RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 Q5VSD8 79 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LCE6AA0A183 80 aa8.85□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.82□□□□□ -1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP10-1P60331 282 aa8.82□□□□□ -1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP10-2P60368 255 aa8.76□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 M0QZ58 72 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.72□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PANO1I0J062 215 aa8.7□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 USP24Q9UPU5 2620 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ITPR3Q14573 2671 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A087X002 238 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UTRNP46939 3433 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCNTO95613 3336 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLAC4Q8WY50 150 aa8.59□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CEP350Q5VT06 3117 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A6NN06 94 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATRQ13535 2644 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.52□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.51□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BPTFQ12830 3046 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-207ENST00000428584 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAST4O15021 2626 aa8.46□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A8MU10 97 aa8.43□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.42□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A8MUU9 505 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.35□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHD7Q9P2D1 2997 aa8.29□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.28□□□□□ -1.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C5orf42Q9H799 3197 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.25□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 STAB1Q9NY15 2570 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.18□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NDUFAF8A1L188 74 aa8.18□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A0C4DFX4 3053 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TNP1P09430 55 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHD6Q8TD26 2715 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.1□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF292O60281 2723 aa8.06□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HTTP42858 3142 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AKAP13Q12802 2813 aa8.02□□□□□ -1.13
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COL6A5A8TX70 2615 aa8.01□□□□□ -1.13
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CENPEQ02224 2701 aa8.01□□□□□ -1.13
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PP632Q6XCG6 107 aa8□□□□□ -1.13
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRANK1O15050 2925 aa7.98□□□□□ -1.13
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BRCA2P51587 3418 aa7.97□□□□□ -1.13
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.95□□□□□ -1.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MGAQ8IWI9 3026 aa7.94□□□□□ -1.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 XP32Q5T750 250 aa7.93□□□□□ -1.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.9□□□□□ -1.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H0YAA0 97 aa7.9□□□□□ -1.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CFAP54Q96N23 3096 aa7.9□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LAMA3Q16787 3333 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NOTCH1P46531 2555 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.86□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TPRXLQ17RH7 258 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ITPR2Q14571 2701 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP10-8P60410 259 aa7.8□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-207ENST00000428584 P0C880 135 aa7.8□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-207ENST00000428584 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.75□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1B0GVY2 172 aa7.74□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDH23Q9H251 3354 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIOO75962 3097 aa7.68□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-207ENST00000428584 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.67□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.66□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.65□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.63□□□□□ -1.19
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