RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377075.2

CNNM4-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM4, Length 4,800 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4-201ENST00000377075 Q6ZSA8 131 aa12.08□□□□□ -0.48
CNNM4-201ENST00000377075 DMAC1Q96GE9 116 aa12.06□□□□□ -0.48
CNNM4-201ENST00000377075 CSAG1Q6PB30 78 aa12.03□□□□□ -0.48
CNNM4-201ENST00000377075 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa12.01□□□□□ -0.49
CNNM4-201ENST00000377075 MXRA5Q9NR99 2828 aa11.97□□□□□ -0.49
CNNM4-201ENST00000377075 DCHS1Q96JQ0 3298 aa11.96□□□□□ -0.49
CNNM4-201ENST00000377075 LCE6AA0A183 80 aa11.92□□□□□ -0.5
CNNM4-201ENST00000377075 RELNP78509 3460 aa11.92□□□□□ -0.5
CNNM4-201ENST00000377075 MUC3AQ02505 3323 aa11.9□□□□□ -0.5
CNNM4-201ENST00000377075 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CNNM4-201ENST00000377075 S4R3F8 94 aa11.88□□□□□ -0.51
CNNM4-201ENST00000377075 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa11.85□□□□□ -0.51
CNNM4-201ENST00000377075 TENM3Q9P273 2699 aa11.84□□□□□ -0.51
CNNM4-201ENST00000377075 ASPMQ8IZT6 3477 aa11.82□□□□□ -0.52
CNNM4-201ENST00000377075 A8MU10 97 aa11.79□□□□□ -0.52
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa11.77□□□□□ -0.52
CNNM4-201ENST00000377075 RPL37P61927 97 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CNNM4-201ENST00000377075 SPATA8Q6RVD6 105 aa11.75□□□□□ -0.53
CNNM4-201ENST00000377075 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa11.75□□□□□ -0.53
CNNM4-201ENST00000377075 LAMA5O15230 3695 aa11.75□□□□□ -0.53
CNNM4-201ENST00000377075 LUZP6Q538Z0 58 aa11.74□□□□□ -0.53
CNNM4-201ENST00000377075 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.73□□□□□ -0.53
CNNM4-201ENST00000377075 Q5VSD8 79 aa11.72□□□□□ -0.53
CNNM4-201ENST00000377075 DMDP11532 3685 aa11.7□□□□□ -0.54
CNNM4-201ENST00000377075 R4GN34 69 aa11.69□□□□□ -0.54
CNNM4-201ENST00000377075 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa11.69□□□□□ -0.54
CNNM4-201ENST00000377075 H3BS24 57 aa11.69□□□□□ -0.54
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa11.67□□□□□ -0.54
CNNM4-201ENST00000377075 ZFHX4Q86UP3 3567 aa11.67□□□□□ -0.54
CNNM4-201ENST00000377075 TENM1Q9UKZ4 2725 aa11.64□□□□□ -0.55
CNNM4-201ENST00000377075 A6NN06 94 aa11.63□□□□□ -0.55
CNNM4-201ENST00000377075 ROMO1P60602 79 aa11.63□□□□□ -0.55
CNNM4-201ENST00000377075 M0R2T5 61 aa11.55□□□□□ -0.56
CNNM4-201ENST00000377075 ADM2Q7Z4H4 148 aa11.55□□□□□ -0.56
CNNM4-201ENST00000377075 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa11.54□□□□□ -0.56
CNNM4-201ENST00000377075 PDZD2O15018 2839 aa11.52□□□□□ -0.57
CNNM4-201ENST00000377075 M0QZ58 72 aa11.52□□□□□ -0.57
CNNM4-201ENST00000377075 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CNNM4-201ENST00000377075 CSMD1Q96PZ7 3565 aa11.42□□□□□ -0.58
CNNM4-201ENST00000377075 RPS29P62273 56 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
CNNM4-201ENST00000377075 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CNNM4-201ENST00000377075 VWFP04275 2813 aa11.34□□□□□ -0.59
CNNM4-201ENST00000377075 TGP01266 2768 aa11.33□□□□□ -0.6
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa11.3□□□□□ -0.6
CNNM4-201ENST00000377075 TENM2Q9NT68 2774 aa11.3□□□□□ -0.6
CNNM4-201ENST00000377075 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CNNM4-201ENST00000377075 CUBNO60494 3623 aa11.24□□□□□ -0.61
CNNM4-201ENST00000377075 A8MUU9 505 aa11.17□□□□□ -0.62
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa11.15□□□□□ -0.62
