RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W ABP1P15891 592 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PIR3YKL163W YEL023CP39992 682 aa7.91□□□□□ -1.14
PIR3YKL163W JIP4Q03361 876 aa7.91□□□□□ -1.14
PIR3YKL163W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PIR3YKL163W PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PIR3YKL163W SAP30P38429 201 aa7.88□□□□□ -1.15
PIR3YKL163W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PIR3YKL163W PTC4P38089 393 aa7.87□□□□□ -1.15
PIR3YKL163W COQ8P27697 501 aa7.86□□□□□ -1.15
PIR3YKL163W ATH1P48016 1211 aa7.84□□□□□ -1.15
PIR3YKL163W YDL129WQ07555 291 aa7.83□□□□□ -1.16
PIR3YKL163W INO80P53115 1489 aa7.81□□□□□ -1.16
PIR3YKL163W GUT1P32190 709 aa7.8□□□□□ -1.16
PIR3YKL163W PML39Q03760 334 aa7.77□□□□□ -1.17
PIR3YKL163W SOL3P38858 249 aa7.76□□□□□ -1.17
PIR3YKL163W NST1P53935 1240 aa7.76□□□□□ -1.17
PIR3YKL163W YDR344CQ05510 147 aa7.76□□□□□ -1.17
PIR3YKL163W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PIR3YKL163W PRE3P38624 215 aa7.71□□□□□ -1.18
PIR3YKL163W MID1P41821 548 aa7.71□□□□□ -1.18
PIR3YKL163W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PIR3YKL163W ILV3P39522 585 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PIR3YKL163W MPH3P0CE00 602 aa7.66□□□□□ -1.18
PIR3YKL163W AI4P03878 556 aa7.64□□□□□ -1.19
PIR3YKL163W BCK2P33306 851 aa7.64□□□□□ -1.19
PIR3YKL163W YGR273CP53329 174 aa7.63□□□□□ -1.19
PIR3YKL163W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PIR3YKL163W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PIR3YKL163W SET1P38827 1080 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PIR3YKL163W ARH1P48360 493 aa7.58□□□□□ -1.2
PIR3YKL163W PEX29Q03370 554 aa7.58□□□□□ -1.2
PIR3YKL163W VRP1P37370 817 aa7.56□□□□□ -1.2
PIR3YKL163W SLI15P38283 698 aa7.52□□□□□ -1.21
PIR3YKL163W MPC54Q08550 464 aa7.52□□□□□ -1.21
PIR3YKL163W HAP5Q02516 242 aa7.5□□□□□ -1.21
PIR3YKL163W KEX1P09620 729 aa7.49□□□□□ -1.21
PIR3YKL163W SPT23P35210 1082 aa7.48□□□□□ -1.21
PIR3YKL163W TAF7Q05021 590 aa7.48□□□□□ -1.21
PIR3YKL163W XDJ1P39102 459 aa7.46□□□□□ -1.22
PIR3YKL163W VHR2P40041 505 aa7.46□□□□□ -1.22
PIR3YKL163W NMA111P53920 997 aa7.46□□□□□ -1.22
PIR3YKL163W UBP14P38237 781 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PIR3YKL163W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PIR3YKL163W BNI4P53858 892 aa7.43□□□□□ -1.22
PIR3YKL163W DPL1Q05567 589 aa7.43□□□□□ -1.22
PIR3YKL163W CDC73Q06697 393 aa7.42□□□□□ -1.22
PIR3YKL163W DNA2P38859 1522 aa7.41□□□□□ -1.22
PIR3YKL163W PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PIR3YKL163W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data7.39□□□□□ -1.23not detected
PIR3YKL163W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PIR3YKL163W RAD54P32863 898 aa7.35□□□□□ -1.23
PIR3YKL163W YPR015CQ12531 247 aa7.35□□□□□ -1.23
PIR3YKL163W ISU2Q12056 156 aa7.34□□□□□ -1.23
PIR3YKL163W DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PIR3YKL163W YDR090CQ03193 310 aa7.33□□□□□ -1.24
PIR3YKL163W RAM1P22007 431 aa7.32□□□□□ -1.24
PIR3YKL163W SWR1Q05471 1514 aa7.31□□□□□ -1.24
PIR3YKL163W PDR1P12383 1068 aa7.3□□□□□ -1.24
PIR3YKL163W IFH1P39520 1085 aa7.3□□□□□ -1.24
PIR3YKL163W YPR148CQ06523 435 aa7.3□□□□□ -1.24
PIR3YKL163W VPS70P47161 811 aa7.27□□□□□ -1.25
PIR3YKL163W REF2P42073 533 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PIR3YKL163W KOG1P38873 1557 aa7.25□□□□□ -1.25
PIR3YKL163W KIC1P38692 1080 aa7.25□□□□□ -1.25
PIR3YKL163W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PIR3YKL163W GYP1Q08484 637 aa7.2□□□□□ -1.26
PIR3YKL163W YRR1Q12172 810 aa7.2□□□□□ -1.26
PIR3YKL163W RAS1P01119 309 aa7.19□□□□□ -1.26
PIR3YKL163W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PIR3YKL163W SRC1Q03707 834 aa7.18□□□□□ -1.26
PIR3YKL163W DMA1P38823 416 aa7.17□□□□□ -1.26
PIR3YKL163W PEX21P50091 288 aa7.17□□□□□ -1.26
PIR3YKL163W ORC6P38826 435 aa7.16□□□□□ -1.26
PIR3YKL163W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PIR3YKL163W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PIR3YKL163W COX6P00427 148 aa7.14□□□□□ -1.27
PIR3YKL163W SDH2P21801 266 aa7.14□□□□□ -1.27
PIR3YKL163W CSC1Q06538 782 aa7.14□□□□□ -1.27
PIR3YKL163W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PIR3YKL163W STR2P47164 639 aa7.12□□□□□ -1.27
PIR3YKL163W TFB4Q12004 338 aa7.12□□□□□ -1.27
PIR3YKL163W ISM1P48526 1002 aa7.11□□□□□ -1.27
PIR3YKL163W TY1B-DR4Q07793 1604 aa7.1□□□□□ -1.27
PIR3YKL163W NUD1P32336 851 aa7.1□□□□□ -1.27
PIR3YKL163W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PIR3YKL163W SAS4Q04003 481 aa7.09□□□□□ -1.27
PIR3YKL163W AMS1P22855 1083 aa7.08□□□□□ -1.28
PIR3YKL163W MVP1P40959 511 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PIR3YKL163W PRT1P06103 763 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PIR3YKL163W PBS2P08018 668 aa7.05□□□□□ -1.28
PIR3YKL163W RGR1P19263 1082 aa7.05□□□□□ -1.28
PIR3YKL163W YPR109WQ06104 294 aa7.04□□□□□ -1.28
PIR3YKL163W TY1A-DR4O74302 440 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-AP0CX57 440 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-PR1P0CX58 440 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-ORP0CX59 440 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-PR2P0CX60 440 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-DR5P0CX65 440 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-ER2P0CX66 440 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.1 ms