RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534510.5

CTSB-232, Transcript of cathepsin B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTSB, Length 1,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSB-232ENST00000534510 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CTSB-232ENST00000534510 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.71■■□□□ 1.71
CTSB-232ENST00000534510 CUL7Q14999 1698 aa25.68■■□□□ 1.7
CTSB-232ENST00000534510 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.67■■□□□ 1.7
CTSB-232ENST00000534510 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.67■■□□□ 1.7
CTSB-232ENST00000534510 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.67■■□□□ 1.7
CTSB-232ENST00000534510 TOPBP1Q92547 1522 aa25.66■■□□□ 1.7
CTSB-232ENST00000534510 ITGAEP38570 1179 aa25.65■■□□□ 1.7
CTSB-232ENST00000534510 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
CTSB-232ENST00000534510 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.63■■□□□ 1.69
CTSB-232ENST00000534510 MAPKBP1O60336 1514 aa25.63■■□□□ 1.69
CTSB-232ENST00000534510 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.62■■□□□ 1.69
CTSB-232ENST00000534510 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.62■■□□□ 1.69
CTSB-232ENST00000534510 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.62■■□□□ 1.69
CTSB-232ENST00000534510 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.61■■□□□ 1.69
CTSB-232ENST00000534510 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.693e-7■■■■■ 33.7
CTSB-232ENST00000534510 NESP48681 1621 aa25.56■■□□□ 1.68
CTSB-232ENST00000534510 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.55■■□□□ 1.68
CTSB-232ENST00000534510 WDR97A6NE52 1622 aa25.54■■□□□ 1.68
CTSB-232ENST00000534510 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.54■■□□□ 1.68
CTSB-232ENST00000534510 P3H3Q8IVL6 736 aa25.5■■□□□ 1.67
CTSB-232ENST00000534510 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CTSB-232ENST00000534510 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.672e-6■■□□□ 11.9
CTSB-232ENST00000534510 FMN1Q68DA7 1419 aa25.44■■□□□ 1.66
CTSB-232ENST00000534510 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.43■■□□□ 1.66
CTSB-232ENST00000534510 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CTSB-232ENST00000534510 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.42■■□□□ 1.66
CTSB-232ENST00000534510 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CTSB-232ENST00000534510 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.39■■□□□ 1.66
CTSB-232ENST00000534510 SAMD9Q5K651 1589 aa25.39■■□□□ 1.65
CTSB-232ENST00000534510 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.34■■□□□ 1.65
CTSB-232ENST00000534510 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.34■■□□□ 1.65
CTSB-232ENST00000534510 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CTSB-232ENST00000534510 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.31■■□□□ 1.64
CTSB-232ENST00000534510 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.3■■□□□ 1.64
CTSB-232ENST00000534510 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.29■■□□□ 1.64
CTSB-232ENST00000534510 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.27■■□□□ 1.64
CTSB-232ENST00000534510 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.27■■□□□ 1.64
CTSB-232ENST00000534510 GRIN2BQ13224 1484 aa25.25■■□□□ 1.63
CTSB-232ENST00000534510 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CTSB-232ENST00000534510 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CTSB-232ENST00000534510 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.22■■□□□ 1.63
CTSB-232ENST00000534510 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.22■■□□□ 1.63
CTSB-232ENST00000534510 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.2■■□□□ 1.62
CTSB-232ENST00000534510 HFM1A2PYH4 1435 aa25.2■■□□□ 1.62
CTSB-232ENST00000534510 NCOA2Q15596 1464 aa25.19■■□□□ 1.62
