RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452576.6

VWDE-203, Transcript of von Willebrand factor D and EGF domains, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWDE, Length 5,936 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDE-203ENST00000452576 TENM4Q6N022 2769 aa6.4□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 REV3LO60673 3130 aa6.35□□□□□ -1.39
VWDE-203ENST00000452576 TRANK1O15050 2925 aa6.35□□□□□ -1.39
VWDE-203ENST00000452576 FLNCQ14315 2725 aa6.35□□□□□ -1.39
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.34□□□□□ -1.39
VWDE-203ENST00000452576 KALRNO60229 2985 aa6.34□□□□□ -1.4
VWDE-203ENST00000452576 CDH23Q9H251 3354 aa6.33□□□□□ -1.4
VWDE-203ENST00000452576 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
VWDE-203ENST00000452576 TPRXLQ17RH7 258 aa6.28□□□□□ -1.4
VWDE-203ENST00000452576 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.26□□□□□ -1.41
VWDE-203ENST00000452576 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.26□□□□□ -1.41
VWDE-203ENST00000452576 HIVEP1P15822 2718 aa6.25□□□□□ -1.41
VWDE-203ENST00000452576 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.25□□□□□ -1.41
VWDE-203ENST00000452576 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
VWDE-203ENST00000452576 ITPR1Q14643 2758 aa6.22□□□□□ -1.41
VWDE-203ENST00000452576 VCANP13611 3396 aa6.21□□□□□ -1.41
VWDE-203ENST00000452576 TACC2O95359 2948 aa6.2□□□□□ -1.42
VWDE-203ENST00000452576 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.17□□□□□ -1.42
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP12-2P59991 146 aa6.17□□□□□ -1.42
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.16□□□□□ -1.42
VWDE-203ENST00000452576 LAMA1P25391 3075 aa6.16□□□□□ -1.42
VWDE-203ENST00000452576 SPEGQ15772 3267 aa6.16□□□□□ -1.42
VWDE-203ENST00000452576 SZT2Q5T011 3432 aa6.15□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 APCP25054 2843 aa6.14□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 ATMQ13315 3056 aa6.13□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.12□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.1□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.1□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 LRBAP50851 2863 aa6.1□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 COL6A3P12111 3177 aa6.09□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 COL12A1Q99715 3063 aa6.08□□□□□ -1.44
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.07□□□□□ -1.44
VWDE-203ENST00000452576 FRYLO94915 3013 aa6.05□□□□□ -1.44
VWDE-203ENST00000452576 TENM3Q9P273 2699 aa6.03□□□□□ -1.44
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6□□□□□ -1.45
VWDE-203ENST00000452576 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.99□□□□□ -1.45
VWDE-203ENST00000452576 ZZEF1O43149 2961 aa5.98□□□□□ -1.45
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP12-1P59990 96 aa5.97□□□□□ -1.45
VWDE-203ENST00000452576 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.96□□□□□ -1.46
VWDE-203ENST00000452576 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.95□□□□□ -1.46
VWDE-203ENST00000452576 EYSQ5T1H1 3165 aa5.94□□□□□ -1.46
VWDE-203ENST00000452576 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.93□□□□□ -1.464e-7■□□□□ 8.4
VWDE-203ENST00000452576 TENM2Q9NT68 2774 aa5.91□□□□□ -1.46
VWDE-203ENST00000452576 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.88□□□□□ -1.47
VWDE-203ENST00000452576 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
VWDE-203ENST00000452576 ZANQ9Y493 2812 aa5.81□□□□□ -1.48
VWDE-203ENST00000452576 USP34Q70CQ2 3546 aa5.79□□□□□ -1.48
VWDE-203ENST00000452576 NF1P21359 2839 aa5.78□□□□□ -1.48
VWDE-203ENST00000452576 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.77□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.76□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.75□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 INE1O15225 51 aa5.74□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 FBN2P35556 2912 aa5.74□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 TGP01266 2768 aa5.74□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.73□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.72□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.7□□□□□ -1.5
VWDE-203ENST00000452576 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
VWDE-203ENST00000452576 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.63□□□□□ -1.51
VWDE-203ENST00000452576 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.61□□□□□ -1.51
VWDE-203ENST00000452576 PDZD2O15018 2839 aa5.59□□□□□ -1.51
VWDE-203ENST00000452576 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.58□□□□□ -1.52
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-12P60413 245 aa5.57□□□□□ -1.52
VWDE-203ENST00000452576 VWFP04275 2813 aa5.56□□□□□ -1.52
VWDE-203ENST00000452576 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.53□□□□□ -1.52
VWDE-203ENST00000452576 FBN3Q75N90 2809 aa5.49□□□□□ -1.53
VWDE-203ENST00000452576 MUC3AQ02505 3323 aa5.49□□□□□ -1.53
VWDE-203ENST00000452576 RELNP78509 3460 aa5.48□□□□□ -1.53
VWDE-203ENST00000452576 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.46□□□□□ -1.54
VWDE-203ENST00000452576 LAMA5O15230 3695 aa5.45□□□□□ -1.54
VWDE-203ENST00000452576 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
VWDE-203ENST00000452576 DMDP11532 3685 aa5.44□□□□□ -1.54
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP12-3P60328 96 aa5.41□□□□□ -1.54
VWDE-203ENST00000452576 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.38□□□□□ -1.55
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.37□□□□□ -1.55
VWDE-203ENST00000452576 LCE3AQ5TA76 89 aa5.35□□□□□ -1.55
VWDE-203ENST00000452576 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.34□□□□□ -1.56
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-5P60370 271 aa5.33□□□□□ -1.56
VWDE-203ENST00000452576 CUBNO60494 3623 aa5.28□□□□□ -1.56
VWDE-203ENST00000452576 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.27□□□□□ -1.57
VWDE-203ENST00000452576 MT1HL1P0DM35 61 aa5.26□□□□□ -1.57
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.23□□□□□ -1.57
VWDE-203ENST00000452576 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.21□□□□□ -1.58
VWDE-203ENST00000452576 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.17□□□□□ -1.58
VWDE-203ENST00000452576 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
VWDE-203ENST00000452576 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.13□□□□□ -1.59
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.12□□□□□ -1.59
VWDE-203ENST00000452576 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
VWDE-203ENST00000452576 COL7A1Q02388 2944 aa5.05□□□□□ -1.6
VWDE-203ENST00000452576 ZFHX3Q15911 3703 aa5.05□□□□□ -1.6
VWDE-203ENST00000452576 CSMD2Q7Z408 3487 aa5□□□□□ -1.61
VWDE-203ENST00000452576 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.99□□□□□ -1.61
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
VWDE-203ENST00000452576 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.89□□□□□ -1.63
VWDE-203ENST00000452576 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.3 ms