RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.99□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A6NN06 94 aa9.99□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.97□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.97□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q5VSD8 79 aa9.97□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.93□□□□□ -0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa9.89□□□□□ -0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.88□□□□□ -0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.87□□□□□ -0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa9.86□□□□□ -0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZANQ9Y493 2812 aa9.84□□□□□ -0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A8MU10 97 aa9.84□□□□□ -0.83
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TENM4Q6N022 2769 aa9.8□□□□□ -0.84
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLAC4Q8WY50 150 aa9.74□□□□□ -0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.72□□□□□ -0.85
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.71□□□□□ -0.85
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RELNP78509 3460 aa9.62□□□□□ -0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A8MUU9 505 aa9.61□□□□□ -0.87
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.43□□□□□ -0.9
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C10orf95Q9H7T3 257 aa9.32□□□□□ -0.92
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNP1P09430 55 aa9.31□□□□□ -0.92
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.1□□□□□ -0.95
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1B0GVY2 172 aa8.91□□□□□ -0.98
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.89□□□□□ -0.99
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VWFP04275 2813 aa8.8□□□□□ -1
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TGP01266 2768 aa8.76□□□□□ -1.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TPRXLQ17RH7 258 aa8.74□□□□□ -1.01
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP10-10P60014 251 aa8.63□□□□□ -1.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP12-2P59991 146 aa8.62□□□□□ -1.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.55□□□□□ -1.04
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP12-1P59990 96 aa8.41□□□□□ -1.06
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBN3Q75N90 2809 aa8.32□□□□□ -1.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.18□□□□□ -1.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VPS13CQ709C8 3753 aa8.17□□□□□ -1.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COL7A1Q02388 2944 aa8.13□□□□□ -1.11
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AKAP9Q99996 3911 aa8.08□□□□□ -1.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT1HL1P0DM35 61 aa8.05□□□□□ -1.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.05□□□□□ -1.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.02□□□□□ -1.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.91□□□□□ -1.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.88□□□□□ -1.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.82□□□□□ -1.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 INE1O15225 51 aa7.8□□□□□ -1.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.78□□□□□ -1.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNHD1Q96M86 4753 aa7.7□□□□□ -1.18
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