RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 CCKP06307 115 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-211ENST00000425989 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.87□□□□□ -1.47
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-211ENST00000425989 XGP55808 180 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00483Q53H64 154 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-211ENST00000425989 Q6JHZ5 121 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-211ENST00000425989 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.85□□□□□ -1.47
HDLBP-211ENST00000425989 SMIM29Q86T20 159 aa5.85□□□□□ -1.47
HDLBP-211ENST00000425989 SPRR4Q96PI1 79 aa5.85□□□□□ -1.47
HDLBP-211ENST00000425989 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.85□□□□□ -1.47
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZQT0 140 aa5.84□□□□□ -1.47
HDLBP-211ENST00000425989 CDK2AP2O75956 126 aa5.83□□□□□ -1.48
HDLBP-211ENST00000425989 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.83□□□□□ -1.48
HDLBP-211ENST00000425989 FAM229AH3BQW9 127 aa5.81□□□□□ -1.48
HDLBP-211ENST00000425989 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.81□□□□□ -1.48
HDLBP-211ENST00000425989 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.81□□□□□ -1.48
HDLBP-211ENST00000425989 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
HDLBP-211ENST00000425989 Q6Q795 121 aa5.79□□□□□ -1.48
HDLBP-211ENST00000425989 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.78□□□□□ -1.48
HDLBP-211ENST00000425989 VPS25Q9BRG1 176 aa5.78□□□□□ -1.48
HDLBP-211ENST00000425989 UBL5Q9BZL1 73 aa5.78□□□□□ -1.48
HDLBP-211ENST00000425989 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.77□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 CRYGAP11844 174 aa5.77□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00643Q86TS7 51 aa5.77□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 Q8NBF4 154 aa5.77□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 HAMPP81172 84 aa5.76□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GV72 72 aa5.75□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 CD164Q04900 197 aa5.75□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 IGFL1Q6UW32 110 aa5.75□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 SIGMAR1Q99720 223 aa5.75□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.74□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PNM2 257 aa5.74□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.74□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 CDIP1Q9H305 208 aa5.74□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00846Q9NV44 126 aa5.74□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.73□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 NREPQ16612 68 aa5.73□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 IMUPQ9GZP8 106 aa5.73□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.72□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 PKHD1P08F94 4074 aa5.72□□□□□ -1.49
HDLBP-211ENST00000425989 HERC2O95714 4834 aa5.71□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.7□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 MOBPQ13875 183 aa5.7□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.7□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 CXCL6P80162 114 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZVQ6 151 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.69□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 J3KT08 172 aa5.67□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 Q5XG85 94 aa5.67□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 Q8N1X5 172 aa5.67□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.67□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.67□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 A0A087WSZ3 146 aa5.66□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.66□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 BPY2O14599 106 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 SPINK1P00995 79 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 Q5VSD8 79 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-211ENST00000425989 A0A087X002 238 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-211ENST00000425989 SCGB1A1P11684 91 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-211ENST00000425989 MT-ATP8P03928 68 aa5.63□□□□□ -1.51
HDLBP-211ENST00000425989 LIMD2Q9BT23 127 aa5.63□□□□□ -1.51
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0G2JQZ4 141 aa5.62□□□□□ -1.51
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.62□□□□□ -1.51
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.6□□□□□ -1.51
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFB1O75438 58 aa5.6□□□□□ -1.51
HDLBP-211ENST00000425989 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.6□□□□□ -1.51
HDLBP-211ENST00000425989 RYR1P21817 5038 aa5.6□□□□□ -1.51
HDLBP-211ENST00000425989 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.59□□□□□ -1.51
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.59□□□□□ -1.51
HDLBP-211ENST00000425989 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
HDLBP-211ENST00000425989 FAT1Q14517 4588 aa5.57□□□□□ -1.52
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP10-8P60410 259 aa5.57□□□□□ -1.52
HDLBP-211ENST00000425989 A8MWP4 228 aa5.56□□□□□ -1.52
HDLBP-211ENST00000425989 OXTP01178 125 aa5.56□□□□□ -1.52
HDLBP-211ENST00000425989 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.56□□□□□ -1.52
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV4-1P06312 121 aa5.55□□□□□ -1.52
HDLBP-211ENST00000425989 DSCR10P59022 87 aa5.55□□□□□ -1.52
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.55□□□□□ -1.52
HDLBP-211ENST00000425989 PRR15Q8IV56 129 aa5.54□□□□□ -1.52
HDLBP-211ENST00000425989 Q96NJ1 140 aa5.54□□□□□ -1.52
HDLBP-211ENST00000425989 HSPG2P98160 4391 aa5.54□□□□□ -1.52
HDLBP-211ENST00000425989 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.53□□□□□ -1.52
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf195Q5TG92 126 aa5.52□□□□□ -1.53
HDLBP-211ENST00000425989 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.52□□□□□ -1.53
HDLBP-211ENST00000425989 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.51□□□□□ -1.53
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GVX0 72 aa5.5□□□□□ -1.53
HDLBP-211ENST00000425989 C8orf87E5RJ46 101 aa5.5□□□□□ -1.53
HDLBP-211ENST00000425989 ATOX1O00244 68 aa5.5□□□□□ -1.53
HDLBP-211ENST00000425989 K7EQZ3 153 aa5.49□□□□□ -1.53
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