RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP12-1P59990 96 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRO-201ENST00000281171 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRO-201ENST00000281171 APCP25054 2843 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRO-201ENST00000281171 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRO-201ENST00000281171 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRO-201ENST00000281171 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1B0GVY2 172 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRO-201ENST00000281171 FRYQ5TBA9 3013 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-201ENST00000281171 LRBAP50851 2863 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-201ENST00000281171 TENM4Q6N022 2769 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-201ENST00000281171 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRO-201ENST00000281171 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRO-201ENST00000281171 KALRNO60229 2985 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRO-201ENST00000281171 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.09□□□□□ -1.28
PTPRO-201ENST00000281171 TRIOO75962 3097 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP10-10P60014 251 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRO-201ENST00000281171 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRO-201ENST00000281171 ATMQ13315 3056 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRO-201ENST00000281171 LAMA1P25391 3075 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRO-201ENST00000281171 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRO-201ENST00000281171 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRO-201ENST00000281171 TGP01266 2768 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRO-201ENST00000281171 COL12A1Q99715 3063 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRO-201ENST00000281171 TACC2O95359 2948 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRO-201ENST00000281171 CDH23Q9H251 3354 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRO-201ENST00000281171 EYSQ5T1H1 3165 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRO-201ENST00000281171 VCANP13611 3396 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRO-201ENST00000281171 FRYLO94915 3013 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRO-201ENST00000281171 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRO-201ENST00000281171 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRO-201ENST00000281171 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRO-201ENST00000281171 ZZEF1O43149 2961 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRO-201ENST00000281171 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRO-201ENST00000281171 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-201ENST00000281171 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-201ENST00000281171 ZANQ9Y493 2812 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-201ENST00000281171 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRO-201ENST00000281171 SZT2Q5T011 3432 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRO-201ENST00000281171 TENM3Q9P273 2699 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRO-201ENST00000281171 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRO-201ENST00000281171 NF1P21359 2839 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRO-201ENST00000281171 TENM2Q9NT68 2774 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRO-201ENST00000281171 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRO-201ENST00000281171 SPEGQ15772 3267 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRO-201ENST00000281171 COL6A3P12111 3177 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRO-201ENST00000281171 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-201ENST00000281171 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRO-201ENST00000281171 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-201ENST00000281171 REV3LO60673 3130 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRO-201ENST00000281171 PDZD2O15018 2839 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRO-201ENST00000281171 FBN2P35556 2912 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-201ENST00000281171 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRO-201ENST00000281171 MT1HL1P0DM35 61 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRO-201ENST00000281171 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRO-201ENST00000281171 ZFHX3Q15911 3703 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-201ENST00000281171 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRO-201ENST00000281171 USP34Q70CQ2 3546 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-201ENST00000281171 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-201ENST00000281171 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRO-201ENST00000281171 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRO-201ENST00000281171 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRO-201ENST00000281171 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP12-3P60328 96 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP10-12P60413 245 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRO-201ENST00000281171 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRO-201ENST00000281171 MUC3AQ02505 3323 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRO-201ENST00000281171 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRO-201ENST00000281171 VWFP04275 2813 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRO-201ENST00000281171 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRO-201ENST00000281171 LCE3AQ5TA76 89 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRO-201ENST00000281171 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRO-201ENST00000281171 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRO-201ENST00000281171 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRO-201ENST00000281171 RELNP78509 3460 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRO-201ENST00000281171 FBN3Q75N90 2809 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRO-201ENST00000281171 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRO-201ENST00000281171 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
PTPRO-201ENST00000281171 DMDP11532 3685 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRO-201ENST00000281171 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-201ENST00000281171 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-201ENST00000281171 LAMA5O15230 3695 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-201ENST00000281171 CUBNO60494 3623 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP10-5P60370 271 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRO-201ENST00000281171 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-201ENST00000281171 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-201ENST00000281171 COL7A1Q02388 2944 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRO-201ENST00000281171 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRO-201ENST00000281171 DNAH2Q9P225 4427 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRO-201ENST00000281171 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRO-201ENST00000281171 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRO-201ENST00000281171 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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