RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
SMTN-222	ENST00000612341	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SMTN-222	ENST00000612341	PRDM2	Q13029	1718 aa		18.83	■□□□□ 0.61
SMTN-222	ENST00000612341	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		18.81	■□□□□ 0.6
SMTN-222	ENST00000612341	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SMTN-222	ENST00000612341	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
SMTN-222	ENST00000612341	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SMTN-222	ENST00000612341	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SMTN-222	ENST00000612341	TOPBP1	Q92547	1522 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SMTN-222	ENST00000612341	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
SMTN-222	ENST00000612341	TIAM1	Q13009	1591 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SMTN-222	ENST00000612341	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SMTN-222	ENST00000612341	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SMTN-222	ENST00000612341	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SMTN-222	ENST00000612341	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SMTN-222	ENST00000612341	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
SMTN-222	ENST00000612341	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		18.66	■□□□□ 0.58
SMTN-222	ENST00000612341	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
SMTN-222	ENST00000612341	ARID3C	A6NKF2	412 aa		18.61	■□□□□ 0.57
SMTN-222	ENST00000612341	MAP3K1	Q13233	1512 aa		18.6	■□□□□ 0.57
SMTN-222	ENST00000612341	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		18.59	■□□□□ 0.57
SMTN-222	ENST00000612341	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
SMTN-222	ENST00000612341	MAPKBP1	O60336	1514 aa		18.56	■□□□□ 0.56
SMTN-222	ENST00000612341	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		18.56	■□□□□ 0.56
SMTN-222	ENST00000612341	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		18.56	■□□□□ 0.56
SMTN-222	ENST00000612341	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		18.56	■□□□□ 0.56
SMTN-222	ENST00000612341	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		18.54	■□□□□ 0.56
SMTN-222	ENST00000612341	FMN1	Q68DA7	1419 aa		18.53	■□□□□ 0.56
SMTN-222	ENST00000612341	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		18.52	■□□□□ 0.56
SMTN-222	ENST00000612341	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		18.51	■□□□□ 0.55
SMTN-222	ENST00000612341	CUL7	Q14999	1698 aa		18.51	■□□□□ 0.55
SMTN-222	ENST00000612341	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
SMTN-222	ENST00000612341	KCNH8	Q96L42	1107 aa		18.5	■□□□□ 0.55
SMTN-222	ENST00000612341	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SMTN-222	ENST00000612341	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SMTN-222	ENST00000612341	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SMTN-222	ENST00000612341	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	18.45	■□□□□ 0.54	6e-8	■■■■■ 47.6
SMTN-222	ENST00000612341	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		18.45	■□□□□ 0.54
SMTN-222	ENST00000612341	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SMTN-222	ENST00000612341	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SMTN-222	ENST00000612341	WDR97	A6NE52	1622 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SMTN-222	ENST00000612341	PTPRK	Q15262	1439 aa		18.41	■□□□□ 0.54
SMTN-222	ENST00000612341	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		18.41	■□□□□ 0.54
SMTN-222	ENST00000612341	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		18.4	■□□□□ 0.54
SMTN-222	ENST00000612341	NCOA2	Q15596	1464 aa		18.39	■□□□□ 0.53
SMTN-222	ENST00000612341	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
SMTN-222	ENST00000612341	TONSL	Q96HA7	1378 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SMTN-222	ENST00000612341	TRIM52	Q96A61	297 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SMTN-222	ENST00000612341	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SMTN-222	ENST00000612341	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SMTN-222	ENST00000612341	GRIN2B	Q13224	1484 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SMTN-222	ENST00000612341	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	18.33	■□□□□ 0.53
SMTN-222	ENST00000612341	SAMD9	Q5K651	1589 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SMTN-222	ENST00000612341	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
SMTN-222	ENST00000612341	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		18.29	■□□□□ 0.52
SMTN-222	ENST00000612341	HFM1	A2PYH4	1435 aa		18.29	■□□□□ 0.52
SMTN-222	ENST00000612341	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SMTN-222	ENST00000612341	NAIP	Q13075	1403 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SMTN-222	ENST00000612341	FBLN2	P98095	1184 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SMTN-222	ENST00000612341	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		18.27	■□□□□ 0.52
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
SMTN-222	ENST00000612341	FOXD1	Q16676	465 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SMTN-222	ENST00000612341	UACA	Q9BZF9	1416 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SMTN-222	ENST00000612341	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
SMTN-222	ENST00000612341	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
SMTN-222	ENST00000612341	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SMTN-222	ENST00000612341	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SMTN-222	ENST00000612341	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
SMTN-222	ENST00000612341	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SMTN-222	ENST00000612341	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SMTN-222	ENST00000612341	ANP32C	O43423	234 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SMTN-222	ENST00000612341	IQGAP2	Q13576	1575 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SMTN-222	ENST00000612341	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SMTN-222	ENST00000612341	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SMTN-222	ENST00000612341	BCAN	Q96GW7	911 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SMTN-222	ENST00000612341	PBRM1	Q86U86	1689 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SMTN-222	ENST00000612341	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SMTN-222	ENST00000612341	ADAMTS12	P58397	1594 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SMTN-222	ENST00000612341	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
SMTN-222	ENST00000612341	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
SMTN-222	ENST00000612341	HECW1	Q76N89	1606 aa		18.14	■□□□□ 0.49
SMTN-222	ENST00000612341	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		18.12	■□□□□ 0.49
SMTN-222	ENST00000612341	ERCC6	Q03468	1493 aa		18.1	■□□□□ 0.49
SMTN-222	ENST00000612341	IFT140	Q96RY7	1462 aa		18.1	■□□□□ 0.49
SMTN-222	ENST00000612341	ARHGEF11	O15085	1522 aa		18.1	■□□□□ 0.49
SMTN-222	ENST00000612341	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	18.1	■□□□□ 0.49
SMTN-222	ENST00000612341	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		18.09	■□□□□ 0.49
SMTN-222	ENST00000612341	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.49
SMTN-222	ENST00000612341	KDM6B	O15054	1643 aa		18.08	■□□□□ 0.49
SMTN-222	ENST00000612341	WDR62	O43379	1518 aa		18.08	■□□□□ 0.49
SMTN-222	ENST00000612341	FKBP8	Q14318	412 aa		18.08	■□□□□ 0.48
SMTN-222	ENST00000612341	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
SMTN-222	ENST00000612341	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
SMTN-222	ENST00000612341	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		18.06	■□□□□ 0.48
SMTN-222	ENST00000612341	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
SMTN-222	ENST00000612341	DISP1	Q96F81	1524 aa		18.05	■□□□□ 0.48
SMTN-222	ENST00000612341	MIA2	Q96PC5	1412 aa		18.04	■□□□□ 0.48

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