RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510089.5

TMEM161B-208, Transcript of transmembrane protein 161B, human

TSL 1 (best)

Gene TMEM161B, Length 7,608 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM161B-208	ENST00000510089	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TMEM161B-208	ENST00000510089	GRIN2B	Q13224	1484 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TMEM161B-208	ENST00000510089	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TMEM161B-208	ENST00000510089	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TMEM161B-208	ENST00000510089	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TMEM161B-208	ENST00000510089	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMEM161B-208	ENST00000510089	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	ATP10A	O60312	1499 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	NAIP	Q13075	1403 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		5	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	ADGRL2	O95490	1459 aa		5	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMEM161B-208	ENST00000510089	PRDM2	Q13029	1718 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	WDR62	O43379	1518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	NCOA1	Q15788	1441 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089		E9PCH4	1651 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	LAMC1	P11047	1609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	IQGAP2	Q13576	1575 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	PLA2R1	Q13018	1463 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TMEM161B-208	ENST00000510089	PZP	P20742	1482 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	MSH5	O43196	834 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	DISP1	Q96F81	1524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	ABCC2	Q92887	1545 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	MIER1	Q8N108	512 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	KDM6B	O15054	1643 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	MYT1	Q01538	1121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	SYNJ2	O15056	1496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	TOPBP1	Q92547	1522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	CUL7	Q14999	1698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	CEP170	Q5SW79	1584 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	NUP160	Q12769	1436 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TMEM161B-208	ENST00000510089	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TMEM161B-208	ENST00000510089	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TMEM161B-208	ENST00000510089	ABCA8	O94911	1581 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TMEM161B-208	ENST00000510089	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TMEM161B-208	ENST00000510089	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TMEM161B-208	ENST00000510089	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMEM161B-208	ENST00000510089	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TMEM161B-208	ENST00000510089	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMEM161B-208	ENST00000510089	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TMEM161B-208	ENST00000510089	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TMEM161B-208	ENST00000510089	PBRM1	Q86U86	1689 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMEM161B-208	ENST00000510089	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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