RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629178.2

PCBP1-AS1-338, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 517 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 AKT1S1Q96B36 256 aa9.06□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.02□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 FAM212AQ96EL1 285 aa9.01□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CREBZFQ9NS37 354 aa9.01□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PRR29P0C7W0 189 aa8.99□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.99□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.99□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 STK25O00506 426 aa8.94□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.94□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 RASEFQ8IZ41 740 aa8.93□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 NBR1Q14596 966 aa8.92□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 STK24Q9Y6E0 443 aa8.86□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PITPNM1O00562 1244 aa8.85□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PYGBP11216 843 aa8.85□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 P3H3Q8IVL6 736 aa8.73□□□□□ -1.01
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CHADLQ6NUI6 762 aa8.72□□□□□ -1.01
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.68□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.66□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.66□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.65□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PSEN1P49768 467 aa8.64□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 MFRPQ9BY79 579 aa8.64□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 WDR70Q9NW82 654 aa8.64□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.63□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 IFNL1Q8IU54 200 aa8.57□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.56□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SOX12O15370 315 aa8.55□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 NLRP6P59044 892 aa8.55□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.55□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.54□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 KIF12Q96FN5 646 aa8.54□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 MAP3K13O43283 966 aa8.53□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PPP1R37O75864 691 aa8.53□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CABP2Q9NPB3 220 aa8.53□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.51□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 E2F4Q16254 413 aa8.5□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.49□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.47□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.44□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 MFSD10Q14728 455 aa8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PDE4AP27815 886 aa8.42□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SEMA3EO15041 775 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 GOLGA2Q08379 1002 aa8.39□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PHF12Q96QT6 1004 aa8.39□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.37□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CAMK2BQ13554 666 aa8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 TRPC6Q9Y210 931 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ZMYND10O75800 440 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 TIE1P35590 1138 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 NEUROD2Q15784 382 aa8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.28□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.27□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.27□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 BARGINQ6ZT62 677 aa8.25□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.094e-7■■□□□ 11.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms