RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	PCOTH	Q58A44	107 aa		10.87	□□□□□ -0.67
RRN3-205	ENST00000563559	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		10.87	□□□□□ -0.67
RRN3-205	ENST00000563559	LY6G6C	O95867	125 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RRN3-205	ENST00000563559	COA5	Q86WW8	74 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RRN3-205	ENST00000563559		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087X002	238 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RRN3-205	ENST00000563559	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RRN3-205	ENST00000563559		A8MUN3	132 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RRN3-205	ENST00000563559	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RRN3-205	ENST00000563559	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRN3-205	ENST00000563559	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRN3-205	ENST00000563559	C8orf87	E5RJ46	101 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRN3-205	ENST00000563559		Q5VV11	94 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP10-2	P60368	255 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RRN3-205	ENST00000563559	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PRR15L	Q9BU68	103 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RRN3-205	ENST00000563559	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		10.72	□□□□□ -0.69
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		10.72	□□□□□ -0.69
RRN3-205	ENST00000563559	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		10.7	□□□□□ -0.7
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZSA8	131 aa		10.7	□□□□□ -0.7
RRN3-205	ENST00000563559		Q5W150	140 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RRN3-205	ENST00000563559	DNHD1	Q96M86	4753 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RRN3-205	ENST00000563559	HRES1	P13985	223 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00313	P59037	77 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RRN3-205	ENST00000563559		Q75L30	129 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RRN3-205	ENST00000563559	FAM229A	H3BQW9	127 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP10-1	P60331	282 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RRN3-205	ENST00000563559	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RRN3-205	ENST00000563559	PKD1	P98161	4303 aa		10.58	□□□□□ -0.72
RRN3-205	ENST00000563559	ACYP2	P14621	99 aa		10.58	□□□□□ -0.72
RRN3-205	ENST00000563559	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		10.57	□□□□□ -0.72
RRN3-205	ENST00000563559		A6NED7	52 aa		10.56	□□□□□ -0.72
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		10.54	□□□□□ -0.72
RRN3-205	ENST00000563559	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		10.52	□□□□□ -0.73
RRN3-205	ENST00000563559	DMAC1	Q96GE9	116 aa		10.51	□□□□□ -0.73
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV2-30	P06310	120 aa		10.5	□□□□□ -0.73
RRN3-205	ENST00000563559	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		10.5	□□□□□ -0.73
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RRN3-205	ENST00000563559		A8MU10	97 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RRN3-205	ENST00000563559	PMAIP1	Q13794	54 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RRN3-205	ENST00000563559	LCA10	Q71F78	164 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RRN3-205	ENST00000563559	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RRN3-205	ENST00000563559	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RRN3-205	ENST00000563559	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RRN3-205	ENST00000563559	SPINK1	P00995	79 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RRN3-205	ENST00000563559	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRN3-205	ENST00000563559	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRN3-205	ENST00000563559	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RRN3-205	ENST00000563559	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RRN3-205	ENST00000563559	SPINK7	P58062	85 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRN3-205	ENST00000563559	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GU69	56 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RRN3-205	ENST00000563559		A6NN06	94 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RRN3-205	ENST00000563559	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RRN3-205	ENST00000563559	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PKHD1	P08F94	4074 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RRN3-205	ENST00000563559	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RRN3-205	ENST00000563559	SEC61G	P60059	68 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RRN3-205	ENST00000563559	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RRN3-205	ENST00000563559	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RRN3-205	ENST00000563559	UQCR11	O14957	56 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RRN3-205	ENST00000563559	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RRN3-205	ENST00000563559		A8MUU9	505 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GVY2	172 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RRN3-205	ENST00000563559	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RRN3-205	ENST00000563559		Q8N1X5	172 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RRN3-205	ENST00000563559	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RRN3-205	ENST00000563559	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf92	A6NGG3	77 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RRN3-205	ENST00000563559	FAT1	Q14517	4588 aa		10	□□□□□ -0.81
RRN3-205	ENST00000563559	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		9.92	□□□□□ -0.82
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RRN3-205	ENST00000563559	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
RRN3-205	ENST00000563559	RYR2	Q92736	4967 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RRN3-205	ENST00000563559	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		9.76	□□□□□ -0.85
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GU33	70 aa		9.71	□□□□□ -0.86
RRN3-205	ENST00000563559	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		9.7	□□□□□ -0.86
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP10-8	P60410	259 aa		9.7	□□□□□ -0.86
RRN3-205	ENST00000563559	PRAC1	Q96KF2	57 aa		9.69	□□□□□ -0.86
RRN3-205	ENST00000563559		H0YAA0	97 aa		9.68	□□□□□ -0.86
RRN3-205	ENST00000563559	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		9.67	□□□□□ -0.86
RRN3-205	ENST00000563559	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		9.66	□□□□□ -0.86
RRN3-205	ENST00000563559	TNXB	P22105	4242 aa		9.66	□□□□□ -0.86
RRN3-205	ENST00000563559	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	9.66	□□□□□ -0.86
RRN3-205	ENST00000563559		Q5VSD8	79 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RRN3-205	ENST00000563559	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
RRN3-205	ENST00000563559	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
RRN3-205	ENST00000563559	HSPG2	P98160	4391 aa		9.55	□□□□□ -0.88
RRN3-205	ENST00000563559	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	9.52	□□□□□ -0.88

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