RNA–Protein interactions for RNA: YOR118W

RTC5, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RTC5, Length 1,704 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC5	YOR118W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	GIS3	Q12418	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	TRM11	Q12463	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
RTC5	YOR118W	LYP1	P32487	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	VHC1	P38329	1120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	NEM1	P38757	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SPC72	P39723	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SLS1	P42900	643 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ALY2	P47029	1046 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ATG16	Q03818	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	OSW2	Q12202	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SLP1	Q12232	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	QCR6	P00127	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	MAS2	P11914	482 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	PEP5	P12868	1029 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SFL1	P20134	766 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ECM1	P39715	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	TMN3	P40071	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	FTR1	P40088	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	TRS85	P46944	698 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	TIM54	P47045	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	YGR130C	P53278	816 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	RNT1	Q02555	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	CIT2	P08679	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	POL3	P15436	1097 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	HEM15	P16622	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	AEP2	P22136	580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	MKK2	P32491	506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	PPG1	P32838	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SEG2	P34250	1132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ADD66	P36040	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	YBR062C	P38239	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ATG14	P38270	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	MED8	P38304	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SAK1	P38990	1142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	YMR134W	P40207	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	TED1	P40533	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
RTC5	YOR118W	MDR1	P53258	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ECM7	Q06200	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ADH4	P10127	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	POX1	P13711	748 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	AGP1	P25376	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	YCR051W	P25631	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	PRR1	P28708	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	DPH2	P32461	534 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ALG14	P38242	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	MMS4	P38257	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	YBP1	P38315	674 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	MRX1	P40050	688 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	KHA1	P40309	873 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	INA22	P40576	216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	YJL045W	P47052	634 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	GCV1	P48015	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	ZIP2	P53061	704 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	CDD1	Q06549	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
RTC5	YOR118W	MCA1	Q08601	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	HIF1	Q12373	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	RRD2	Q12461	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	GAL10	P04397	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SAC7	P17121	654 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	MRP4	P32902	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SPC42	P36094	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	AGP2	P38090	596 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	DUG2	P38149	878 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SEA4	P38164	1038 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	AIM21	P40563	679 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.3 ms