RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PDE6GP18545 87 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 REG3GQ6UW15 175 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM29Q86T20 159 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP10-1P60331 282 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 HAMPP81172 84 aa3.4□□□□□ -1.87
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 K7EQZ3 153 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-210ENST00000462363 DPH3Q96FX2 82 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 MOBPQ13875 183 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRC-210ENST00000462363 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.34□□□□□ -1.88
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