CTSB-232ENST00000534510 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.18■■□□□ 1.62
CTSB-232ENST00000534510 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTSB-232ENST00000534510 UACAQ9BZF9 1416 aa25.15■■□□□ 1.62
CTSB-232ENST00000534510 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
CTSB-232ENST00000534510 PTPRKQ15262 1439 aa25.13■■□□□ 1.61
CTSB-232ENST00000534510 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.12■■□□□ 1.61
CTSB-232ENST00000534510 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CTSB-232ENST00000534510 PBRM1Q86U86 1689 aa25.12■■□□□ 1.61
CTSB-232ENST00000534510 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.11■■□□□ 1.61
CTSB-232ENST00000534510 ARHGEF11O15085 1522 aa25.1■■□□□ 1.61
CTSB-232ENST00000534510 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CTSB-232ENST00000534510 HECW1Q76N89 1606 aa25.08■■□□□ 1.61
CTSB-232ENST00000534510 TONSLQ96HA7 1378 aa25.08■■□□□ 1.61
CTSB-232ENST00000534510 NAIPQ13075 1403 aa25.08■■□□□ 1.61
CTSB-232ENST00000534510 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.04■■□□□ 1.6
CTSB-232ENST00000534510 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.04■■□□□ 1.6
CTSB-232ENST00000534510 KCNH8Q96L42 1107 aa25.04■■□□□ 1.6
CTSB-232ENST00000534510 IQGAP2Q13576 1575 aa25.03■■□□□ 1.6
CTSB-232ENST00000534510 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CTSB-232ENST00000534510 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.02■■□□□ 1.6
CTSB-232ENST00000534510 ADAMTS12P58397 1594 aa25.02■■□□□ 1.6
CTSB-232ENST00000534510 MYT1Q01538 1121 aa24.97■■□□□ 1.59
CTSB-232ENST00000534510 CCER2I3L3R5 266 aa24.95■■□□□ 1.58
CTSB-232ENST00000534510 AKNAQ7Z591 1439 aa24.95■■□□□ 1.58
CTSB-232ENST00000534510 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CTSB-232ENST00000534510 WDR62O43379 1518 aa24.92■■□□□ 1.58
CTSB-232ENST00000534510 ANP32CO43423 234 aa24.91■■□□□ 1.58
CTSB-232ENST00000534510 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.91■■□□□ 1.58
CTSB-232ENST00000534510 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CTSB-232ENST00000534510 MIA2Q96PC5 1412 aa24.89■■□□□ 1.57
CTSB-232ENST00000534510 IFT140Q96RY7 1462 aa24.88■■□□□ 1.57
CTSB-232ENST00000534510 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CTSB-232ENST00000534510 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.82■■□□□ 1.56
CTSB-232ENST00000534510 KDM6BO15054 1643 aa24.8■■□□□ 1.56
CTSB-232ENST00000534510 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CTSB-232ENST00000534510 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.78■■□□□ 1.56
CTSB-232ENST00000534510 KIAA0556O60303 1618 aa24.76■■□□□ 1.55
CTSB-232ENST00000534510 TRIM52Q96A61 297 aa24.74■■□□□ 1.55
CTSB-232ENST00000534510 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.73■■□□□ 1.55
CTSB-232ENST00000534510 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CTSB-232ENST00000534510 ROCK1Q13464 1354 aa24.71■■□□□ 1.55
CTSB-232ENST00000534510 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CTSB-232ENST00000534510 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.69■■□□□ 1.54
CTSB-232ENST00000534510 DISP1Q96F81 1524 aa24.69■■□□□ 1.54
CTSB-232ENST00000534510 DAPK1P53355 1430 aa24.69■■□□□ 1.54
CTSB-232ENST00000534510 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.69■■□□□ 1.54
CTSB-232ENST00000534510 FKBP8Q14318 412 aa24.68■■□□□ 1.54
CTSB-232ENST00000534510 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.67■■□□□ 1.54
CTSB-232ENST00000534510 NEFLP07196 543 aa24.66■■□□□ 1.54
CTSB-232ENST00000534510 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CTSB-232ENST00000534510 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CTSB-232ENST00000534510 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
CTSB-232ENST00000534510 GRIN2AQ12879 1464 aa24.63■■□□□ 1.53
CTSB-232ENST00000534510 ARID3CA6NKF2 412 aa24.62■■□□□ 1.53
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