RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487163.5

USP21-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP21, Length 2,514 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-208ENST00000487163 MAP3K1Q13233 1512 aa24.88■■□□□ 1.57
USP21-208ENST00000487163 CUL7Q14999 1698 aa24.88■■□□□ 1.57
USP21-208ENST00000487163 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.88■■□□□ 1.57
USP21-208ENST00000487163 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
USP21-208ENST00000487163 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
USP21-208ENST00000487163 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.87■■□□□ 1.57
USP21-208ENST00000487163 WDR97A6NE52 1622 aa24.86■■□□□ 1.57
USP21-208ENST00000487163 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.83■■□□□ 1.57
USP21-208ENST00000487163 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.82■■□□□ 1.56
USP21-208ENST00000487163 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.82■■□□□ 1.56
USP21-208ENST00000487163 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.81■■□□□ 1.56
USP21-208ENST00000487163 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.81■■□□□ 1.56
USP21-208ENST00000487163 NEUROD1Q13562 356 aa24.79■■□□□ 1.56
USP21-208ENST00000487163 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.78■■□□□ 1.56
USP21-208ENST00000487163 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.77■■□□□ 1.56
USP21-208ENST00000487163 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.76■■□□□ 1.55
USP21-208ENST00000487163 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.76■■□□□ 1.55
USP21-208ENST00000487163 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
USP21-208ENST00000487163 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
USP21-208ENST00000487163 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.71■■□□□ 1.55
USP21-208ENST00000487163 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.71■■□□□ 1.55
USP21-208ENST00000487163 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.7■■□□□ 1.54
USP21-208ENST00000487163 MIER1Q8N108 512 aa24.69■■□□□ 1.54
USP21-208ENST00000487163 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.542e-6■■■□□ 17.4
USP21-208ENST00000487163 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
USP21-208ENST00000487163 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
USP21-208ENST00000487163 FMN1Q68DA7 1419 aa24.63■■□□□ 1.53
USP21-208ENST00000487163 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.61■■□□□ 1.53
USP21-208ENST00000487163 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.61■■□□□ 1.53
USP21-208ENST00000487163 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
USP21-208ENST00000487163 SAMD9Q5K651 1589 aa24.59■■□□□ 1.53
USP21-208ENST00000487163 MAPKBP1O60336 1514 aa24.57■■□□□ 1.52
USP21-208ENST00000487163 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.54■■□□□ 1.52
USP21-208ENST00000487163 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.52■■□□□ 1.52
USP21-208ENST00000487163 PBRM1Q86U86 1689 aa24.5■■□□□ 1.51
USP21-208ENST00000487163 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.5■■□□□ 1.51
USP21-208ENST00000487163 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.47■■□□□ 1.51
USP21-208ENST00000487163 GRIN2BQ13224 1484 aa24.47■■□□□ 1.51
USP21-208ENST00000487163 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.46■■□□□ 1.51
USP21-208ENST00000487163 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.44■■□□□ 1.5
USP21-208ENST00000487163 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
USP21-208ENST00000487163 ADAMTS12P58397 1594 aa24.4■■□□□ 1.5
USP21-208ENST00000487163 NCOA2Q15596 1464 aa24.4■■□□□ 1.5
USP21-208ENST00000487163 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
USP21-208ENST00000487163 IQGAP2Q13576 1575 aa24.37■■□□□ 1.49
USP21-208ENST00000487163 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
USP21-208ENST00000487163 PTPRKQ15262 1439 aa24.36■■□□□ 1.49
USP21-208ENST00000487163 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.34■■□□□ 1.49
USP21-208ENST00000487163 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.34■■□□□ 1.49
USP21-208ENST00000487163 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
USP21-208ENST00000487163 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.32■■□□□ 1.48
USP21-208ENST00000487163 ARID3CA6NKF2 412 aa24.3■■□□□ 1.48
USP21-208ENST00000487163 IFT140Q96RY7 1462 aa24.28■■□□□ 1.48
USP21-208ENST00000487163 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.27■■□□□ 1.48
USP21-208ENST00000487163 WDR62O43379 1518 aa24.27■■□□□ 1.48
USP21-208ENST00000487163 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.26■■□□□ 1.47
USP21-208ENST00000487163 HECW1Q76N89 1606 aa24.25■■□□□ 1.47
USP21-208ENST00000487163 HFM1A2PYH4 1435 aa24.25■■□□□ 1.47
USP21-208ENST00000487163 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.24■■□□□ 1.47
USP21-208ENST00000487163 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
USP21-208ENST00000487163 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
USP21-208ENST00000487163 ARHGEF11O15085 1522 aa24.22■■□□□ 1.47
USP21-208ENST00000487163 ERCC6Q03468 1493 aa24.22■■□□□ 1.47
USP21-208ENST00000487163 NAIPQ13075 1403 aa24.2■■□□□ 1.47
USP21-208ENST00000487163 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.17■■□□□ 1.46
USP21-208ENST00000487163 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
USP21-208ENST00000487163 UACAQ9BZF9 1416 aa24.16■■□□□ 1.46
USP21-208ENST00000487163 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.15■■□□□ 1.46
USP21-208ENST00000487163 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.15■■□□□ 1.46
USP21-208ENST00000487163 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
USP21-208ENST00000487163 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.14■■□□□ 1.45
USP21-208ENST00000487163 DISP1Q96F81 1524 aa24.12■■□□□ 1.45
USP21-208ENST00000487163 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
USP21-208ENST00000487163 GRIN2AQ12879 1464 aa24.12■■□□□ 1.45
USP21-208ENST00000487163 KIAA0556O60303 1618 aa24.11■■□□□ 1.45
USP21-208ENST00000487163 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
USP21-208ENST00000487163 TONSLQ96HA7 1378 aa24.08■■□□□ 1.45
USP21-208ENST00000487163 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
USP21-208ENST00000487163 FBLN2P98095 1184 aa24.07■■□□□ 1.44
USP21-208ENST00000487163 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
USP21-208ENST00000487163 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
USP21-208ENST00000487163 KCNH8Q96L42 1107 aa24.03■■□□□ 1.44
USP21-208ENST00000487163 MIA2Q96PC5 1412 aa24.02■■□□□ 1.44
USP21-208ENST00000487163 KDM6BO15054 1643 aa24.01■■□□□ 1.43
USP21-208ENST00000487163 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24■■□□□ 1.43
USP21-208ENST00000487163 TRIM52Q96A61 297 aa24■■□□□ 1.43
USP21-208ENST00000487163 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.99■■□□□ 1.43
USP21-208ENST00000487163 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
USP21-208ENST00000487163 CEP170Q5SW79 1584 aa23.98■■□□□ 1.43
USP21-208ENST00000487163 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
USP21-208ENST00000487163 SYNJ2O15056 1496 aa23.95■■□□□ 1.42
USP21-208ENST00000487163 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
USP21-208ENST00000487163 AKNAQ7Z591 1439 aa23.93■■□□□ 1.42
USP21-208ENST00000487163 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.92■■□□□ 1.42
USP21-208ENST00000487163 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
USP21-208ENST00000487163 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
USP21-208ENST00000487163 DAPK1P53355 1430 aa23.9■■□□□ 1.42
USP21-208ENST00000487163 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
USP21-208ENST00000487163 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.89■■□□□ 1.42
USP21-208ENST00000487163 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.88■■□□□ 1.41
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