Q8TCU4 4167 aa1.49□□□□□ -2.17
LATS1-201ENST00000253339 MT1HL1P0DM35 61 aa1.47□□□□□ -2.17
LATS1-201ENST00000253339 CRCT1Q9UGL9 99 aa1.47□□□□□ -2.17
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP1.46□□□□□ -2.18
LATS1-201ENST00000253339 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.45□□□□□ -2.18
LATS1-201ENST00000253339 LYSTQ99698 3801 aa1.45□□□□□ -2.18
LATS1-201ENST00000253339 LCE3AQ5TA76 89 aa1.45□□□□□ -2.18
LATS1-201ENST00000253339 DNAH8Q96JB1 4490 aa1.44□□□□□ -2.18
LATS1-201ENST00000253339 FRAS1Q86XX4 4008 aa1.43□□□□□ -2.18
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa1.42□□□□□ -2.18
LATS1-201ENST00000253339 DNAH17Q9UFH2 4485 aa1.42□□□□□ -2.18
LATS1-201ENST00000253339 MYCBP2O75592 4640 aa1.41□□□□□ -2.18
LATS1-201ENST00000253339 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 OBSCNQ5VST9 7968 aa1.39□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 KMT2AQ03164 3969 aa1.39□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 FAT1Q14517 4588 aa1.38□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 DNAH11Q96DT5 4516 aa1.37□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 APOBP04114 4563 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 DNAH9Q9NYC9 4486 aa1.36□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 DNAH2Q9P225 4427 aa1.35□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 CMYA5Q8N3K9 4069 aa1.35□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 SPRR2GQ9BYE4 73 aa1.35□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 ANK2Q01484 3957 aa1.34□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP12-4P60329 112 aa1.34□□□□□ -2.19
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa1.34□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 LRP1BQ9NZR2 4599 aa1.34□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 DNAH1Q9P2D7 4330 aa1.32□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP5-9P26371 169 aa1.32□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 FAT3Q8TDW7 4589 aa1.3□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa1.3□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 MT2AP02795 61 aa1.29□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 VPS13DQ5THJ4 4388 aa1.29□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 DNAH5Q8TE73 4624 aa1.28□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 SPRR2FQ96RM1 72 aa1.28□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 DNAH7Q8WXX0 4024 aa1.28□□□□□ -2.2
LATS1-201ENST00000253339 MT1HP80294 61 aa1.28□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa1.28□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa1.27□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 HSPG2P98160 4391 aa1.27□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 SACSQ9NZJ4 4579 aa1.26□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa1.26□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa1.25□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 STARD9Q9P2P6 4700 aa1.24□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 DNAH3Q8TD57 4116 aa1.23□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 MT1FP04733 61 aa1.23□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 LRP2P98164 4655 aa1.23□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.23□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 PKHD1P08F94 4074 aa1.22□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 MT1GP13640 62 aa1.22□□□□□ -2.21
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.21□□□□□ -2.22
LATS1-201ENST00000253339 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
LATS1-201ENST00000253339 SPRR2EP22531 72 aa1.19□□□□□ -2.22
LATS1-201ENST00000253339 SPRR2BP35325 72 aa1.19□□□□□ -2.22
LATS1-201ENST00000253339 SPRR2AP35326 72 aa1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms