RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622814.4

IRX4-208, Transcript of iroquois homeobox 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene IRX4, Length 2,398 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4-208ENST00000622814 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.81■■■□□ 2.36
IRX4-208ENST00000622814 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.81■■■□□ 2.36
IRX4-208ENST00000622814 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
IRX4-208ENST00000622814 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
IRX4-208ENST00000622814 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.77■■■□□ 2.36
IRX4-208ENST00000622814 MAP3K1Q13233 1512 aa29.76■■■□□ 2.35
IRX4-208ENST00000622814 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.75■■■□□ 2.35
IRX4-208ENST00000622814 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.72■■■□□ 2.35
IRX4-208ENST00000622814 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.71■■■□□ 2.35
IRX4-208ENST00000622814 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.68■■■□□ 2.34
IRX4-208ENST00000622814 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.68■■■□□ 2.34
IRX4-208ENST00000622814 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
IRX4-208ENST00000622814 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.67■■■□□ 2.34
IRX4-208ENST00000622814 CUL7Q14999 1698 aa29.65■■■□□ 2.34
IRX4-208ENST00000622814 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
IRX4-208ENST00000622814 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.63■■■□□ 2.33
IRX4-208ENST00000622814 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.62■■■□□ 2.33
IRX4-208ENST00000622814 WDR97A6NE52 1622 aa29.6■■■□□ 2.33
IRX4-208ENST00000622814 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
IRX4-208ENST00000622814 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.56■■■□□ 2.32
IRX4-208ENST00000622814 MAPKBP1O60336 1514 aa29.55■■■□□ 2.32
IRX4-208ENST00000622814 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.54■■■□□ 2.32
IRX4-208ENST00000622814 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.54■■■□□ 2.32
IRX4-208ENST00000622814 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.52■■■□□ 2.32
IRX4-208ENST00000622814 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.49■■■□□ 2.31
IRX4-208ENST00000622814 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.48■■■□□ 2.31
IRX4-208ENST00000622814 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.46■■■□□ 2.31
IRX4-208ENST00000622814 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.3
IRX4-208ENST00000622814 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.43■■■□□ 2.3
IRX4-208ENST00000622814 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.4■■■□□ 2.3
IRX4-208ENST00000622814 FMN1Q68DA7 1419 aa29.4■■■□□ 2.3
IRX4-208ENST00000622814 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.39■■■□□ 2.29
IRX4-208ENST00000622814 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.37■■■□□ 2.29
IRX4-208ENST00000622814 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
IRX4-208ENST00000622814 SAMD9Q5K651 1589 aa29.34■■■□□ 2.29
IRX4-208ENST00000622814 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.31■■■□□ 2.28
IRX4-208ENST00000622814 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.3■■■□□ 2.28
IRX4-208ENST00000622814 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
IRX4-208ENST00000622814 GRIN2BQ13224 1484 aa29.23■■■□□ 2.27
IRX4-208ENST00000622814 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.22■■■□□ 2.27
IRX4-208ENST00000622814 PTPRKQ15262 1439 aa29.19■■■□□ 2.26
IRX4-208ENST00000622814 PBRM1Q86U86 1689 aa29.18■■■□□ 2.26
IRX4-208ENST00000622814 NCOA2Q15596 1464 aa29.18■■■□□ 2.26
IRX4-208ENST00000622814 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
IRX4-208ENST00000622814 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.11■■■□□ 2.25
IRX4-208ENST00000622814 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.11■■■□□ 2.25
