RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527076.1

GNPTG-203, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene GNPTG, Length 2,400 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-203ENST00000527076 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTG-203ENST00000527076 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTG-203ENST00000527076 TIAM1Q13009 1591 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTG-203ENST00000527076 TOPBP1Q92547 1522 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTG-203ENST00000527076 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.9■■□□□ 1.42
GNPTG-203ENST00000527076 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
GNPTG-203ENST00000527076 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.87■■□□□ 1.41
GNPTG-203ENST00000527076 CUL7Q14999 1698 aa23.87■■□□□ 1.41
GNPTG-203ENST00000527076 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.84■■□□□ 1.41
GNPTG-203ENST00000527076 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.83■■□□□ 1.41
GNPTG-203ENST00000527076 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.83■■□□□ 1.4
GNPTG-203ENST00000527076 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.82■■□□□ 1.4
GNPTG-203ENST00000527076 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.82■■□□□ 1.4
GNPTG-203ENST00000527076 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.81■■□□□ 1.4
GNPTG-203ENST00000527076 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
GNPTG-203ENST00000527076 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
GNPTG-203ENST00000527076 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.79■■□□□ 1.4
GNPTG-203ENST00000527076 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.76■■□□□ 1.39
GNPTG-203ENST00000527076 WDR97A6NE52 1622 aa23.76■■□□□ 1.39
GNPTG-203ENST00000527076 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
GNPTG-203ENST00000527076 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-203ENST00000527076 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-203ENST00000527076 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-203ENST00000527076 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTG-203ENST00000527076 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTG-203ENST00000527076 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTG-203ENST00000527076 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTG-203ENST00000527076 MYT1Q01538 1121 aa23.64■■□□□ 1.38
GNPTG-203ENST00000527076 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.64■■□□□ 1.38
GNPTG-203ENST00000527076 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.62■■□□□ 1.37
GNPTG-203ENST00000527076 MAPKBP1O60336 1514 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTG-203ENST00000527076 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
GNPTG-203ENST00000527076 FMN1Q68DA7 1419 aa23.59■■□□□ 1.37
GNPTG-203ENST00000527076 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.58■■□□□ 1.37
GNPTG-203ENST00000527076 SAMD9Q5K651 1589 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTG-203ENST00000527076 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
GNPTG-203ENST00000527076 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.5■■□□□ 1.35
GNPTG-203ENST00000527076 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.49■■□□□ 1.35
GNPTG-203ENST00000527076 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-203ENST00000527076 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTG-203ENST00000527076 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTG-203ENST00000527076 PTPRKQ15262 1439 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTG-203ENST00000527076 GRIN2BQ13224 1484 aa23.38■■□□□ 1.33
GNPTG-203ENST00000527076 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
GNPTG-203ENST00000527076 PBRM1Q86U86 1689 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTG-203ENST00000527076 KCNH8Q96L42 1107 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTG-203ENST00000527076 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTG-203ENST00000527076 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTG-203ENST00000527076 NCOA2Q15596 1464 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTG-203ENST00000527076 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
GNPTG-203ENST00000527076 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
GNPTG-203ENST00000527076 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GNPTG-203ENST00000527076 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.33■■□□□ 1.33
GNPTG-203ENST00000527076 ARID3CA6NKF2 412 aa23.33■■□□□ 1.33
GNPTG-203ENST00000527076 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.31■■□□□ 1.32
GNPTG-203ENST00000527076 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTG-203ENST00000527076 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTG-203ENST00000527076 ADAMTS12P58397 1594 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTG-203ENST00000527076 HFM1A2PYH4 1435 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTG-203ENST00000527076 HECW1Q76N89 1606 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTG-203ENST00000527076 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTG-203ENST00000527076 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTG-203ENST00000527076 ARHGEF11O15085 1522 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTG-203ENST00000527076 IQGAP2Q13576 1575 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTG-203ENST00000527076 NAIPQ13075 1403 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-203ENST00000527076 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-203ENST00000527076 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-203ENST00000527076 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-203ENST00000527076 UACAQ9BZF9 1416 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-203ENST00000527076 TONSLQ96HA7 1378 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTG-203ENST00000527076 WDR62O43379 1518 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTG-203ENST00000527076 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
GNPTG-203ENST00000527076 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
GNPTG-203ENST00000527076 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
GNPTG-203ENST00000527076 IFT140Q96RY7 1462 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTG-203ENST00000527076 TRIM52Q96A61 297 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTG-203ENST00000527076 AKNAQ7Z591 1439 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTG-203ENST00000527076 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTG-203ENST00000527076 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
GNPTG-203ENST00000527076 MIA2Q96PC5 1412 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTG-203ENST00000527076 ERCC6Q03468 1493 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTG-203ENST00000527076 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
GNPTG-203ENST00000527076 FOXD1Q16676 465 aa23.02■■□□□ 1.28
GNPTG-203ENST00000527076 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
GNPTG-203ENST00000527076 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23■■□□□ 1.27
GNPTG-203ENST00000527076 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23■■□□□ 1.27
GNPTG-203ENST00000527076 ANP32CO43423 234 aa23■■□□□ 1.27
GNPTG-203ENST00000527076 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
GNPTG-203ENST00000527076 KDM6BO15054 1643 aa22.99■■□□□ 1.27
GNPTG-203ENST00000527076 KIAA0556O60303 1618 aa22.99■■□□□ 1.27
GNPTG-203ENST00000527076 DISP1Q96F81 1524 aa22.99■■□□□ 1.27
GNPTG-203ENST00000527076 CCER2I3L3R5 266 aa22.97■■□□□ 1.27
GNPTG-203ENST00000527076 FBLN2P98095 1184 aa22.97■■□□□ 1.27
GNPTG-203ENST00000527076 GRIN2AQ12879 1464 aa22.96■■□□□ 1.27
GNPTG-203ENST00000527076 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.95■■□□□ 1.26
GNPTG-203ENST00000527076 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GNPTG-203ENST00000527076 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-203ENST00000527076 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-203ENST00000527076 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.89■■□□□ 1.26
GNPTG-203ENST00000527076 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
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