RNA–Protein interactions for RNA: YOL087C

DUF1, Transcript of Ubiquitin-binding protein of unknown function, yeast

Gene DUF1, Length 3,351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DUF1	YOL087C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YIL077C	P40508	320 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	TEL2	P53038	688 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	VPS75	P53853	264 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	EOS1	P53938	366 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ARP5	P53946	755 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ECM18	Q04623	453 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YPR027C	Q12079	277 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	PCD1	Q12524	340 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	PUT4	P15380	627 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	KIP1	P28742	1111 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	SRB4	P32569	687 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	DOA4	P32571	926 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	AFR1	P33304	620 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	HEL1	P36113	551 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ECM4	P36156	370 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	RGD1	P38339	666 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	PIH1	P38768	344 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MET12	P46151	657 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
DUF1	YOL087C	YJL045W	P47052	634 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ADA2	Q02336	434 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	SAP190	P36123	1033 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YDR089W	P38966	869 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	LYS14	P40971	790 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	DSD1	P53095	428 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	FCP1	Q03254	732 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	RSC3	Q06639	885 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	CIR2	Q08822	631 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	HMI1	Q12039	706 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	TY3A-G	Q12173	290 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	TY3A-I	Q99219	290 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	CTF13	P35203	478 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MRPL40	P36534	297 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	APM3	P38153	483 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	FAT1	P38225	669 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	not detected
DUF1	YOL087C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	GYP8	P43570	497 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ALT1	P52893	592 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	SAP4	P53036	818 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YBP2	P53169	641 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	RTC4	P53850	401 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ATP25	Q03153	612 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	OMS1	Q06668	471 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YOR352W	Q08816	343 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	TPK1	P06244	397 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	POL3	P15436	1097 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	CLN1	P20437	546 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	STE11	P23561	717 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	STE13	P33894	931 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	OAF3	P36023	863 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MSG5	P38590	489 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YHR202W	P38887	602 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	HFM1	P51979	1187 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	INP2	Q03824	705 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	AIM32	Q04689	311 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	SNO4	Q04902	237 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MSC3	Q05812	728 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MMR1	Q06324	491 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ARR1	Q06596	294 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	GUP2	Q08929	609 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	HSP32	Q08992	237 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	VPS54	Q12071	889 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	DCS2	Q12123	353 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	AVL9	Q12500	764 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	GCN4	P03069	281 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YKL107W	P34251	309 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YKR018C	P36114	725 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	SKN7	P38889	622 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	AKR1	P39010	764 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ATF1	P40353	525 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	UBP7	P40453	1071 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	MNT4	P53745	580 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	GIM3	P53900	129 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YPR071W	Q12346	211 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	SWI6	P09959	803 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	YSW1	P38280	609 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	EFM2	P38347	419 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DUF1	YOL087C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91

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