RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 LINC00575Q6W349 94 aa18.95■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 C6orf223Q8N319 242 aa18.95■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa18.94■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 HTN3P15516 51 aa18.94■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 CYSRT1A8MQ03 144 aa18.94■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 WIPF1O43516 503 aa18.93■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 COX7CP15954 63 aa18.93■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 KLK12Q9UKR0 248 aa18.92■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 F8P00451 2351 aa18.9■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 IGLV6-57P01721 117 aa18.89■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 ENHOQ6UWT2 76 aa18.89■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 C2orf48Q96LS8 159 aa18.89■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa18.88■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 hADV29S1A0JD25 119 aa18.88■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 ATRQ13535 2644 aa18.86■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 LYPD5Q6UWN5 251 aa18.85■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 C3orf56Q8N813 242 aa18.85■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa18.83■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa18.83■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 H3BQ85 93 aa18.82■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 CRYGAP11844 174 aa18.81■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 SMIM20Q8N5G0 67 aa18.8■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 C6orf48Q9UBA6 75 aa18.8■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 A0A087WVE0 104 aa18.79■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 RBM3P98179 157 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa18.78■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 H3BNG1 76 aa18.77■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 UBL5Q9BZL1 73 aa18.77■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 USP17L23D6RBM5 183 aa18.77■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 SERP2Q8N6R1 65 aa18.77■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 SVIPQ8NHG7 77 aa18.77■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZQT0 140 aa18.76■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa18.75■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa18.74■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 DIRC1Q969H9 104 aa18.73■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa18.73■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa18.72■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZQY7 126 aa18.7■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 XAGE1AQ9HD64 81 aa18.7■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 PDE6GP18545 87 aa18.69■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa18.68■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 WFDC10BQ8IUB3 73 aa18.68■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 OXLD1Q5BKU9 147 aa18.67■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 CAMK2N2Q96S95 79 aa18.67■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 GHRHP01286 108 aa18.67■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa18.67■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 DSCR8Q96T75 97 aa18.67■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa18.66■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP10-11P60412 298 aa18.65■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 COX7BP24311 80 aa18.64■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 VPREB1P12018 145 aa18.63■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 HIGD2BQ4VC39 106 aa18.63■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 UPK3BQ9BT76 320 aa18.62■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa18.61■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 M0R378 163 aa18.59■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 C15orf56Q8N910 161 aa18.58■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZRU5 148 aa18.58■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa18.57■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZTC4 211 aa18.57■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 RETNQ9HD89 108 aa18.57■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 F8WDY8 70 aa18.55■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 CMYA5Q8N3K9 4069 aa18.55■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 M0R2N4 97 aa18.54■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZVQ6 151 aa18.53■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 CYSTM1Q9H1C7 97 aa18.53■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa18.53■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 TMEM258P61165 79 aa18.53■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 ESRGQ1W209 222 aa18.52■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 C1orf43Q9BWL3 253 aa18.52■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 BCE1O60756 84 aa18.51■□□□□ 0.55
UBP1-201ENST00000283628 LINC01556Q5JQF7 62 aa18.5■□□□□ 0.55
UBP1-201ENST00000283628 CXCL6P80162 114 aa18.49■□□□□ 0.55
UBP1-201ENST00000283628 J3KT08 172 aa18.48■□□□□ 0.55
UBP1-201ENST00000283628 LINC00528Q8N1L1 170 aa18.48■□□□□ 0.55
UBP1-201ENST00000283628 HAMPP81172 84 aa18.46■□□□□ 0.55
UBP1-201ENST00000283628 RPS28P62857 69 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
UBP1-201ENST00000283628 BAHCC1Q9P281 2608 aa18.43■□□□□ 0.54
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZRP5 223 aa18.43■□□□□ 0.54
UBP1-201ENST00000283628 DNAH3Q8TD57 4116 aa18.42■□□□□ 0.54
UBP1-201ENST00000283628 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa18.42■□□□□ 0.54
UBP1-201ENST00000283628 SYCNQ0VAF6 134 aa18.41■□□□□ 0.54
UBP1-201ENST00000283628 STAB1Q9NY15 2570 aa18.4■□□□□ 0.54
UBP1-201ENST00000283628 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa18.4■□□□□ 0.54
UBP1-201ENST00000283628 TRAV7A0A075B6U4 112 aa18.36■□□□□ 0.53
UBP1-201ENST00000283628 C11orf45Q8TAV5 145 aa18.36■□□□□ 0.53
UBP1-201ENST00000283628 KCNQ1DNQ9H478 68 aa18.34■□□□□ 0.53
UBP1-201ENST00000283628 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa18.34■□□□□ 0.53
UBP1-201ENST00000283628 DNAH10OSP0CZ25 163 aa18.34■□□□□ 0.53
UBP1-201ENST00000283628 NKAPP1Q8N9T2 125 aa18.33■□□□□ 0.52
UBP1-201ENST00000283628 DPH3Q96FX2 82 aa18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms