RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638937.1

ME2-208, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-208	ENST00000638937	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ME2-208	ENST00000638937	WDR97	A6NE52	1622 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ME2-208	ENST00000638937	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
ME2-208	ENST00000638937	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ME2-208	ENST00000638937	ITGAE	P38570	1179 aa		33.19	■■■□□ 2.9
ME2-208	ENST00000638937	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ME2-208	ENST00000638937	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
ME2-208	ENST00000638937	NEUROD1	Q13562	356 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ME2-208	ENST00000638937	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.15	■■■□□ 2.9
ME2-208	ENST00000638937	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.15	■■■□□ 2.9
ME2-208	ENST00000638937	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ME2-208	ENST00000638937	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ME2-208	ENST00000638937	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
ME2-208	ENST00000638937	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ME2-208	ENST00000638937	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ME2-208	ENST00000638937	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
ME2-208	ENST00000638937	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.05	■■■□□ 2.88
ME2-208	ENST00000638937	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.03	■■■□□ 2.88
ME2-208	ENST00000638937	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		33.01	■■■□□ 2.87
ME2-208	ENST00000638937	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33	■■■□□ 2.87
ME2-208	ENST00000638937	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33	■■■□□ 2.87
ME2-208	ENST00000638937	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
ME2-208	ENST00000638937	MIER1	Q8N108	512 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ME2-208	ENST00000638937	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.97	■■■□□ 2.87
ME2-208	ENST00000638937	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
ME2-208	ENST00000638937	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.88	■■■□□ 2.85
ME2-208	ENST00000638937	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.88	■■■□□ 2.85
ME2-208	ENST00000638937	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.88	■■■□□ 2.85
ME2-208	ENST00000638937	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
ME2-208	ENST00000638937	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ME2-208	ENST00000638937	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.85	■■■□□ 2.85
ME2-208	ENST00000638937	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
ME2-208	ENST00000638937	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.76	■■■□□ 2.84
ME2-208	ENST00000638937	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		32.75	■■■□□ 2.83
ME2-208	ENST00000638937	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.7	■■■□□ 2.83
ME2-208	ENST00000638937	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.69	■■■□□ 2.82
ME2-208	ENST00000638937	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.69	■■■□□ 2.82
ME2-208	ENST00000638937	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.68	■■■□□ 2.82
ME2-208	ENST00000638937	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.67	■■■□□ 2.82
ME2-208	ENST00000638937	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ME2-208	ENST00000638937	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
ME2-208	ENST00000638937	ADAMTS12	P58397	1594 aa		32.57	■■■□□ 2.8
ME2-208	ENST00000638937	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.57	■■■□□ 2.8
ME2-208	ENST00000638937	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.56	■■■□□ 2.8
ME2-208	ENST00000638937	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.51	■■■□□ 2.8
ME2-208	ENST00000638937	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.51	■■■□□ 2.79
ME2-208	ENST00000638937	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
ME2-208	ENST00000638937	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.51	■■■□□ 2.79
ME2-208	ENST00000638937	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.5	■■■□□ 2.79
ME2-208	ENST00000638937	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ME2-208	ENST00000638937	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
ME2-208	ENST00000638937	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ME2-208	ENST00000638937	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ME2-208	ENST00000638937	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ME2-208	ENST00000638937	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ME2-208	ENST00000638937	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ME2-208	ENST00000638937	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ME2-208	ENST00000638937	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ME2-208	ENST00000638937	WDR62	O43379	1518 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ME2-208	ENST00000638937	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
ME2-208	ENST00000638937	NAIP	Q13075	1403 aa		32.32	■■■□□ 2.77
ME2-208	ENST00000638937	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.32	■■■□□ 2.76
ME2-208	ENST00000638937	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
ME2-208	ENST00000638937	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ME2-208	ENST00000638937	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ME2-208	ENST00000638937	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
ME2-208	ENST00000638937	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
ME2-208	ENST00000638937	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
ME2-208	ENST00000638937	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		32.2	■■■□□ 2.75
ME2-208	ENST00000638937	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.18	■■■□□ 2.74
ME2-208	ENST00000638937	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.18	■■■□□ 2.74
ME2-208	ENST00000638937	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
ME2-208	ENST00000638937	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.16	■■■□□ 2.74
ME2-208	ENST00000638937	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.16	■■■□□ 2.74
ME2-208	ENST00000638937	GRIN2A	Q12879	1464 aa		32.16	■■■□□ 2.74
ME2-208	ENST00000638937	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.14	■■■□□ 2.74
ME2-208	ENST00000638937	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ME2-208	ENST00000638937	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ME2-208	ENST00000638937	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
ME2-208	ENST00000638937	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
ME2-208	ENST00000638937	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ME2-208	ENST00000638937	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
ME2-208	ENST00000638937	KDM6B	O15054	1643 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ME2-208	ENST00000638937	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ME2-208	ENST00000638937	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ME2-208	ENST00000638937	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ME2-208	ENST00000638937	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
ME2-208	ENST00000638937	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
ME2-208	ENST00000638937	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ME2-208	ENST00000638937	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ME2-208	ENST00000638937	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.95	■■■□□ 2.71
ME2-208	ENST00000638937	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
ME2-208	ENST00000638937	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.93	■■■□□ 2.7
ME2-208	ENST00000638937	DAPK1	P53355	1430 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ME2-208	ENST00000638937	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
ME2-208	ENST00000638937	FBLN2	P98095	1184 aa		31.88	■■■□□ 2.69
ME2-208	ENST00000638937	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
ME2-208	ENST00000638937	ABCC5	O15440	1437 aa		31.86	■■■□□ 2.69
ME2-208	ENST00000638937	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		31.86	■■■□□ 2.69
ME2-208	ENST00000638937	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69

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