RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 TOPBP1Q92547 1522 aa8.84□□□□□ -0.99
MSC-AS1-205ENST00000519068 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.83□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 CUX1P39880 1505 aa8.83□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 FBLN2P98095 1184 aa8.82□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.81□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.79□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.79□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARXQ96QS3 562 aa8.79□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.79□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 SYNJ1O43426 1573 aa8.78□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.78□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 CUX2O14529 1486 aa8.77□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
MSC-AS1-205ENST00000519068 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.77□□□□□ -1.01
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRDM2Q13029 1718 aa8.77□□□□□ -1.01
MSC-AS1-205ENST00000519068 WDR62O43379 1518 aa8.76□□□□□ -1.01
MSC-AS1-205ENST00000519068 CFAP44Q96MT7 982 aa8.76□□□□□ -1.01
MSC-AS1-205ENST00000519068 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
MSC-AS1-205ENST00000519068 TOP2BQ02880 1626 aa8.76□□□□□ -1.01
MSC-AS1-205ENST00000519068 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.75□□□□□ -1.01
MSC-AS1-205ENST00000519068 IFT140Q96RY7 1462 aa8.74□□□□□ -1.01
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGF1RP08069 1367 aa8.73□□□□□ -1.01
MSC-AS1-205ENST00000519068 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
MSC-AS1-205ENST00000519068 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.73□□□□□ -1.01
MSC-AS1-205ENST00000519068 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
MSC-AS1-205ENST00000519068 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
MSC-AS1-205ENST00000519068 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.71□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 KIF27Q86VH2 1401 aa8.71□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 APLP2Q06481 763 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 NBR1Q14596 966 aa8.68□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.68□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.67□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.67□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPOCK2Q92563 424 aa8.66□□□□□ -1.02
MSC-AS1-205ENST00000519068 GRIN2BQ13224 1484 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-205ENST00000519068 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-205ENST00000519068 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-205ENST00000519068 EEA1Q15075 1411 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-205ENST00000519068 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
MSC-AS1-205ENST00000519068 OSCARQ8IYS5 282 aa8.62□□□□□ -1.03
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLHL34Q8N239 644 aa8.6□□□□□ -1.03
MSC-AS1-205ENST00000519068 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.58□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.57□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 RGL2O15211 777 aa8.57□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRXQ9BXM0 1461 aa8.57□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.57□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.56□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 HOMEZQ8IX15 550 aa8.56□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 JPH4Q96JJ6 628 aa8.56□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.54□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.54□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 P3H3Q8IVL6 736 aa8.54□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 SYNJ2O15056 1496 aa8.53□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 WDR97A6NE52 1622 aa8.53□□□□□ -1.04
MSC-AS1-205ENST00000519068 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
MSC-AS1-205ENST00000519068 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.5□□□□□ -1.05
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MSC-AS1-205ENST00000519068 GOLGA3Q08378 1498 aa8.5□□□□□ -1.05
MSC-AS1-205ENST00000519068 GRIN2AQ12879 1464 aa8.5□□□□□ -1.05
MSC-AS1-205ENST00000519068 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.47□□□□□ -1.05
MSC-AS1-205ENST00000519068 PBRM1Q86U86 1689 aa8.46□□□□□ -1.05
MSC-AS1-205ENST00000519068 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.46□□□□□ -1.05
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADAMTS12P58397 1594 aa8.46□□□□□ -1.06
MSC-AS1-205ENST00000519068 NUP160Q12769 1436 aa8.46□□□□□ -1.06
MSC-AS1-205ENST00000519068 C14orf37Q86TY3 774 aa8.45□□□□□ -1.06
MSC-AS1-205ENST00000519068 CUL7Q14999 1698 aa8.45□□□□□ -1.06
MSC-AS1-205ENST00000519068 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
MSC-AS1-205ENST00000519068 KIF21BO75037 1637 aa8.43□□□□□ -1.06
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
MSC-AS1-205ENST00000519068 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.42□□□□□ -1.06
MSC-AS1-205ENST00000519068 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.42□□□□□ -1.06
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.42□□□□□ -1.06
MSC-AS1-205ENST00000519068 CEP170Q5SW79 1584 aa8.41□□□□□ -1.06
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLIP1P30622 1438 aa8.41□□□□□ -1.06
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHD1O14646 1710 aa8.4□□□□□ -1.07
MSC-AS1-205ENST00000519068 CEP162Q5TB80 1403 aa8.39□□□□□ -1.07
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTPRGP23470 1445 aa8.38□□□□□ -1.07
MSC-AS1-205ENST00000519068 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.38□□□□□ -1.07
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARID3CA6NKF2 412 aa8.38□□□□□ -1.07
MSC-AS1-205ENST00000519068 POLA2Q14181 598 aa8.37□□□□□ -1.07
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
MSC-AS1-205ENST00000519068 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.36□□□□□ -1.07
MSC-AS1-205ENST00000519068 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.36□□□□□ -1.07
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