RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SVS1	Q12254	260 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	RRT12	P25381	491 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	NIP100	P33420	868 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	YHL026C	P38740	315 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	LAM5	P43560	674 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	STB4	P50104	949 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	CWC24	P53769	259 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ERG5	P54781	538 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	CDD1	Q06549	142 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	OPI10	Q08202	246 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	PCD1	Q12524	340 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SWI6	P09959	803 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	DAL2	P25335	343 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SWI3	P32591	825 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	CSE2	P33308	149 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	AGP2	P38090	596 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	YAP1801	P38856	637 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	CCC2	P38995	1004 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SDS3	P40505	327 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	DAS1	P47005	663 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SHE10	P53075	577 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	BI4	P03879	638 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	RAD57	P25301	460 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	FUB1	P25659	250 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	TRM2	P33753	639 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	HEL1	P36113	551 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	JNM1	P36224	373 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	LAM1	P38851	1228 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	FTR1	P40088	404 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SEC9	P40357	651 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	SIL1	Q08199	421 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	GIS3	Q12418	502 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	ECM3	Q99252	613 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPQ1	YPL179W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	CIT2	P08679	460 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	MTF2	P10849	440 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	DOM34	P33309	386 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	POA1	P38218	177 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	SLX1	P38324	304 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	YHR054C	P38780	354 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	MEF2	P39677	819 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	ASG7	P46993	209 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	COS5	P47187	383 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	ESBP6	P53918	673 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	FMP30	Q02883	468 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	VPS38	Q05919	439 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	ESC2	Q06340	456 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	PLP2	Q12017	286 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	CTF3	Q12748	733 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	CHS1	P08004	1131 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	PEX2	P32800	271 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	CSG2	P35206	410 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	YKL151C	P36059	337 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	EFM4	P40516	257 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	OPT1	P40897	799 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
PPQ1	YPL179W	PNG1	Q02890	363 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PPQ1	YPL179W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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