RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRNKL1-205	ENST00000496549		A8MUU9	505 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1B0GU33	70 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7EIL1	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRNKL1-205	ENST00000496549	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRNKL1-205	ENST00000496549	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q5W150	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNHD1	Q96M86	4753 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRNKL1-205	ENST00000496549	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRNKL1-205	ENST00000496549	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CRNKL1-205	ENST00000496549	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CRNKL1-205	ENST00000496549	VWF	P04275	2813 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRNKL1-205	ENST00000496549	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRNKL1-205	ENST00000496549	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRNKL1-205	ENST00000496549	TG	P01266	2768 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8N1X5	172 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRNKL1-205	ENST00000496549	PANO1	I0J062	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q96NJ1	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CRNKL1-205	ENST00000496549	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRNKL1-205	ENST00000496549		P0C880	135 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CRNKL1-205	ENST00000496549	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CRNKL1-205	ENST00000496549	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0D9SG42	100 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CRNKL1-205	ENST00000496549	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZSA8	131 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CRNKL1-205	ENST00000496549		H0YAA0	97 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CRNKL1-205	ENST00000496549	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A087WTM6	91 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CRNKL1-205	ENST00000496549	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CRNKL1-205	ENST00000496549	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CRNKL1-205	ENST00000496549	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRNKL1-205	ENST00000496549	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRNKL1-205	ENST00000496549	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANK2	Q01484	3957 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CRNKL1-205	ENST00000496549	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CRNKL1-205	ENST00000496549	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CRNKL1-205	ENST00000496549	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRNKL1-205	ENST00000496549	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRNKL1-205	ENST00000496549	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRNKL1-205	ENST00000496549	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CRNKL1-205	ENST00000496549	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CRNKL1-205	ENST00000496549		S4R3F8	94 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CRNKL1-205	ENST00000496549	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CRNKL1-205	ENST00000496549	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.33	□□□□□ -1.72
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.33	□□□□□ -1.72
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
CRNKL1-205	ENST00000496549	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
CRNKL1-205	ENST00000496549		M0QZ58	72 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CRNKL1-205	ENST00000496549	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CRNKL1-205	ENST00000496549	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CRNKL1-205	ENST00000496549	RYR3	Q15413	4870 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CRNKL1-205	ENST00000496549	LYST	Q99698	3801 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CRNKL1-205	ENST00000496549		R4GN34	69 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CRNKL1-205	ENST00000496549	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CRNKL1-205	ENST00000496549	XP32	Q5T750	250 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CRNKL1-205	ENST00000496549		J3QL48	77 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CRNKL1-205	ENST00000496549	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CRNKL1-205	ENST00000496549	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CRNKL1-205	ENST00000496549	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CRNKL1-205	ENST00000496549	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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