RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeastyeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2YHR167W YEL023CP39992 682 aa8.04□□□□□ -1.12
THP2YHR167W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
THP2YHR167W RAM2P29703 316 aa8.03□□□□□ -1.12
THP2YHR167W YDL129WQ07555 291 aa8.01□□□□□ -1.13
THP2YHR167W MIF2P35201 549 aa8□□□□□ -1.13
THP2YHR167W EDS1P38073 919 aa8□□□□□ -1.13
THP2YHR167W MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
THP2YHR167W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
THP2YHR167W PTC4P38089 393 aa7.97□□□□□ -1.13
THP2YHR167W YDR344CQ05510 147 aa7.97□□□□□ -1.13
THP2YHR167W PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
THP2YHR167W PRE3P38624 215 aa7.91□□□□□ -1.14
THP2YHR167W ATH1P48016 1211 aa7.91□□□□□ -1.14
THP2YHR167W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
THP2YHR167W COQ8P27697 501 aa7.89□□□□□ -1.15
THP2YHR167W BCK2P33306 851 aa7.89□□□□□ -1.15
THP2YHR167W PML39Q03760 334 aa7.89□□□□□ -1.15
THP2YHR167W GUT1P32190 709 aa7.87□□□□□ -1.15
THP2YHR167W NST1P53935 1240 aa7.87□□□□□ -1.15
THP2YHR167W SOL3P38858 249 aa7.84□□□□□ -1.15
THP2YHR167W MID1P41821 548 aa7.82□□□□□ -1.16
THP2YHR167W ILV3P39522 585 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
THP2YHR167W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
THP2YHR167W SET1P38827 1080 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
THP2YHR167W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
THP2YHR167W VRP1P37370 817 aa7.75□□□□□ -1.17
THP2YHR167W MPH3P0CE00 602 aa7.74□□□□□ -1.17
THP2YHR167W AI4P03878 556 aa7.73□□□□□ -1.17
THP2YHR167W ARH1P48360 493 aa7.72□□□□□ -1.17
THP2YHR167W PEX29Q03370 554 aa7.71□□□□□ -1.18
THP2YHR167W YGR273CP53329 174 aa7.69□□□□□ -1.18
THP2YHR167W YPR148CQ06523 435 aa7.69□□□□□ -1.18
THP2YHR167W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
THP2YHR167W XDJ1P39102 459 aa7.66□□□□□ -1.18
THP2YHR167W IFH1P39520 1085 aa7.63□□□□□ -1.19
THP2YHR167W HAP5Q02516 242 aa7.63□□□□□ -1.19
THP2YHR167W MPC54Q08550 464 aa7.63□□□□□ -1.19
THP2YHR167W SPT23P35210 1082 aa7.62□□□□□ -1.19
THP2YHR167W VPS70P47161 811 aa7.61□□□□□ -1.19
THP2YHR167W SLI15P38283 698 aa7.6□□□□□ -1.19
THP2YHR167W DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
THP2YHR167W BNI4P53858 892 aa7.57□□□□□ -1.2
THP2YHR167W KEX1P09620 729 aa7.54□□□□□ -1.2
THP2YHR167W PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
THP2YHR167W CKB1P43639 278 aa7.53□□□□□ -1.2
THP2YHR167W NMA111P53920 997 aa7.53□□□□□ -1.2
THP2YHR167W DPL1Q05567 589 aa7.51□□□□□ -1.21
THP2YHR167W YPR015CQ12531 247 aa7.5□□□□□ -1.21
THP2YHR167W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
THP2YHR167W VHR2P40041 505 aa7.48□□□□□ -1.21
THP2YHR167W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
THP2YHR167W CDC73Q06697 393 aa7.48□□□□□ -1.21
THP2YHR167W REF2P42073 533 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
THP2YHR167W SRC1Q03707 834 aa7.45□□□□□ -1.22
THP2YHR167W LEU3P08638 886 aa7.43□□□□□ -1.22
THP2YHR167W RAM1P22007 431 aa7.43□□□□□ -1.22
THP2YHR167W UBP14P38237 781 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
THP2YHR167W PBS2P08018 668 aa7.42□□□□□ -1.22
THP2YHR167W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
THP2YHR167W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data7.41□□□□□ -1.22not detected
THP2YHR167W DSF2P38213 736 aa7.41□□□□□ -1.22
THP2YHR167W PDR1P12383 1068 aa7.4□□□□□ -1.22
THP2YHR167W ISU2Q12056 156 aa7.4□□□□□ -1.22
THP2YHR167W YDR090CQ03193 310 aa7.39□□□□□ -1.23
THP2YHR167W RAD54P32863 898 aa7.37□□□□□ -1.23
THP2YHR167W RAS1P01119 309 aa7.36□□□□□ -1.23
THP2YHR167W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
THP2YHR167W COX6P00427 148 aa7.35□□□□□ -1.23
THP2YHR167W MAM3Q12296 706 aa7.33□□□□□ -1.24
THP2YHR167W GYP1Q08484 637 aa7.31□□□□□ -1.24
THP2YHR167W SDH2P21801 266 aa7.3□□□□□ -1.24
THP2YHR167W IES2P40154 320 aa7.3□□□□□ -1.24
THP2YHR167W NUP42P49686 430 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
THP2YHR167W KIC1P38692 1080 aa7.27□□□□□ -1.25
THP2YHR167W AMS1P22855 1083 aa7.24□□□□□ -1.25
THP2YHR167W LEO1P38439 464 aa7.24□□□□□ -1.25
THP2YHR167W YRR1Q12172 810 aa7.24□□□□□ -1.25
THP2YHR167W DIT2P21595 489 aa7.23□□□□□ -1.25
THP2YHR167W ORC6P38826 435 aa7.23□□□□□ -1.25
THP2YHR167W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
THP2YHR167W RPN1P38764 993 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
THP2YHR167W STR2P47164 639 aa7.21□□□□□ -1.26
THP2YHR167W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
THP2YHR167W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
THP2YHR167W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
THP2YHR167W ISM1P48526 1002 aa7.18□□□□□ -1.26
THP2YHR167W PEX21P50091 288 aa7.18□□□□□ -1.26
THP2YHR167W GLC3P32775 704 aa7.17□□□□□ -1.26
THP2YHR167W SAS4Q04003 481 aa7.17□□□□□ -1.26
THP2YHR167W NUD1P32336 851 aa7.16□□□□□ -1.26
THP2YHR167W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
THP2YHR167W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
THP2YHR167W TRK1P12685 1235 aa7.14□□□□□ -1.27
THP2YHR167W TFB4Q12004 338 aa7.14□□□□□ -1.27
THP2YHR167W PRT1P06103 763 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
THP2YHR167W CSC1Q06538 782 aa7.13□□□□□ -1.27
THP2YHR167W RGR1P19263 1082 aa7.12□□□□□ -1.27
THP2YHR167W AIM7Q12156 149 aa7.12□□□□□ -1.27
THP2YHR167W YEL077CQ3E7X8 1277 aa7.12□□□□□ -1.27
THP2YHR167W TY1A-DR4O74302 440 aa7.11□□□□□ -1.27
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