RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
TOM1-216ENST00000492723 RPL37AP8A6NKH3 93 aa10.78□□□□□ -0.68
TOM1-216ENST00000492723 SDIM1Q6ZPB5 146 aa10.78□□□□□ -0.68
TOM1-216ENST00000492723 LINC00643Q86TS7 51 aa10.78□□□□□ -0.68
TOM1-216ENST00000492723 CCKP06307 115 aa10.77□□□□□ -0.68
TOM1-216ENST00000492723 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
TOM1-216ENST00000492723 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.77□□□□□ -0.69
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10.77□□□□□ -0.69
TOM1-216ENST00000492723 H3BQ85 93 aa10.76□□□□□ -0.69
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TOM1-216ENST00000492723 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa10.75□□□□□ -0.69
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TOM1-216ENST00000492723 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa10.74□□□□□ -0.69
TOM1-216ENST00000492723 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa10.74□□□□□ -0.69
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TOM1-216ENST00000492723 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa10.62□□□□□ -0.71
TOM1-216ENST00000492723 C9orf163Q8N9P6 203 aa10.62□□□□□ -0.71
TOM1-216ENST00000492723 Q8N377 158 aa10.61□□□□□ -0.71
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TOM1-216ENST00000492723 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa10.6□□□□□ -0.71
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TOM1-216ENST00000492723 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.53□□□□□ -0.72
TOM1-216ENST00000492723 A0A087WTM6 91 aa10.53□□□□□ -0.72
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TOM1-216ENST00000492723 Q6ZVQ6 151 aa10.52□□□□□ -0.73
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TOM1-216ENST00000492723 KMT2AQ03164 3969 aa10.52□□□□□ -0.73
TOM1-216ENST00000492723 A0A087WVE0 104 aa10.52□□□□□ -0.73
TOM1-216ENST00000492723 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
TOM1-216ENST00000492723 Q6ZR54 194 aa10.52□□□□□ -0.73
TOM1-216ENST00000492723 PANO1I0J062 215 aa10.51□□□□□ -0.73
TOM1-216ENST00000492723 DPH3Q96FX2 82 aa10.51□□□□□ -0.73
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa10.51□□□□□ -0.73
TOM1-216ENST00000492723 TGP01266 2768 aa10.5□□□□□ -0.73
TOM1-216ENST00000492723 HAMPP81172 84 aa10.5□□□□□ -0.73
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TOM1-216ENST00000492723 C9orf153Q5TBE3 101 aa10.48□□□□□ -0.73
TOM1-216ENST00000492723 HIGD2AQ9BW72 106 aa10.48□□□□□ -0.73
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TOM1-216ENST00000492723 SMIM29Q86T20 159 aa10.43□□□□□ -0.74
TOM1-216ENST00000492723 COX7CP15954 63 aa10.42□□□□□ -0.74
TOM1-216ENST00000492723 UBE2AP49459 152 aa10.41□□□□□ -0.74
TOM1-216ENST00000492723 CXCL6P80162 114 aa10.41□□□□□ -0.74
TOM1-216ENST00000492723 SCXQ7RTU7 201 aa10.41□□□□□ -0.74
TOM1-216ENST00000492723 F8WEM9 126 aa10.4□□□□□ -0.74
TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PNM2 257 aa10.4□□□□□ -0.74
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