RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	BMT6	Q12291	365 aa		7.41	□□□□□ -1.22
YLR224W	YLR224W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
YLR224W	YLR224W	SEC61	P32915	480 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YLR224W	YLR224W	YEL023C	P39992	682 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YLR224W	YLR224W	NST1	P53935	1240 aa		7.38	□□□□□ -1.23
YLR224W	YLR224W	PTC4	P38089	393 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YLR224W	YLR224W	ATH1	P48016	1211 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YLR224W	YLR224W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
YLR224W	YLR224W	JIP4	Q03361	876 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YLR224W	YLR224W	YDR344C	Q05510	147 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YLR224W	YLR224W	GUT1	P32190	709 aa		7.34	□□□□□ -1.23
YLR224W	YLR224W	SAP30	P38429	201 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YLR224W	YLR224W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
YLR224W	YLR224W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
YLR224W	YLR224W	YDL129W	Q07555	291 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YLR224W	YLR224W	MID1	P41821	548 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YLR224W	YLR224W	PML39	Q03760	334 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YLR224W	YLR224W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
YLR224W	YLR224W	YGR273C	P53329	174 aa		7.23	□□□□□ -1.25
YLR224W	YLR224W	MPH3	P0CE00	602 aa		7.22	□□□□□ -1.25
YLR224W	YLR224W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
YLR224W	YLR224W	AI4	P03878	556 aa		7.18	□□□□□ -1.26
YLR224W	YLR224W	PRE3	P38624	215 aa		7.15	□□□□□ -1.26
YLR224W	YLR224W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
YLR224W	YLR224W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
YLR224W	YLR224W	SLI15	P38283	698 aa		7.12	□□□□□ -1.27
YLR224W	YLR224W	PEX29	Q03370	554 aa		7.12	□□□□□ -1.27
YLR224W	YLR224W	KEX1	P09620	729 aa		7.11	□□□□□ -1.27
YLR224W	YLR224W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
YLR224W	YLR224W	VHR2	P40041	505 aa		7.09	□□□□□ -1.27
YLR224W	YLR224W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
YLR224W	YLR224W	ARH1	P48360	493 aa		7.08	□□□□□ -1.28
YLR224W	YLR224W	MPC54	Q08550	464 aa		7.07	□□□□□ -1.28
YLR224W	YLR224W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.05	□□□□□ -1.28	RIP-Chip
YLR224W	YLR224W	BCK2	P33306	851 aa		7.03	□□□□□ -1.28
YLR224W	YLR224W	CDC73	Q06697	393 aa		7.03	□□□□□ -1.28
YLR224W	YLR224W	VRP1	P37370	817 aa		7.02	□□□□□ -1.29
YLR224W	YLR224W	NMA111	P53920	997 aa		7.02	□□□□□ -1.29
YLR224W	YLR224W	YDR090C	Q03193	310 aa		7.02	□□□□□ -1.29
YLR224W	YLR224W	YPR148C	Q06523	435 aa		7.01	□□□□□ -1.29
YLR224W	YLR224W	HAP5	Q02516	242 aa		7	□□□□□ -1.29
YLR224W	YLR224W	SPT23	P35210	1082 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YLR224W	YLR224W	VPS70	P47161	811 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YLR224W	YLR224W	DPL1	Q05567	589 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YLR224W	YLR224W	DMA1	P38823	416 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YLR224W	YLR224W	RAD54	P32863	898 aa		6.95	□□□□□ -1.3
YLR224W	YLR224W	YPR015C	Q12531	247 aa		6.95	□□□□□ -1.3
YLR224W	YLR224W	RAM1	P22007	431 aa		6.93	□□□□□ -1.3
YLR224W	YLR224W	BNI4	P53858	892 aa		6.93	□□□□□ -1.3
YLR224W	YLR224W	PDR1	P12383	1068 aa		6.92	□□□□□ -1.3
YLR224W	YLR224W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
YLR224W	YLR224W	IFH1	P39520	1085 aa		6.91	□□□□□ -1.3
YLR224W	YLR224W	ISU2	Q12056	156 aa		6.91	□□□□□ -1.3
YLR224W	YLR224W	XDJ1	P39102	459 aa		6.9	□□□□□ -1.3
YLR224W	YLR224W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
YLR224W	YLR224W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
YLR224W	YLR224W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	6.85	□□□□□ -1.31
YLR224W	YLR224W	COX6	P00427	148 aa		6.83	□□□□□ -1.32
YLR224W	YLR224W	KIC1	P38692	1080 aa		6.83	□□□□□ -1.32
YLR224W	YLR224W	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	6.82	□□□□□ -1.32
YLR224W	YLR224W	ORC6	P38826	435 aa		6.81	□□□□□ -1.32
YLR224W	YLR224W	YRR1	Q12172	810 aa		6.8	□□□□□ -1.32
YLR224W	YLR224W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	6.79	□□□□□ -1.32
YLR224W	YLR224W	PBS2	P08018	668 aa		6.77	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	SDH2	P21801	266 aa		6.76	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	6.75	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	6.75	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	STR2	P47164	639 aa		6.75	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	ISM1	P48526	1002 aa		6.75	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	6.75	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	6.75	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	RAS1	P01119	309 aa		6.74	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	RGR1	P19263	1082 aa		6.74	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	CSC1	Q06538	782 aa		6.74	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	PEX21	P50091	288 aa		6.73	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	CKB1	P43639	278 aa		6.72	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	YPR109W	Q06104	294 aa		6.72	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
YLR224W	YLR224W	TFB4	Q12004	338 aa		6.71	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	GYP1	Q08484	637 aa		6.7	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	NUD1	P32336	851 aa		6.69	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	SEC2	P17065	759 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	SRC1	Q03707	834 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YLR224W	YLR224W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.3 ms