RNA–Protein interactions for RNA: YBL064C

PRX1, Transcript of Mitochondrial peroxiredoxin with thioredoxin peroxidase activity, yeastyeast

Gene PRX1, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRX1YBL064C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PRX1YBL064C DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PRX1YBL064C RAM2P29703 316 aa7.43□□□□□ -1.22
PRX1YBL064C SAM3Q08986 587 aa7.42□□□□□ -1.22
PRX1YBL064C RPN1P38764 993 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PRX1YBL064C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.41□□□□□ -1.22not detected
PRX1YBL064C YFR006WP43590 535 aa7.4□□□□□ -1.22
PRX1YBL064C SET1P38827 1080 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PRX1YBL064C YPR148CQ06523 435 aa7.36□□□□□ -1.23
PRX1YBL064C CKB1P43639 278 aa7.35□□□□□ -1.23
PRX1YBL064C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C VPS70P47161 811 aa7.33□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C RCR1P38212 213 aa7.32□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C VPS29P38759 282 aa7.32□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C PTC4P38089 393 aa7.31□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C IFH1P39520 1085 aa7.31□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C DMA2P53924 522 aa7.31□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C ABP1P15891 592 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C STS1P38637 319 aa7.3□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C YDR344CQ05510 147 aa7.3□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C HTA1P04911 132 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C HTA2P04912 132 aa7.29□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C SRC1Q03707 834 aa7.29□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C RTG3P38165 486 aa7.28□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C YEL023CP39992 682 aa7.28□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C GYP5Q12344 894 aa7.28□□□□□ -1.24
PRX1YBL064C MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PRX1YBL064C DCW1P36091 449 aa7.26□□□□□ -1.25
PRX1YBL064C DSF2P38213 736 aa7.2□□□□□ -1.26
PRX1YBL064C PML39Q03760 334 aa7.18□□□□□ -1.26
PRX1YBL064C PBS2P08018 668 aa7.17□□□□□ -1.26
PRX1YBL064C COQ8P27697 501 aa7.16□□□□□ -1.26
PRX1YBL064C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PRX1YBL064C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PRX1YBL064C RLF2Q12495 606 aa7.12□□□□□ -1.27
PRX1YBL064C KIN1P13185 1064 aa7.1□□□□□ -1.27
PRX1YBL064C ARH1P48360 493 aa7.1□□□□□ -1.27
PRX1YBL064C MAM3Q12296 706 aa7.08□□□□□ -1.28
PRX1YBL064C REF2P42073 533 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PRX1YBL064C MIF2P35201 549 aa7.06□□□□□ -1.28
PRX1YBL064C GLC3P32775 704 aa7.05□□□□□ -1.28
PRX1YBL064C EDS1P38073 919 aa7.05□□□□□ -1.28
PRX1YBL064C SPT23P35210 1082 aa7.04□□□□□ -1.28
PRX1YBL064C IES2P40154 320 aa7.04□□□□□ -1.28
PRX1YBL064C AIM7Q12156 149 aa7.04□□□□□ -1.28
PRX1YBL064C DIT2P21595 489 aa7.01□□□□□ -1.29
PRX1YBL064C NUP42P49686 430 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PRX1YBL064C MID1P41821 548 aa7□□□□□ -1.29
PRX1YBL064C HGH1P48362 394 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PRX1YBL064C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PRX1YBL064C COX6P00427 148 aa6.96□□□□□ -1.3
PRX1YBL064C PTC3P34221 468 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PRX1YBL064C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRX1YBL064C RAS1P01119 309 aa6.94□□□□□ -1.3
PRX1YBL064C PEX29Q03370 554 aa6.94□□□□□ -1.3
PRX1YBL064C GUA1P38625 525 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PRX1YBL064C ATF2P53296 535 aa6.92□□□□□ -1.3
PRX1YBL064C HAP5Q02516 242 aa6.91□□□□□ -1.3
PRX1YBL064C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PRX1YBL064C PTC2P39966 464 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PRX1YBL064C HPC2Q01448 625 aa6.89□□□□□ -1.31
PRX1YBL064C BNI4P53858 892 aa6.88□□□□□ -1.31
PRX1YBL064C VHR2P40041 505 aa6.87□□□□□ -1.31
PRX1YBL064C YPL062WQ02781 134 aa6.87□□□□□ -1.31
PRX1YBL064C YDR090CQ03193 310 aa6.87□□□□□ -1.31
PRX1YBL064C TRK1P12685 1235 aa6.85□□□□□ -1.31
PRX1YBL064C UBP14P38237 781 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PRX1YBL064C ATH1P48016 1211 aa6.83□□□□□ -1.32
PRX1YBL064C TFB3Q03290 321 aa6.83□□□□□ -1.32
PRX1YBL064C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PRX1YBL064C GUT1P32190 709 aa6.81□□□□□ -1.32
PRX1YBL064C KIC1P38692 1080 aa6.8□□□□□ -1.32
PRX1YBL064C NST1P53935 1240 aa6.8□□□□□ -1.32
PRX1YBL064C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PRX1YBL064C BRL1P38770 471 aa6.79□□□□□ -1.32
PRX1YBL064C YGR273CP53329 174 aa6.78□□□□□ -1.32
PRX1YBL064C SSA2P10592 639 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PRX1YBL064C RAD54P32863 898 aa6.76□□□□□ -1.33
PRX1YBL064C KEX1P09620 729 aa6.75□□□□□ -1.33
PRX1YBL064C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data6.75□□□□□ -1.33not detected
PRX1YBL064C PKC1P24583 1151 aa6.74□□□□□ -1.33
PRX1YBL064C CSN12P47130 423 aa6.74□□□□□ -1.33
PRX1YBL064C MPH3P0CE00 602 aa6.73□□□□□ -1.33
PRX1YBL064C SOL3P38858 249 aa6.73□□□□□ -1.33
PRX1YBL064C AI4P03878 556 aa6.72□□□□□ -1.33
PRX1YBL064C AMS1P22855 1083 aa6.72□□□□□ -1.33
PRX1YBL064C ORC6P38826 435 aa6.72□□□□□ -1.33
PRX1YBL064C MPC54Q08550 464 aa6.71□□□□□ -1.34
PRX1YBL064C BIM1P40013 344 aa6.69□□□□□ -1.34
PRX1YBL064C TEA1P47988 759 aa6.69□□□□□ -1.34
PRX1YBL064C NMA111P53920 997 aa6.69□□□□□ -1.34
PRX1YBL064C GLN1P32288 370 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRX1YBL064C ILV3P39522 585 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PRX1YBL064C YJL007CP47080 104 aa6.67□□□□□ -1.34
PRX1YBL064C SSA1P10591 642 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PRX1YBL064C KTR1P27810 393 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PRX1YBL064C ATG32P40458 529 aa6.66□□□□□ -1.34
PRX1YBL064C SUB2Q07478 446 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PRX1YBL064C YPR015CQ12531 247 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.9 ms