IRX4-208ENST00000622814 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.11■■■□□ 2.25
IRX4-208ENST00000622814 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
IRX4-208ENST00000622814 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.08■■■□□ 2.25
IRX4-208ENST00000622814 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
IRX4-208ENST00000622814 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.06■■■□□ 2.24
IRX4-208ENST00000622814 KCNH8Q96L42 1107 aa29.06■■■□□ 2.24
IRX4-208ENST00000622814 HFM1A2PYH4 1435 aa29.05■■■□□ 2.24
IRX4-208ENST00000622814 ARID3CA6NKF2 412 aa29.04■■■□□ 2.24
IRX4-208ENST00000622814 ADAMTS12P58397 1594 aa29.04■■■□□ 2.24
IRX4-208ENST00000622814 IQGAP2Q13576 1575 aa29.03■■■□□ 2.24
IRX4-208ENST00000622814 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
IRX4-208ENST00000622814 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.02■■■□□ 2.24
IRX4-208ENST00000622814 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.02■■■□□ 2.24
IRX4-208ENST00000622814 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
IRX4-208ENST00000622814 NAIPQ13075 1403 aa29■■■□□ 2.23
IRX4-208ENST00000622814 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.98■■■□□ 2.23
IRX4-208ENST00000622814 UACAQ9BZF9 1416 aa28.97■■■□□ 2.23
IRX4-208ENST00000622814 HECW1Q76N89 1606 aa28.96■■■□□ 2.23
IRX4-208ENST00000622814 ARHGEF11O15085 1522 aa28.96■■■□□ 2.23
IRX4-208ENST00000622814 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
IRX4-208ENST00000622814 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
IRX4-208ENST00000622814 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.96■■■□□ 2.23
IRX4-208ENST00000622814 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.94■■■□□ 2.22
IRX4-208ENST00000622814 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
IRX4-208ENST00000622814 TONSLQ96HA7 1378 aa28.93■■■□□ 2.22
IRX4-208ENST00000622814 WDR62O43379 1518 aa28.86■■■□□ 2.21
IRX4-208ENST00000622814 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
IRX4-208ENST00000622814 IFT140Q96RY7 1462 aa28.81■■■□□ 2.2
IRX4-208ENST00000622814 KDM6BO15054 1643 aa28.81■■■□□ 2.2
IRX4-208ENST00000622814 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.77■■■□□ 2.2
IRX4-208ENST00000622814 TRIM52Q96A61 297 aa28.77■■■□□ 2.2
IRX4-208ENST00000622814 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.2
IRX4-208ENST00000622814 DISP1Q96F81 1524 aa28.73■■■□□ 2.19
IRX4-208ENST00000622814 KIAA0556O60303 1618 aa28.73■■■□□ 2.19
IRX4-208ENST00000622814 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
IRX4-208ENST00000622814 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.72■■■□□ 2.19
IRX4-208ENST00000622814 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
IRX4-208ENST00000622814 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.71■■■□□ 2.19
IRX4-208ENST00000622814 MIA2Q96PC5 1412 aa28.69■■■□□ 2.18
IRX4-208ENST00000622814 GRIN2AQ12879 1464 aa28.67■■■□□ 2.18
IRX4-208ENST00000622814 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
IRX4-208ENST00000622814 FOXD1Q16676 465 aa28.65■■■□□ 2.18
IRX4-208ENST00000622814 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
IRX4-208ENST00000622814 ANP32CO43423 234 aa28.62■■■□□ 2.17
IRX4-208ENST00000622814 AKNAQ7Z591 1439 aa28.62■■■□□ 2.17
IRX4-208ENST00000622814 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.62■■■□□ 2.17
IRX4-208ENST00000622814 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.61■■■□□ 2.17
IRX4-208ENST00000622814 ERCC6Q03468 1493 aa28.59■■■□□ 2.17
IRX4-208ENST00000622814 DAPK1P53355 1430 aa28.58■■■□□ 2.17
IRX4-208ENST00000622814 FBLN2P98095 1184 aa28.56■■■□□ 2.16
IRX4-208ENST00000622814 ABCC5O15440 1437 aa28.54■■■□□ 2.16
IRX4-208ENST00000622814 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
IRX4-208ENST00000622814 CEP170Q5SW79 1584 aa28.53■■■□□ 2.16
IRX4-208ENST00000622814 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.8 ms