Protein–RNA interactions for Protein: P35637

FUS, RNA-binding protein FUS, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUSP35637 KBTBD11-OT1-205ENST00000636175 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.77□□□□□ -0.522e-13■■■■■ 47.4
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FUSP35637 KBTBD11-OT1-203ENST00000635773 5844 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.92□□□□□ -0.822e-13■■■■■ 47.4
FUSP35637 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.862e-13■■■■■ 47.4
FUSP35637 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.872e-13■■■■■ 47.4
FUSP35637 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.912e-13■■■■■ 47.4
FUSP35637 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.192e-13■■■■■ 47.4
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FUSP35637 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 312.29□□□□□ -0.449e-12■■■■■ 44.9
FUSP35637 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 311.16□□□□□ -0.629e-12■■■■■ 44.9
FUSP35637 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.024e-9■■■■■ 44.7
FUSP35637 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.359e-11■■■■■ 44.3
FUSP35637 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 212.55□□□□□ -0.49e-11■■■■■ 44.3
FUSP35637 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 29.84□□□□□ -0.839e-11■■■■■ 44.3
FUSP35637 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.869e-11■■■■■ 44.3
FUSP35637 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.889e-11■■■■■ 44.3
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FUSP35637 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)15.17■□□□□ 0.021e-10■■■■■ 37.9
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FUSP35637 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-10■■■■■ 37.9
FUSP35637 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 512.01□□□□□ -0.491e-10■■■■■ 37.9
FUSP35637 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.511e-10■■■■■ 37.9
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FUSP35637 PFKFB4-211ENST00000471890 553 ntTSL 49.26□□□□□ -0.931e-10■■■■■ 37.9
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FUSP35637 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.277e-13■■■■■ 37.4
FUSP35637 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-21■■■■■ 35.4
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FUSP35637 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.631e-21■■■■■ 35.4
FUSP35637 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.651e-21■■■■■ 35.4
FUSP35637 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 25.71□□□□□ -1.51e-21■■■■■ 35.4
FUSP35637 TNK2-220ENST00000486523 300 ntTSL 313.77□□□□□ -0.213e-12■■■■■ 34.8
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FUSP35637 PPP2R2D-205ENST00000490777 1462 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.621e-10■■■■■ 33.3
FUSP35637 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)8.4□□□□□ -1.071e-10■■■■■ 33.3
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FUSP35637 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.252e-10■■■■■ 32.7
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FUSP35637 MAGI2-225ENST00000636234 5702 ntTSL 53.03□□□□□ -1.922e-10■■■■■ 32.7
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FUSP35637 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 30.8
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FUSP35637 DHFR-204ENST00000508282 545 ntTSL 31.97□□□□□ -2.092e-7■■■■■ 30.8
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FUSP35637 MARCH3-202ENST00000502289 764 ntTSL 413.05□□□□□ -0.322e-10■■■■■ 30.4
FUSP35637 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.932e-10■■■■■ 30.4
FUSP35637 GPT2-203ENST00000562132 554 ntTSL 49.92□□□□□ -0.821e-9■■■■■ 30.3
FUSP35637 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-9■■■■■ 30.3
FUSP35637 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.061e-9■■■■■ 30.3
FUSP35637 FASN-208ENST00000635733 100 ntTSL 55.74□□□□□ -1.491e-10■■■■■ 30.2
FUSP35637 BNIP3-204ENST00000633835 1062 ntTSL 314.34□□□□□ -0.118e-9■■■■■ 30
FUSP35637 BSCL2-221ENST00000530009 539 ntTSL 412.47□□□□□ -0.418e-9■■■■■ 30
FUSP35637 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.528e-9■■■■■ 30
FUSP35637 BSCL2-214ENST00000464544 794 ntTSL 210.16□□□□□ -0.788e-9■■■■■ 30
FUSP35637 BSCL2-225ENST00000532818 662 ntTSL 210.04□□□□□ -0.88e-9■■■■■ 30
FUSP35637 BNIP3-203ENST00000631806 752 ntTSL 29.74□□□□□ -0.858e-9■■■■■ 30
FUSP35637 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.888e-9■■■■■ 30
FUSP35637 BNIP3-202ENST00000540159 3066 ntTSL 1 (best)8.72□□□□□ -1.018e-9■■■■■ 30
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FUSP35637 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 29.8
FUSP35637 NPM1-205ENST00000518587 670 ntTSL 24.06□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 29.8
FUSP35637 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.842e-7■■■■■ 29.8
FUSP35637 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.842e-7■■■■■ 29.8
FUSP35637 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 213.53□□□□□ -0.247e-12■■■■■ 29.8
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FUSP35637 WDR6-206ENST00000438660 852 ntTSL 512.16□□□□□ -0.463e-10■■■■■ 29.7
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