RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.91□□□□□ -0.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM41Q8WV44 630 aa14.89□□□□□ -0.03
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
EFTUD2-222ENST00000592408 PROM2Q8N271 834 aa14.82□□□□□ -0.04
EFTUD2-222ENST00000592408 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.77□□□□□ -0.04
EFTUD2-222ENST00000592408 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
EFTUD2-222ENST00000592408 POTEIP0CG38 1075 aa14.76□□□□□ -0.05
EFTUD2-222ENST00000592408 SMARCA2P51531 1590 aa14.74□□□□□ -0.05
EFTUD2-222ENST00000592408 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.74□□□□□ -0.05
EFTUD2-222ENST00000592408 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.73□□□□□ -0.05
EFTUD2-222ENST00000592408 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.73□□□□□ -0.05
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.69□□□□□ -0.06
EFTUD2-222ENST00000592408 HRCP23327 699 aa14.68□□□□□ -0.06
EFTUD2-222ENST00000592408 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.66□□□□□ -0.06
EFTUD2-222ENST00000592408 PHF12Q96QT6 1004 aa14.62□□□□□ -0.07
EFTUD2-222ENST00000592408 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
EFTUD2-222ENST00000592408 EEA1Q15075 1411 aa14.57□□□□□ -0.08
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
EFTUD2-222ENST00000592408 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
EFTUD2-222ENST00000592408 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCC8Q09428 1581 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-222ENST00000592408 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-222ENST00000592408 LHX8Q68G74 356 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-222ENST00000592408 CLCN6P51797 869 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-222ENST00000592408 FKBP8Q14318 412 aa14.49□□□□□ -0.09
EFTUD2-222ENST00000592408 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.49□□□□□ -0.09
EFTUD2-222ENST00000592408 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC24A1O60721 1099 aa14.46□□□□□ -0.09
EFTUD2-222ENST00000592408 MIER1Q8N108 512 aa14.44□□□□□ -0.1
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
EFTUD2-222ENST00000592408 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.43□□□□□ -0.1
EFTUD2-222ENST00000592408 HMGXB3Q12766 1538 aa14.42□□□□□ -0.1
EFTUD2-222ENST00000592408 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.39□□□□□ -0.11
EFTUD2-222ENST00000592408 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
EFTUD2-222ENST00000592408 RASEFQ8IZ41 740 aa14.37□□□□□ -0.11
EFTUD2-222ENST00000592408 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.37□□□□□ -0.11
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA3Q08378 1498 aa14.36□□□□□ -0.11
EFTUD2-222ENST00000592408 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.35□□□□□ -0.11
EFTUD2-222ENST00000592408 SOGA1O94964 1423 aa14.33□□□□□ -0.11
EFTUD2-222ENST00000592408 NCAPD3P42695 1498 aa14.33□□□□□ -0.12
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNJ1O43426 1573 aa14.33□□□□□ -0.12
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF21BO75037 1637 aa14.32□□□□□ -0.12
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP162Q5TB80 1403 aa14.32□□□□□ -0.12
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.31□□□□□ -0.12
EFTUD2-222ENST00000592408 POTEB2H3BUK9 544 aa14.3□□□□□ -0.12
EFTUD2-222ENST00000592408 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.3□□□□□ -0.12
EFTUD2-222ENST00000592408 TOP2BQ02880 1626 aa14.27□□□□□ -0.12
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF12Q96FN5 646 aa14.27□□□□□ -0.13
EFTUD2-222ENST00000592408 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.26□□□□□ -0.13
EFTUD2-222ENST00000592408 TRPC6Q9Y210 931 aa14.26□□□□□ -0.13
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHG5O94827 1062 aa14.24□□□□□ -0.13
EFTUD2-222ENST00000592408 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
EFTUD2-222ENST00000592408 NUBP1P53384 320 aa14.22□□□□□ -0.13
EFTUD2-222ENST00000592408 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
EFTUD2-222ENST00000592408 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP3K13O43283 966 aa14.21□□□□□ -0.13
EFTUD2-222ENST00000592408 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.2□□□□□ -0.14
EFTUD2-222ENST00000592408 PRDM2Q13029 1718 aa14.18□□□□□ -0.14
EFTUD2-222ENST00000592408 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
EFTUD2-222ENST00000592408 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
EFTUD2-222ENST00000592408 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
EFTUD2-222ENST00000592408 CFTRP13569 1480 aa14.15□□□□□ -0.14
EFTUD2-222ENST00000592408 OTUD5Q96G74 571 aa14.15□□□□□ -0.14
EFTUD2-222ENST00000592408 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.15□□□□□ -0.14
EFTUD2-222ENST00000592408 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
EFTUD2-222ENST00000592408 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.12□□□□□ -0.15
EFTUD2-222ENST00000592408 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
EFTUD2-222ENST00000592408 METRNQ9UJH8 293 aa14.12□□□□□ -0.15
EFTUD2-222ENST00000592408 POTEJP0CG39 1038 aa14.11□□□□□ -0.15
EFTUD2-222ENST00000592408 CLIP1P30622 1438 aa14.11□□□□□ -0.15
EFTUD2-222ENST00000592408 CUX1P39880 1505 aa14.08□□□□□ -0.16
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF27Q86VH2 1401 aa14.07□□□□□ -0.16
EFTUD2-222ENST00000592408 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.07□□□□□ -0.16
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
EFTUD2-222ENST00000592408 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.06□□□□□ -0.16
EFTUD2-222ENST00000592408 POTEFA5A3E0 1075 aa14.05□□□□□ -0.16
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC39A7Q92504 469 aa14.05□□□□□ -0.16
EFTUD2-222ENST00000592408 C7P10643 843 aa14.03□□□□□ -0.16
EFTUD2-222ENST00000592408 PRXQ9BXM0 1461 aa14.03□□□□□ -0.16
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.02□□□□□ -0.17
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXO3Q9UK99 471 aa14.01□□□□□ -0.17
EFTUD2-222ENST00000592408 TTLL13PA6NNM8 815 aa14□□□□□ -0.17
EFTUD2-222ENST00000592408 TIE1P35590 1138 aa14□□□□□ -0.17
EFTUD2-222ENST00000592408 IFNL1Q8IU54 200 aa14□□□□□ -0.17
EFTUD2-222ENST00000592408 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.99□□□□□ -0.17
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM212AQ96EL1 285 aa13.99□□□□□ -0.17
EFTUD2-222ENST00000592408 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
EFTUD2-222ENST00000592408 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
EFTUD2-222ENST00000592408 DCAF8Q5TAQ9 597 aa13.94□□□□□ -0.18
EFTUD2-222ENST00000592408 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.94□□□□□ -0.18
EFTUD2-222ENST00000592408 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
EFTUD2-222ENST00000592408 PYGBP11216 843 aa13.93□□□□□ -0.18
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.9□□□□□ -0.18
EFTUD2-222ENST00000592408 CUX2O14529 1486 aa13.88□□□□□ -0.19
EFTUD2-222ENST00000592408 ARAP1Q96P48 1450 aa13.88□□□□□ -0.19
EFTUD2-222ENST00000592408 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.88□□□□□ -0.19
EFTUD2-222ENST00000592408 FGD5Q6ZNL6 1462 aa13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms