RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469562.1

MFSD2B-204, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 2B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MFSD2B, Length 2,613 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2B-204ENST00000469562 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.75■■□□□ 1.23
MFSD2B-204ENST00000469562 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.75■■□□□ 1.23
MFSD2B-204ENST00000469562 NESP48681 1621 aa22.73■■□□□ 1.23
MFSD2B-204ENST00000469562 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
MFSD2B-204ENST00000469562 TIAM1Q13009 1591 aa22.7■■□□□ 1.22
MFSD2B-204ENST00000469562 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.69■■□□□ 1.22
MFSD2B-204ENST00000469562 TOPBP1Q92547 1522 aa22.68■■□□□ 1.22
MFSD2B-204ENST00000469562 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
MFSD2B-204ENST00000469562 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.64■■□□□ 1.21
MFSD2B-204ENST00000469562 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.63■■□□□ 1.21
MFSD2B-204ENST00000469562 MAP3K1Q13233 1512 aa22.63■■□□□ 1.21
MFSD2B-204ENST00000469562 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.63■■□□□ 1.21
MFSD2B-204ENST00000469562 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
MFSD2B-204ENST00000469562 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.6■■□□□ 1.21
MFSD2B-204ENST00000469562 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.6■■□□□ 1.21
MFSD2B-204ENST00000469562 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
MFSD2B-204ENST00000469562 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.59■■□□□ 1.21
MFSD2B-204ENST00000469562 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
MFSD2B-204ENST00000469562 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
MFSD2B-204ENST00000469562 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.5■■□□□ 1.19
MFSD2B-204ENST00000469562 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
MFSD2B-204ENST00000469562 CUL7Q14999 1698 aa22.49■■□□□ 1.19
MFSD2B-204ENST00000469562 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.49■■□□□ 1.19
MFSD2B-204ENST00000469562 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.47■■□□□ 1.19
MFSD2B-204ENST00000469562 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.47■■□□□ 1.19
MFSD2B-204ENST00000469562 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.46■■□□□ 1.19
MFSD2B-204ENST00000469562 BCANQ96GW7 911 aa22.45■■□□□ 1.18
MFSD2B-204ENST00000469562 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.45■■□□□ 1.18
MFSD2B-204ENST00000469562 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.45■■□□□ 1.18
MFSD2B-204ENST00000469562 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
MFSD2B-204ENST00000469562 MAPKBP1O60336 1514 aa22.43■■□□□ 1.18
MFSD2B-204ENST00000469562 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.42■■□□□ 1.18
MFSD2B-204ENST00000469562 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.39■■□□□ 1.17
MFSD2B-204ENST00000469562 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.172e-6■■■□□ 15.3
MFSD2B-204ENST00000469562 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.38■■□□□ 1.17
MFSD2B-204ENST00000469562 FMN1Q68DA7 1419 aa22.38■■□□□ 1.17
MFSD2B-204ENST00000469562 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.38■■□□□ 1.17
MFSD2B-204ENST00000469562 WDR97A6NE52 1622 aa22.37■■□□□ 1.17
MFSD2B-204ENST00000469562 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.33■■□□□ 1.17
MFSD2B-204ENST00000469562 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.33■■□□□ 1.17
MFSD2B-204ENST00000469562 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.31■■□□□ 1.16
MFSD2B-204ENST00000469562 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.28■■□□□ 1.16
MFSD2B-204ENST00000469562 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.27■■□□□ 1.16
MFSD2B-204ENST00000469562 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
MFSD2B-204ENST00000469562 SAMD9Q5K651 1589 aa22.24■■□□□ 1.15
MFSD2B-204ENST00000469562 GRIN2BQ13224 1484 aa22.19■■□□□ 1.14
MFSD2B-204ENST00000469562 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.19■■□□□ 1.14
MFSD2B-204ENST00000469562 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.19■■□□□ 1.14
MFSD2B-204ENST00000469562 NCOA2Q15596 1464 aa22.18■■□□□ 1.14
MFSD2B-204ENST00000469562 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
MFSD2B-204ENST00000469562 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.17■■□□□ 1.14
MFSD2B-204ENST00000469562 PTPRKQ15262 1439 aa22.17■■□□□ 1.14
MFSD2B-204ENST00000469562 MSH5O43196 834 aa22.16■■□□□ 1.14
MFSD2B-204ENST00000469562 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.15■■□□□ 1.14
MFSD2B-204ENST00000469562 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
MFSD2B-204ENST00000469562 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.14■■□□□ 1.13
MFSD2B-204ENST00000469562 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.13■■□□□ 1.13
MFSD2B-204ENST00000469562 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MFSD2B-204ENST00000469562 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MFSD2B-204ENST00000469562 KCNH8Q96L42 1107 aa22.1■■□□□ 1.13
MFSD2B-204ENST00000469562 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MFSD2B-204ENST00000469562 HFM1A2PYH4 1435 aa22.1■■□□□ 1.13
MFSD2B-204ENST00000469562 ARID3CA6NKF2 412 aa22.09■■□□□ 1.13
MFSD2B-204ENST00000469562 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
MFSD2B-204ENST00000469562 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.09■■□□□ 1.13
MFSD2B-204ENST00000469562 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
MFSD2B-204ENST00000469562 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
MFSD2B-204ENST00000469562 PBRM1Q86U86 1689 aa22.07■■□□□ 1.12
MFSD2B-204ENST00000469562 TONSLQ96HA7 1378 aa22.06■■□□□ 1.12
MFSD2B-204ENST00000469562 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.06■■□□□ 1.12
MFSD2B-204ENST00000469562 UACAQ9BZF9 1416 aa22.06■■□□□ 1.12
MFSD2B-204ENST00000469562 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.05■■□□□ 1.12
MFSD2B-204ENST00000469562 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.05■■□□□ 1.12
MFSD2B-204ENST00000469562 NAIPQ13075 1403 aa22.05■■□□□ 1.12
MFSD2B-204ENST00000469562 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.04■■□□□ 1.12
MFSD2B-204ENST00000469562 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.03■■□□□ 1.12
MFSD2B-204ENST00000469562 IQGAP2Q13576 1575 aa22.03■■□□□ 1.12
MFSD2B-204ENST00000469562 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.03■■□□□ 1.12
MFSD2B-204ENST00000469562 ADAMTS12P58397 1594 aa22■■□□□ 1.11
MFSD2B-204ENST00000469562 HECW1Q76N89 1606 aa21.99■■□□□ 1.11
MFSD2B-204ENST00000469562 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
MFSD2B-204ENST00000469562 ARHGEF11O15085 1522 aa21.97■■□□□ 1.11
MFSD2B-204ENST00000469562 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
MFSD2B-204ENST00000469562 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
MFSD2B-204ENST00000469562 TRIM52Q96A61 297 aa21.95■■□□□ 1.1
MFSD2B-204ENST00000469562 FKBP8Q14318 412 aa21.93■■□□□ 1.1
MFSD2B-204ENST00000469562 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
MFSD2B-204ENST00000469562 WDR62O43379 1518 aa21.89■■□□□ 1.1
MFSD2B-204ENST00000469562 IFT140Q96RY7 1462 aa21.89■■□□□ 1.09
MFSD2B-204ENST00000469562 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
MFSD2B-204ENST00000469562 ANP32CO43423 234 aa21.87■■□□□ 1.09
MFSD2B-204ENST00000469562 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
MFSD2B-204ENST00000469562 MIA2Q96PC5 1412 aa21.84■■□□□ 1.09
MFSD2B-204ENST00000469562 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.82■■□□□ 1.08
MFSD2B-204ENST00000469562 KDM6BO15054 1643 aa21.82■■□□□ 1.08
MFSD2B-204ENST00000469562 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
MFSD2B-204ENST00000469562 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.8■■□□□ 1.08
MFSD2B-204ENST00000469562 DISP1Q96F81 1524 aa21.8■■□□□ 1.08
MFSD2B-204ENST00000469562 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.8■■□□□ 1.08
MFSD2B-204ENST00000469562 FOXD1Q16676 465 aa21.79■■□□□ 1.08
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