RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515200.5

GRAMD2B-217, Transcript of GRAM domain containing 2B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GRAMD2B, Length 3,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2B-217ENST00000515200 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
GRAMD2B-217ENST00000515200 MIER1Q8N108 512 aa23.66■■□□□ 1.38
GRAMD2B-217ENST00000515200 TOPBP1Q92547 1522 aa23.63■■□□□ 1.37
GRAMD2B-217ENST00000515200 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
GRAMD2B-217ENST00000515200 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.58■■□□□ 1.37
GRAMD2B-217ENST00000515200 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
GRAMD2B-217ENST00000515200 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.55■■□□□ 1.36
GRAMD2B-217ENST00000515200 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
GRAMD2B-217ENST00000515200 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GRAMD2B-217ENST00000515200 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.54■■□□□ 1.36
GRAMD2B-217ENST00000515200 FBLN2P98095 1184 aa23.53■■□□□ 1.36
GRAMD2B-217ENST00000515200 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.47■■□□□ 1.35
GRAMD2B-217ENST00000515200 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
GRAMD2B-217ENST00000515200 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD2B-217ENST00000515200 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD2B-217ENST00000515200 PRDM2Q13029 1718 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD2B-217ENST00000515200 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.38■■□□□ 1.33
GRAMD2B-217ENST00000515200 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.37■■□□□ 1.33
GRAMD2B-217ENST00000515200 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
GRAMD2B-217ENST00000515200 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.36■■□□□ 1.33
GRAMD2B-217ENST00000515200 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.35■■□□□ 1.33
GRAMD2B-217ENST00000515200 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.35■■□□□ 1.33
GRAMD2B-217ENST00000515200 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.35■■□□□ 1.33
GRAMD2B-217ENST00000515200 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
GRAMD2B-217ENST00000515200 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.33■■□□□ 1.32
GRAMD2B-217ENST00000515200 TIAM1Q13009 1591 aa23.32■■□□□ 1.32
GRAMD2B-217ENST00000515200 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.31■■□□□ 1.32
GRAMD2B-217ENST00000515200 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.28■■□□□ 1.32
GRAMD2B-217ENST00000515200 KCNH8Q96L42 1107 aa23.24■■□□□ 1.31
GRAMD2B-217ENST00000515200 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GRAMD2B-217ENST00000515200 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD2B-217ENST00000515200 TRIM52Q96A61 297 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD2B-217ENST00000515200 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD2B-217ENST00000515200 FOXD1Q16676 465 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD2B-217ENST00000515200 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
GRAMD2B-217ENST00000515200 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 ERCC6Q03468 1493 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 FMN1Q68DA7 1419 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 PTPRKQ15262 1439 aa23.09■■□□□ 1.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
GRAMD2B-217ENST00000515200 MAPKBP1O60336 1514 aa23.04■■□□□ 1.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.04■■□□□ 1.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.03■■□□□ 1.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 CUL7Q14999 1698 aa23.03■■□□□ 1.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.02■■□□□ 1.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.02■■□□□ 1.28
GRAMD2B-217ENST00000515200 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.01■■□□□ 1.27
GRAMD2B-217ENST00000515200 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.01■■□□□ 1.27
GRAMD2B-217ENST00000515200 NCOA2Q15596 1464 aa23.01■■□□□ 1.27
GRAMD2B-217ENST00000515200 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.99■■□□□ 1.27
GRAMD2B-217ENST00000515200 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.98■■□□□ 1.27
GRAMD2B-217ENST00000515200 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
GRAMD2B-217ENST00000515200 WDR97A6NE52 1622 aa22.96■■□□□ 1.27
GRAMD2B-217ENST00000515200 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.95■■□□□ 1.26
GRAMD2B-217ENST00000515200 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.94■■□□□ 1.26
GRAMD2B-217ENST00000515200 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.92■■□□□ 1.26
GRAMD2B-217ENST00000515200 TONSLQ96HA7 1378 aa22.92■■□□□ 1.26
GRAMD2B-217ENST00000515200 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.91■■□□□ 1.26
GRAMD2B-217ENST00000515200 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
GRAMD2B-217ENST00000515200 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.89■■□□□ 1.26
GRAMD2B-217ENST00000515200 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
GRAMD2B-217ENST00000515200 GRIN2BQ13224 1484 aa22.88■■□□□ 1.25
GRAMD2B-217ENST00000515200 MAP3K1Q13233 1512 aa22.87■■□□□ 1.25
GRAMD2B-217ENST00000515200 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.87■■□□□ 1.25
GRAMD2B-217ENST00000515200 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
GRAMD2B-217ENST00000515200 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.84■■□□□ 1.25
GRAMD2B-217ENST00000515200 BCANQ96GW7 911 aa22.83■■□□□ 1.25
GRAMD2B-217ENST00000515200 IQGAP2Q13576 1575 aa22.83■■□□□ 1.24
GRAMD2B-217ENST00000515200 PBRM1Q86U86 1689 aa22.82■■□□□ 1.24
GRAMD2B-217ENST00000515200 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
GRAMD2B-217ENST00000515200 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.81■■□□□ 1.24
GRAMD2B-217ENST00000515200 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
GRAMD2B-217ENST00000515200 JPH4Q96JJ6 628 aa22.8■■□□□ 1.24
GRAMD2B-217ENST00000515200 SAMD9Q5K651 1589 aa22.8■■□□□ 1.24
GRAMD2B-217ENST00000515200 NAIPQ13075 1403 aa22.79■■□□□ 1.24
GRAMD2B-217ENST00000515200 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GRAMD2B-217ENST00000515200 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.77■■□□□ 1.24
GRAMD2B-217ENST00000515200 ADAMTS12P58397 1594 aa22.77■■□□□ 1.24
GRAMD2B-217ENST00000515200 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
GRAMD2B-217ENST00000515200 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.74■■□□□ 1.23
GRAMD2B-217ENST00000515200 IFT140Q96RY7 1462 aa22.73■■□□□ 1.23
GRAMD2B-217ENST00000515200 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
GRAMD2B-217ENST00000515200 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.71■■□□□ 1.23
GRAMD2B-217ENST00000515200 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
GRAMD2B-217ENST00000515200 KDM6BO15054 1643 aa22.7■■□□□ 1.22
GRAMD2B-217ENST00000515200 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
GRAMD2B-217ENST00000515200 HFM1A2PYH4 1435 aa22.7■■□□□ 1.22
GRAMD2B-217ENST00000515200 GRIN2AQ12879 1464 aa22.69■■□□□ 1.22
GRAMD2B-217ENST00000515200 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.68■■□□□ 1.22
GRAMD2B-217ENST00000515200 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.67■■□□□ 1.22
GRAMD2B-217ENST00000515200 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
GRAMD2B-217ENST00000515200 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.67■■□□□ 1.22
GRAMD2B-217ENST00000515200 DISP1Q96F81 1524 aa22.67■■□□□ 1.22
GRAMD2B-217ENST00000515200 UACAQ9BZF9 1416 aa22.65■■□□□ 1.22
GRAMD2B-217ENST00000515200 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.65■■□□□ 1.22
GRAMD2B-217ENST00000515200 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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