RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SH3BP1-206ENST00000469947 C14orf177Q52M58 125 aa8.09□□□□□ -1.11
SH3BP1-206ENST00000469947 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.09□□□□□ -1.11
SH3BP1-206ENST00000469947 Q5W150 140 aa8.07□□□□□ -1.12
SH3BP1-206ENST00000469947 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A0A0MQY5 61 aa8.05□□□□□ -1.12
SH3BP1-206ENST00000469947 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.05□□□□□ -1.12
SH3BP1-206ENST00000469947 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.04□□□□□ -1.12
SH3BP1-206ENST00000469947 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.03□□□□□ -1.12
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC00483Q53H64 154 aa8.02□□□□□ -1.12
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SH3BP1-206ENST00000469947 PRAC1Q96KF2 57 aa8□□□□□ -1.13
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SH3BP1-206ENST00000469947 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.99□□□□□ -1.13
SH3BP1-206ENST00000469947 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.99□□□□□ -1.13
SH3BP1-206ENST00000469947 C8orf87E5RJ46 101 aa7.99□□□□□ -1.13
SH3BP1-206ENST00000469947 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.99□□□□□ -1.13
SH3BP1-206ENST00000469947 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
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SH3BP1-206ENST00000469947 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.94□□□□□ -1.14
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
SH3BP1-206ENST00000469947 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
SH3BP1-206ENST00000469947 ACYP2P14621 99 aa7.93□□□□□ -1.14
SH3BP1-206ENST00000469947 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.92□□□□□ -1.14
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SH3BP1-206ENST00000469947 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.85□□□□□ -1.15
SH3BP1-206ENST00000469947 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.83□□□□□ -1.16
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SH3BP1-206ENST00000469947 KMT2AQ03164 3969 aa7.77□□□□□ -1.17
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SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV2-30P06310 120 aa7.76□□□□□ -1.17
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SH3BP1-206ENST00000469947 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP1-206ENST00000469947 H0YAA0 97 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP1-206ENST00000469947 Q6ZSA8 131 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP1-206ENST00000469947 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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SH3BP1-206ENST00000469947 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP1-206ENST00000469947 PKD1P98161 4303 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.4□□□□□ -1.23
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.39□□□□□ -1.23
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SH3BP1-206ENST00000469947 PKHD1P08F94 4074 aa7.34□□□□□ -1.23
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SH3BP1-206ENST00000469947 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.3□□□□□ -1.24
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SH3BP1-206ENST00000469947 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SH3BP1-206ENST00000469947 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SH3BP1-206ENST00000469947 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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SH3BP1-206ENST00000469947 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SH3BP1-206ENST00000469947 K7ERS5 55 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1-206ENST00000469947 FAT1Q14517 4588 aa7.13□□□□□ -1.27
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