CNNM4-201ENST00000377075 A0A0A0MQY5 61 aa11.15□□□□□ -0.63
CNNM4-201ENST00000377075 SVEP1Q4LDE5 3571 aa11.14□□□□□ -0.63
CNNM4-201ENST00000377075 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa11.12□□□□□ -0.63
CNNM4-201ENST00000377075 OTOGQ6ZRI0 2925 aa11.07□□□□□ -0.64
CNNM4-201ENST00000377075 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa10.94□□□□□ -0.66
CNNM4-201ENST00000377075 PLAC4Q8WY50 150 aa10.94□□□□□ -0.66
CNNM4-201ENST00000377075 NDUFAF8A1L188 74 aa10.93□□□□□ -0.66
CNNM4-201ENST00000377075 ZFHX3Q15911 3703 aa10.9□□□□□ -0.66
CNNM4-201ENST00000377075 H0YAA0 97 aa10.9□□□□□ -0.66
CNNM4-201ENST00000377075 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa10.87□□□□□ -0.67
CNNM4-201ENST00000377075 XP32Q5T750 250 aa10.82□□□□□ -0.68
CNNM4-201ENST00000377075 CSMD2Q7Z408 3487 aa10.82□□□□□ -0.68
CNNM4-201ENST00000377075 C10orf95Q9H7T3 257 aa10.82□□□□□ -0.68
CNNM4-201ENST00000377075 FBN3Q75N90 2809 aa10.81□□□□□ -0.68
CNNM4-201ENST00000377075 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.75□□□□□ -0.69
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa10.67□□□□□ -0.7
CNNM4-201ENST00000377075 P0C880 135 aa10.61□□□□□ -0.71
CNNM4-201ENST00000377075 TNP1P09430 55 aa10.6□□□□□ -0.71
CNNM4-201ENST00000377075 COL7A1Q02388 2944 aa10.56□□□□□ -0.72
CNNM4-201ENST00000377075 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa10.56□□□□□ -0.72
CNNM4-201ENST00000377075 BSNQ9UPA5 3926 aa10.53□□□□□ -0.72
CNNM4-201ENST00000377075 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa10.48□□□□□ -0.73
CNNM4-201ENST00000377075 A0A1B0GVY2 172 aa10.45□□□□□ -0.74
CNNM4-201ENST00000377075 TPRXLQ17RH7 258 aa10.44□□□□□ -0.74
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP10-8P60410 259 aa10.37□□□□□ -0.75
CNNM4-201ENST00000377075 PP632Q6XCG6 107 aa10.35□□□□□ -0.75
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa10.25□□□□□ -0.77
CNNM4-201ENST00000377075 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP12-2P59991 146 aa10.18□□□□□ -0.78
CNNM4-201ENST00000377075 VPS13CQ709C8 3753 aa10.07□□□□□ -0.8
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP10-10P60014 251 aa10.06□□□□□ -0.8
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP12-1P59990 96 aa10.03□□□□□ -0.8
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.96□□□□□ -0.82
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CNNM4-201ENST00000377075 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CNNM4-201ENST00000377075 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.8□□□□□ -0.84
CNNM4-201ENST00000377075 PRO2289Q9P1D8 64 aa9.67□□□□□ -0.86
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.61□□□□□ -0.87
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.61□□□□□ -0.87
CNNM4-201ENST00000377075 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CNNM4-201ENST00000377075 MT1HL1P0DM35 61 aa9.56□□□□□ -0.88
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CNNM4-201ENST00000377075 AKAP9Q99996 3911 aa9.4□□□□□ -0.9
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa9.3□□□□□ -0.92
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.23□□□□□ -0.93
CNNM4-201ENST00000377075 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.16□□□□□ -0.94
CNNM4-201ENST00000377075 DNAH9Q9NYC9 4486 aa9.14□□□□□ -0.95
CNNM4-201ENST00000377075 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.11□□□□□ -0.95
CNNM4-201ENST00000377075 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms